Nouveaux gènes impliqués dans l'étiologie moléculaire du syndrome de Rett grâce à l'hybridation génomique comparative sur puce à ADN (RETT)
Recherche de nouveaux gènes impliqués dans l'étiologie moléculaire du syndrome de Rett par hybridation génomique comparative sur puces à ADN
Le syndrome de Rett (RTT) est une encéphalopathie génétique et la forme typique est causée par des mutations du gène MECP2. C'est une pathologie génétiquement hétérogène. CDKL5 et FOXG1 ont été récemment découverts comme étant impliqués dans d'autres formes de RTT. Cependant, au moins 5% des formes typiques et plus d'autres formes atypiques ne sont liées à aucun des 3 gènes connus pour être impliqués dans la maladie.
Le but de cette étude est d'identifier de nouveaux gènes impliqués dans l'étiologie moléculaire des formes typiques et atypiques de RTT.
Aperçu de l'étude
Description détaillée
La recherche d'un déséquilibre chromosomique pathogène par hybridation génomique comparative (aCGH) sur puces à ADN sera effectuée dans un groupe de patients présentant des formes typiques ou atypiques de RTT sans mutations connues des gènes MECP2, CDKL5 et FOXG1B.
Après confirmation du déséquilibre par qPCR, le potentiel pathogène de l'aneusomye segmentaire sera attribué selon l'interprétation des bases de données DECEPHER, BACH et GVD dédiées à la technique aCGH. L'analyse des parents permettra de distinguer les variants polymorphes hérités des nouveaux déséquilibres potentiellement délétères.
En cas de nouveau déséquilibre, une approche bioinformatique recherchera des gènes candidats qui seront éventuellement confirmés par un dépistage classique des mutations (séquençage et PCR) dans tous les cas typiques et atypiques de RTT présents dans la cohorte.
L'identification de nouveaux gènes impliqués dans le RTT permettra d'améliorer le diagnostic moléculaire de la maladie et le conseil génétique aux familles. Ce projet permettra de progresser dans la compréhension des mécanismes physiopathologiques des anomalies du développement cérébral
Type d'étude
Inscription (Réel)
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Besançon, France
- Handicaps de l'Enfant - Pavillon Ste Marie, CHU St Jacques
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Besançon, France
- Service de Neuropédiatrie, Hôpital St Jacques, CHU de Besançon
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Caen, France
- Unité de génétique, Groupe hospitalier Hôpital Flaubert
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Dijon, France
- Centre de Génétique Hôpital d'Enfants, CHU de Dijon
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Montpellier, France
- Service de neuropédiatrie, CHU Hôpital Gui de Chauliac
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Nice, France
- Laboratoire de Génétique chromosomique, CHU Hôpital l'Archet 2
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Nice, France
- Service de génétique médicale, CHU Hôpital Purpan
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Toulouse, France
- Service de génétique médicale, CHU Hôpital Purpan, CHU de Toulouse
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Vandoeuvre les Nancy, France
- Laboratoire de Génétique, Hôpitaux de Brabois, CHU de Nancy
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-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- ADULTE
- OLDER_ADULT
- ENFANT
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
La description
Critère d'intégration:
- Patients : syndrome de RETT
- Patients : femmes
- Parents : parent d'un patient
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: SCIENCE BASIQUE
- Répartition: NON_RANDOMIZED
- Modèle interventionnel: SINGLE_GROUP
- Masquage: AUCUN
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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EXPÉRIMENTAL: Patient RTT
Prise de sang
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Chez l'enfant : 2 tubes EDTA de 7 ml, 1 tube Héparine Li de 5 ml et 2 tubes PAXgene de 2,5 ml (max 0,8-0,9
ml sang/kg) Chez les parents : 2 tubes EDTA de 7 ml, 1 tube Héparine Li de 5 ml.
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EXPÉRIMENTAL: Parents
Prise de sang.
Faire la distinction entre les variantes polymorphes héritées et les nouveaux déséquilibres potentiellement délétères.
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Chez l'enfant : 2 tubes EDTA de 7 ml, 1 tube Héparine Li de 5 ml et 2 tubes PAXgene de 2,5 ml (max 0,8-0,9
ml sang/kg) Chez les parents : 2 tubes EDTA de 7 ml, 1 tube Héparine Li de 5 ml.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Analyse des déséquilibres chromosomiques par hybridation génomique comparative sur puces à ADN
Délai: jusqu'à 12 mois
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Recherche de déséquilibre chromosomique pathogène
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jusqu'à 12 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Christophe PHILIPPE,, Laboratoire de Génétique Médicale, Rue du Morvan, 54511 Vandoeuvre-Les-Nancy Cédex
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude
Achèvement primaire (RÉEL)
Achèvement de l'étude (RÉEL)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (ESTIMATION)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (ESTIMATION)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Processus pathologiques
- Maladies du système nerveux
- Manifestations neurologiques
- Manifestations neurocomportementales
- Maladie
- Maladies génétiques, innées
- Maladies génétiques liées à l'X
- Retard mental lié à l'X
- Déficience intellectuelle
- Troubles hérédodégénératifs, système nerveux
- Syndrome
- Syndrome de Rett
Autres numéros d'identification d'étude
- 2009-A01147-50
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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