Des réactifs innovants pour améliorer le diagnostic rapide des infections mycobactériennes (TIKA_TB)

Introduction M. tuberculosis (TB) est un important problème de santé publique au Royaume-Uni et à l'étranger. Au total, 7832 cas ont été signalés au Royaume-Uni en 2013. Parmi ceux qui ont été confirmés par culture (59 %), le taux de résistance aux médicaments était de 7,8 %. Dans certaines populations, l'incidence de la résistance aux médicaments est plus élevée : les patients sans abri, ceux qui ont été en prison et surtout ceux d'Europe de l'Est. En règle générale, le patient suivra un traitement pendant 18 mois ou plus et le PHE a estimé le coût de celui-ci à 50 000 £.

Le diagnostic actuel repose sur la culture de M. tuberculosis et les tests de sensibilité aux médicaments. Cela peut prendre six ou huit semaines, ce qui signifie que les patients peuvent suivre un traitement inefficace pendant un certain temps, entraînant une transmission supplémentaire et une détérioration de l'état clinique du patient. Si la vitesse de culture de l'organisme pouvait être considérablement augmentée, les retards de diagnostic et de mise en route du traitement correct pourraient être réduits. De plus, si le pourcentage de cas confirmés par culture pouvait être augmenté, le patient et le clinicien en bénéficieraient. Souvent, les patients sont mis sous traitement antituberculeux sans un diagnostic confirmé par la culture. D'autres mycobactéries peuvent se faire passer pour une tuberculose, entraînant des retards dans le diagnostic et l'incertitude du traitement avant que le résultat de culture confirmé ne soit disponible.

La tuberculose sera diagnostiquée de la manière habituelle, par analyse de routine des échantillons appropriés, y compris la PCR standard et la culture. Les patients dont on pense qu'ils ont ou dont on a confirmé qu'ils ont la tuberculose seront recrutés pour l'essai.

Les patients seront pris en charge de la manière habituelle selon les protocoles standard de traitement de la tuberculose selon les directives du médecin traitant.

Actuellement le diagnostic de la tuberculose est un processus long nécessitant plusieurs semaines de culture de l'organisme. L'identification d'un test plus rapide ou plus facile qui pourrait être effectué sur des échantillons aurait de grands avantages pour les futurs patients. Les enquêteurs de cette recherche cherchent à voir si cette méthode de culture différente augmentera considérablement la vitesse de diagnostic.

Objectif principal Pour quantifier la vitesse de la nouvelle méthode de culture et comparer avec les systèmes conventionnels.

Il s'agit d'une étude observationnelle et aucune intervention supplémentaire ne sera effectuée.

Méthodes

Au moins 200 échantillons d'expectoration obtenus de patients éligibles inscrits en double :

1. L'échantillon de routine sera étiqueté et traité par le service local de microbiologie médicale du NHS Trust en utilisant des méthodes conventionnelles et des SOP validées, comme d'habitude.
2. L'échantillon de test sera anonymisé et traité aussi rapidement que possible dans un laboratoire de recherche de catégorie III séparé à SGUL par un personnel de recherche qualifié. Cela extraira les mycobactéries de l'échantillon qui sera ensuite inoculé dans un nouveau milieu complété par des additifs de croissance (TiKa Medium) . Chaque échantillon de test sera ensuite attribué au hasard à l'un des trois différents systèmes de flacons de culture disponibles dans le commerce (MGIT, BacTAlert, VersaTrek) et traité comme habituellement recommandé par le fabricant jusqu'à 42 jours. Le temps de positivité (TTP) sera enregistré et l'identité de la culture en croissance vérifiée à l'aide de la méthodologie conventionnelle (sonde moléculaire).

Les valeurs TTP seront rassemblées dans une base de données. À la fin de l'étude, cette base de données sera comparée aux données rétrospectives des résultats de culture mycobactérienne de routine déterminés à partir des échantillons parallèles originaux.

L'analyse des données déterminera le degré d'amélioration (tel que déterminé en jours jusqu'à la positivité) apporté par chaque méthode et testera l'hypothèse selon laquelle le milieu TiKa peut significativement (P<0,05) améliorer la récupération des phénotypes non cultivables et faire croître les phénotypes cultivables de mycobactéries pathogènes plus rapidement à partir d'échantillons cliniques que précédemment observés.

Il n'y aura aucune exception (dérogation) aux critères d'éligibilité avant l'inclusion du participant dans l'étude. Toute question soulevée au sujet de l'admissibilité doit être traitée avant d'inscrire le participant.

Critères d'inclusion : Tout patient avec une tuberculose possible ou diagnostiquée qui est capable de donner un consentement éclairé se verra proposer d'être inclus dans l'essai.

Critères d'exclusion : Tout patient de moins de 18 ans ou incapable de donner un consentement éclairé sera exclu de cet essai. Toute personne détenue ne sera pas incluse. Tout patient incapable de donner un échantillon.

Tout patient peut se retirer de l'étude à tout moment. Tous les patients perdus de vue seront contactés et des tentatives seront faites pour les réengager avec les services, comme c'est la pratique standard pour les patients atteints de tuberculose.

Le recrutement des participants sur un site ne commencera qu'une fois que la preuve de l'approbation/des documents essentiels suivants sera en place :

1. L'approbation principale du REC, le cas échéant
2. Parrainage final et approbation du site hôte,

Tous les participants qui souhaitent participer à l'étude seront entièrement sélectionnés et consentis par l'investigateur en chef, ou l'un des cliniciens qualifiés impliqués dans l'étude en tant que co-investigateur clinique.

Les patients seront approchés par l'équipe clinique de routine et on leur demandera s'ils seraient intéressés. S'ils manifestent un intérêt, l'un des chercheurs les contactera.

Le consentement sera pris par un membre de l'équipe de recherche qui a de l'expérience, une formation et des qualifications en bonnes pratiques cliniques autour de la prise de consentement.

Une copie du formulaire de consentement éclairé (ICF) signé ainsi qu'une copie de la fiche d'information du patient (PIS) seront remises au participant à l'étude. Un formulaire de consentement original signé et daté sera conservé dans les notes médicales et une copie sera placée dans l'ISF.

Lors de l'inscription, les données seront collectées sous une forme pseudo-anonymisée conformément au protocole.

Toutes les données seront traitées conformément à la loi sur la protection des données de 1998. Les formulaires de rapport de cas (CRF) ne porteront pas le nom du participant ou d'autres données directement identifiables. Seul le numéro d'identification (ID) du participant sera utilisé à des fins d'identification. Le journal d'ID de sujet du sponsor JREOLOG0002 peut être utilisé pour croiser les informations identifiables du participant.

Les formulaires de rapport de cas seront conçus par l'IC et la version finale sera approuvée par le commanditaire. Toutes les données seront saisies lisiblement à l'encre noire avec un stylo à bille conformément aux BPC.

La durée d'archivage convenue pour cet essai sera de 5 ans. Cela inclura toutes les bases de données d'étude.

Le nombre de patients à inscrire dans l'étude a été calculé à l'aide d'un calcul de puissance standard basé sur des données expérimentales antérieures suggérant qu'une taille d'effet de> 0,3 serait réalisable dans l'écart type attendu en utilisant ce protocole avec une probabilité d'erreur de 0,05. Cela estimerait qu'une puissance de 0,95 serait inférieure de 20 % au nombre d'échantillons censés être collectés.

Critère d'évaluation principal : pour montrer la différence statistique (P<0,05) entre les données TTP de l'échantillon du groupe de test et de routine.

Plan d'analyse statistique : Synthèse des données de base et flux de patients. Les chercheurs proposent d'inscrire 200 patients sur une période de 9 mois. Le site de recherche est un centre d'excellence et de référence pour la tuberculose et les chercheurs comptent bien atteindre ce nombre de participants. Il n'y a pas de traitement différentiel des patients impliqué dans cette étude et il ne sera pas nécessaire de randomiser les patients au sein de l'étude.

Cependant, les échantillons de test seront randomisés après le traitement pour être inclus dans chacune des trois machines de culture (bras) à l'aide d'un tableau généré par un nombre aléatoire (n = 3) limité pour fournir des nombres égaux à chaque bras de test.

Cette étude est entièrement financée par le financement d'Innovate UK