Diagnostisk nøyaktighet av et panel av bakterielle genmarkører (M3) for kolorektal avansert neoplasi (M3-PRO)

Kolorektal kreft (CRC) er en av de vanligste kreftformene i Hong Kong med mer enn 5500 nye tilfeller årlig. Det er rådende bevis på økende trend med ung debut CRC globalt. Tidlig påvisning og reseksjon av pre-malign kolorektal neoplasi har vist seg å redusere CRC-relatert dødelighet.

Ikke-invasive avføringstester inkludert guaiac-baserte fekale okkulte blodprøver (gFOBT) og fekale immunokjemiske tester (FIT) er hjørnesteinene i populasjonsbaserte CRC-screeningprogrammer. Den største begrensningen ved denne mye brukte strategien er dens utilfredsstillende sensitivitet for CRC (79 %) og avanserte adenomer (AA; 40 %). Sensitiviteten for ikke-avanserte adenomer er enda lavere enn 10 %. En stor andel av avanserte og ikke-avanserte adenomer vil bli savnet av FIT alene. Derfor er identifisering av alternativ ikke-invasiv test med bedre følsomhet for å oppdage kolorektal neoplasi nødvendig.

Multitarget avføring DNA-test og fekale mikrobielle DNA-markører ser ut til å være lovende alternativer for CRC-screening. Flere bakterielle genmarkører har blitt identifisert ved metagenomsekvensering og rapportert å være assosiert med CRC, inkludert Fusobacterium nucleatum (Fn), Clostridium hathewayi (Ch) og Bacteroides clarus (Bc). Imidlertid hadde disse molekylære markørene lav nøyaktighet i å skille adenomer fra normalt vev. Nylig har en ny Lachnoclostridium-genmarkør (merket som 'm3') vist seg å ha høyt diagnostisk utbytte for påvisning av kolorektale adenomer. I en kasuskontrollstudie av 1012 forsøkspersoner ble det observert en lineær økende trend av m3-nivå fra fekale prøver fra friske forsøkspersoner til de med adenomer og kreft. Den generelle sensitiviteten til m3 var signifikant høyere enn FIT ved påvisning av alle adenomer (48 % vs 9,3 %), AA (50,8 % vs 16,1 %) og ikke-avanserte adenomer (44,2 % vs 0 %). Den diagnostiske nøyaktigheten til m3 kan forbedres ytterligere ved å kombinere med et panel av fekale mikrobielle markører som består av Fusobacterium nucleatum (Fn), Bacteroides clarus (Bc), Clostridium hathewayi (Ch) for CRC (82,3 %) og adenomer (64,2 %). Vi antok at kombinasjonen av disse 4 bakterielle genmarkørene (kjent som M3) er mer følsom enn FIT for å oppdage kolorektal avansert neoplasi.