MicroUDxTM : un outil de diagnostic rapide qui préviendra les décès et les invalidités dus à des infections courantes (MicroUDxTM)

Les tests effectués dans cette étude seront effectués soit sur des isolats bactériens stockés dans le laboratoire de microbiologie du Centre diagnostique et scientifique de Calgary, soit sur jusqu'à un millilitre d'échantillon d'urine résiduelle soumis au laboratoire de diagnostic avec une demande de culture d'urine et de sensibilité. Toutes les cultures d'urine seront effectuées et rapportées conformément aux protocoles de laboratoire standard. Les tests de recherche ne seront effectués que sur des échantillons résiduels une fois que les échantillons de patients auront été traités ou signalés à des fins cliniques.

Au cours de la première phase de l'étude, des biomarqueurs métaboliques d'uropathogènes seront identifiés par spectrométrie de masse sur des sous-cultures d'isolats congelés du laboratoire de microbiologie diagnostique. Cela comprendra au moins 50 isolats chacun d'uropathogènes comprenant, mais sans s'y limiter, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, les espèces Enterobacter, Proteus mirabilis, les espèces Citrobacter, Staphylococcus aureus, Staphylococcus saprophyticus, Pseudomonas aeruginosa, les espèces Enterococcus et les espèces Candida. Les biomarqueurs qui sont présents dans plus de 95 % des isolats utiliseront ensuite l'analyse de 2 000 cultures d'urine négatives et de 2 000 positives. Les composés qui sont ensuite identifiés comme étant à haut rendement seront sélectionnés pour l'étiquetage au carbone 13 selon les normes de service.

Dans la phase II de l'étude, suite au développement d'un dispositif d'enrichissement en biomarqueurs au CMRF, une analyse d'urine performante du dispositif sera réalisée à l'aide d'un échantillon d'urine résiduelle de 1000 échantillons d'urine négatifs et 2000 échantillons d'urine positifs comme indiqué ci-dessus. Les performances du nouveau dispositif seront évaluées par rapport aux cultures standard et à la chromatographie liquide urinaire-spectrométrie de masse.

Suite à la création d'un dosage sensible et spécifique, une étude prospective sera réalisée au laboratoire de microbiologie diagnostique. 3 000 échantillons soumis à la culture d'urine seront traités en parallèle avec le nouveau dispositif et les procédures de microbiologie standard. La sensibilité, la spécificité et la valeur prédictive de chaque analyte par rapport à la culture standard seront déterminées dans cette partie de l'étude. Les calculs de coût et les caractéristiques de performance, y compris le délai d'exécution du nouveau test, seront comparés à ceux de la procédure de laboratoire standard.