Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

MicroUDxTM: et raskt diagnostisk verktøy som vil forhindre død og funksjonshemming fra vanlige infeksjoner (MicroUDxTM)

31. mai 2022 oppdatert av: Ian Lewis, University of Calgary

Utvikling av en rask og nøyaktig metode for påvisning og mottakelighetstesting av bakterier som forårsaker urinveisinfeksjon ved hjelp av en metabolomisk plattform

Bakgrunn og rasjonell:

Antibiotika er et viktig fundament for moderne medisin. Den globale økningen av antimikrobielle resistente (AMR) organismer er et alvorlig verdenshelseproblem. Med få nye antimikrobielle legemidler i horisonten, er det avgjørende at vi utvikler nye tilnærminger for å forlenge levetiden til våre eksisterende legemidler. AMR er et komplekst problem som drives av en lang rekke faktorer. Mer enn halvparten av antibiotika som foreskrives har ingen medisinsk fordel, og polikliniske besøk for ukompliserte urinveisinfeksjoner (UVI) er en stor bidragsyter til dette problemet. Nyere studier har vist at nesten halvparten av personer som behandles for UVI får feil frontlinjemedisin, og hos 75 % av pasientene er behandlingens varighet upassende. Begrensninger i dagens diagnostiske teknologi gjør det umulig å identifisere UVI-patogener og måle deres antibiotikafølsomhet under de korte polikliniske besøkene som er typiske for de fleste UVI-pasienter. Disse omstendighetene resulterer i upassende bruk av sterkere enn nødvendig eller upassende antimikrobielle midler. Målet med denne studien er å utvikle og evaluere et system som kan oppdage bakterier i urin og finne det beste antibiotikaet på under 4 timer, og dermed muliggjøre en rask diagnose og bruk av det mest hensiktsmessige og kostnadseffektive antimikrobielle middelet for det påviste midlet.

Studieoversikt

Status

Har ikke rekruttert ennå

Forhold

Bakteriell urinveisinfeksjon

Detaljert beskrivelse

Testing utført i denne studien vil bli utført enten på bakterieisolater som er lagret i det mikrobiologiske laboratoriet ved Diagnostic and Scientific Center i Calgary, eller på opptil én milliliter resturinprøve som sendes til diagnoselaboratoriet med forespørsel om urinkultur og sensitivitet. Alle urinkulturer vil bli utført og rapportert i henhold til standard laboratorieprotokoller. Forskningstesting vil bare bli utført på gjenværende prøve når pasientprøver er behandlet eller rapportert for kliniske formål.

I løpet av den første fasen av studien vil metabolske biomarkører for uropatogener bli identifisert ved hjelp av massespektrometri på subkulturer av frosne isolater fra det diagnostiske mikrobiologilaboratoriet. Dette vil inkludere minst 50 isolater hver av uropatogener bestående av, men ikke begrenset til, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter-arter, Proteus mirabilis, Citrobacter-arter, Staphylococcus aureus, Staphylococcus saprophyticus, en Pseudomonas-arter, en Pseudomosater, en Pseudomosater og C. Biomarkører som er tilstede i mer enn 95 % av isolatene vil deretter bruke analysen av 2000 negative og 2000 positive urinkulturer. Forbindelser som senere blir identifisert som høyt utbytte vil bli valgt for karbon 13-merking i henhold til servicestandarder.

I fase II av studien, etter utviklingen av en biomarkøranrikningsenhet ved CMRF, vil en ytelsesurinalyse av enheten bli utført ved bruk av gjenværende urinprøve fra 1000 negative og 2000 positive urinprøver som skissert ovenfor. Ytelsen til den nye enheten vil bli evaluert i forhold til standardkulturer og urinvæskekromatografi-massespektrometri.

Etter opprettelsen av en sensitiv og spesifikk analyse, vil en prospektiv studie bli utført ved det diagnostiske mikrobiologilaboratoriet. 3000 prøver som sendes inn for urinkultur vil bli behandlet parallelt med den nye enheten og standard mikrobiologisprosedyrer. Sensitivitet, spesifisitet og prediktiv verdi for hver analytt sammenlignet med standardkultur vil bli bestemt i denne delen av studien. Kostnadsberegninger og ytelseskarakteristikker, inkludert behandlingstid for den nye analysen, vil bli sammenlignet med den i standard laboratorieprosedyre.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

10000

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Navn: Ian A Lewis, PhD
Telefonnummer: 403-220-4366
E-post: ian.lewis2@ucalgary.ca

Studer Kontakt Backup

Navn: Troy D Feener, MSc
Telefonnummer: 403-870-1201
E-post: tdfeener@ucalgary.ca

Studiesteder

Canada
- Alberta
  - Calgary, Alberta, Canada, T2N 1N4
    - University Of Calgary
    - Ta kontakt med:
      
      Ian A Lewis, PhD
      
      Telefonnummer: 403-220-4366
      
      E-post: ian.lewis2@ucalgary.ca
    - Ta kontakt med:
      
      Troy D Feener, MSc
      
      Telefonnummer: 403-870-1201
      
      E-post: tdfeener@ucalgary.ca

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

Barn
Voksen
Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

N/A

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

De fleste urinprøver samlet i Calgary kommer fra unge friske kvinner med symptomer på blærebetennelse eller pyelonefritt. Imidlertid kan restprøve fra enhver pasient der en urinkultur er bestilt, inkluderes i studien hvis den faller innenfor tiden som restprøver behandles.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

Pasienter som ikke har levert urinprøver vil ikke bli inkludert da prøvene er nødvendige for både standard testing og forskning. Dette vil inkludere pasienter som behandles empirisk av leger.

Ekskluderingskriterier:

Pasienter som ikke har levert urinprøver for dyrking vil ikke bli inkludert i studien.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Antall grupper / kohorter

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
UTI positiv I fase I av studien med testing av resturinprøver er målet å inkludere minst 50 positive prøver fra hver bakterieart som er kjent for å være ofte assosiert med urinveisinfeksjoner. Vi valgte ut 2000 positive uriner for å gjøre det mulig å fange nok av disse organismene i utviklingsprosessen. For fase II av studien samme antall positive prøver for å inkludere alle vanlige arter som forårsaker urinveisinfeksjon. Antall negative prøver inkludert er redusert til 1000. Fase 3 - omtrent en tredjedel av alle urinprøver som sendes inn vil være positive for et uropatogen. Prøvestørrelse på 3000 vi forventer at 1000 disse er kulturpositive. Vi forventer at de fleste uropatogener som forekommer med en frekvens på 5 % eller mer vil bli inkludert med tilstrekkelig antall i valideringsprosessen.
UTI negativ kontroll 2000 negative urinprøver blir kjørt som kontrollert for å sikre at falsk positivitet er lav.

Gruppe / Kohort

UTI positiv

I fase I av studien med testing av resturinprøver er målet å inkludere minst 50 positive prøver fra hver bakterieart som er kjent for å være ofte assosiert med urinveisinfeksjoner. Vi valgte ut 2000 positive uriner for å gjøre det mulig å fange nok av disse organismene i utviklingsprosessen.

For fase II av studien samme antall positive prøver for å inkludere alle vanlige arter som forårsaker urinveisinfeksjon. Antall negative prøver inkludert er redusert til 1000.

Fase 3 - omtrent en tredjedel av alle urinprøver som sendes inn vil være positive for et uropatogen. Prøvestørrelse på 3000 vi forventer at 1000 disse er kulturpositive. Vi forventer at de fleste uropatogener som forekommer med en frekvens på 5 % eller mer vil bli inkludert med tilstrekkelig antall i valideringsprosessen.

UTI negativ kontroll

2000 negative urinprøver blir kjørt som kontrollert for å sikre at falsk positivitet er lav.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
Assay ID-validering Tidsramme: 2 år	I valideringsfasen av studien sensitivitet, spesifisitet og positive og negative prediktive verdier for påvisning av signifikant bakteriuri ved bruk av kultur som gullstandard. Disse verdiene vil bli beregnet for hele kohorten i henhold til standarddefinisjoner ved bruk av statistisk programvare (Analyse-it for Excel) .	2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
Følsomhet - antimikrobiell følsomhet for ny analyse versus standard laboratoriemetoder Tidsramme: 2 år	En sekundær utfallsvariabel vil være påvisning av antimikrobiell følsomhet ved å bruke den nye analysen, vil være beregningen av essensiell og kategorisk samsvar, store, svært store og mindre feil mellom den nye analysen og standard laboratoriemetoder i henhold til standard laboratoriedefinisjoner.	2 år
Omløpstid til bakteriell påvisning og mottakelighet Tidsramme: 2 år	Et annet sekundært resultat vil være turn-around-time (TAT) til bakteriell påvisning og tilgjengelighet av mottakelighetsresultater.	2 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

University of Calgary

Samarbeidspartnere

Alberta Health services

Etterforskere

Hovedetterforsker: Ian A Lewis, PhD, University Of Calgary

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Forventet)

1. august 2022

Primær fullføring (Forventet)

1. august 2023

Studiet fullført (Forventet)

15. oktober 2023

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

10. januar 2020

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene