Précision diagnostique d'un panel de marqueurs génétiques bactériens (M3) pour la néoplasie colorectale avancée (M3-PRO)

Le cancer colorectal (CRC) est l'un des cancers les plus répandus à Hong Kong avec plus de 5 500 nouveaux cas par an. Il existe des preuves prédominantes d'une tendance à la hausse du CCR à début précoce dans le monde. La détection et la résection précoces des néoplasies colorectales prémalignes ont montré qu'elles réduisaient la mortalité liée au CCR.

Les tests de selles non invasifs, y compris les tests de recherche de sang occulte dans les selles à base de gaïac (RSOSg) et les tests immunochimiques fécaux (FIT) sont les pierres angulaires des programmes de dépistage du CCR basés sur la population. La principale limite de cette stratégie largement utilisée est sa sensibilité insatisfaisante pour le CCR (79 %) et les adénomes avancés (AA ; 40 %). La sensibilité pour les adénomes non avancés est même inférieure à 10 %. Une grande partie des adénomes avancés et non avancés seront manqués par le TIF seul. Par conséquent, l'identification d'un test alternatif non invasif avec une meilleure sensibilité pour détecter la néoplasie colorectale est justifiée.

Le test ADN multicible dans les selles et les marqueurs ADN microbiens fécaux semblent être des options prometteuses pour le dépistage du CCR. Plusieurs marqueurs de gènes bactériens ont été identifiés par séquençage du métagénome et signalés comme étant associés au CCR, notamment Fusobacterium nucleatum (Fn), Clostridium hathewayi (Ch) et Bacteroides clarus (Bc). Cependant, ces marqueurs moléculaires avaient une faible précision pour distinguer les adénomes des tissus normaux. Récemment, un nouveau marqueur du gène Lachnoclostridium (appelé « m3 ») s'est avéré avoir un rendement diagnostique élevé pour la détection des adénomes colorectaux. Dans une étude cas-témoin de 1012 sujets, une tendance linéaire à la hausse du niveau de m3 a été observée à partir d'échantillons fécaux de sujets sains jusqu'à ceux atteints d'adénomes et de cancers. La sensibilité globale de m3 était significativement plus élevée que celle de FIT pour détecter tous les adénomes (48 % contre 9,3 %), les AA (50,8 % contre 16,1 %) et les adénomes non avancés (44,2 % contre 0 %). La précision diagnostique de m3 pourrait être encore améliorée en combinant avec un panel de marqueurs microbiens fécaux composés de Fusobacterium nucleatum (Fn), Bacteroides clarus (Bc), Clostridium hathewayi (Ch) pour le CCR (82,3 %) et les adénomes (64,2 %). Nous avons émis l'hypothèse que la combinaison de ces 4 marqueurs de gènes bactériens (connus sous le nom de M3) est plus sensible que le FIT dans la détection des néoplasies colorectales avancées.