Étude de la distribution du système de détection du quorum du régulateur de gène accessoire (Agr) et de la prévalence de la résistance au linézolide et à la mupirocine chez Staphylococcus Aureus producteur/non producteur de biofilm dans les hôpitaux universitaires de Sohag

Staphylococcus aureus est un agent pathogène important responsable d'un large spectre d'infections. L'organisme colonise généralement la peau et les muqueuses des humains et de plusieurs espèces animales. Plusieurs sites corporels peuvent être colonisés chez l'homme, cependant, les narines antérieures du nez sont le site de transport le plus fréquent de S. aureus. Les autres sites de transport comprennent la peau, le périnée et le pharynx. Il a été démontré qu'il existe une prévalence accrue des infections à staphylocoques, qui peut être attribuée à leur portage dans les narines antérieures et dans les mains des agents de santé et des patients.

Les mécanismes pathogènes permettant à S. aureus de provoquer des infections graves pourraient inclure : le biofilm qui protège les organismes de la réponse immunitaire de l'hôte ; opsonophagocytose et agents antimicrobiens, conduisant ainsi à des infections chroniques et persistantes.

La résistance aux antibiotiques associée aux infections à S.aureus constitue une grande préoccupation pour les cliniciens afin de prévenir la propagation des infections. La méthicilline était couramment utilisée pour ces infections avant l'émergence du SARM, qui se développe en raison de l'utilisation irrationnelle d'antibiotiques, d'un séjour prolongé à l'hôpital, du port nasal et manuel du personnel de santé. La vancomycine, le linézolide et la mupirocine sont également utilisées dans le traitement des infections, ainsi que dans la décolonisation des porteurs.

La mupirocine agit en inhibant la synthèse protéique des bactéries en se liant spécifiquement à l'enzyme isoleucyl-ARNt synthétase. L'utilisation irrationnelle de la mupirocine chez les patients et son transport chez le personnel soignant ont conduit à l'émergence d'une résistance à cet antibiotique. .

MupA, gène à médiation plasmidique, joue un grand rôle dans la résistance à la mupirocine car il possède une isoleucyltRNAsynthetase supplémentaire modifiée qui conduit à un niveau élevé de résistance à la mupirocine. Le gène mupA a la capacité de faciliter et de diffuser le mécanisme de résistance selon différents modèles.

Le linézolide, le premier médicament xazolidinone, a été lancé en 2001 et présente toujours une excellente activité in vitro contre Staphylococcus epidermidis à l'échelle mondiale, bien que des épidémies de S. epidermidis résistant au linézolide (LRSE) soient occasionnellement signalées.

La résistance au linézolide est médiée par des mutations dans le gène de l'ARNr 23S, modifiant le site de liaison au médicament, et/ou par les protéines ribosomales 50S L3, L4 et L22, altérant la liaison du linézolide ;,Ou par l'acquisition des gènes cfr principalement codés par les plasmides, codant pour un méthyltransférase, ou optrA, codant pour un transporteur ABC, ou les homologues cfr cfr(B) et cfr(C).

Alors que le cfr peut médier le phénotype PhLOPSA (résistance aux phénocols, aux lincosamides, aux oxazolidinones, aux pleuromutilines et aux composés streptogramine A), optrA confère uniquement une résistance à l'oxazolidinone et au phénicol.

La pathogénicité de S. aureus est régulée par divers facteurs, l'un d'eux étant le système de régulation des gènes accessoires (agr). Il est constitué de 2 loci (3 kb) transcrits de manière divergente contrôlés au moyen de 2 promoteurs P2 et P3. La plupart des isolats cliniques d'infections aiguës possèdent un système agr fonctionnel et tous, comme les souches, produisent de l'ARNIII in vitro et in vivo.

La carence en Agr a été associée à une formation accrue de biofilm, car l'ARNIII réduit l'expression des adhésines de surface et augmente la production de capsules, de toxines et de protéases. Le système agr est censé réguler plus de 70 gènes, dont 23 sont des facteurs de virulence reconnus.

Il existe 2 classes de facteurs de virulence régulés par agr. La première classe comprend des facteurs de virulence impliqués dans l'attachement à l'hôte et l'évasion immunitaire, tandis que la seconde classe contient des gènes impliqués dans la production d'exoprotéines liées à l'invasion et à la production de toxines. L'activation du système agr fait passer la bactérie d'un commensal adhésif et colonisateur à un agent pathogène invasif et agressif (Roux A et al; 2009).

Les principaux facteurs de virulence de S. aureus, les toxines exfoliatives (ET), la toxine du syndrome de choc toxique (TSST-1) et les entérotoxines staphylococciques (SE) sont impliquées dans la colonisation de l'hôte, l'invasion de la peau et du mucus endommagés, l'infection gastro-intestinale et la prévarication de l'hôte. mécanismes de défense. En effet, l'opéron agr comprenant les gènes agrA, agrB, agrC et agrD régulent plus de 70 gènes chez S. aureus, dont 23 contrôlent son pouvoir pathogène et ses infections invasives.

De plus, S. aureus peut être stratifié en 4 groupes différents (agr I, agr II, agr III et agr IV) selon les séquences des gènes agrC (peptide auto-inducteur) et agrD (AIP cyclique). Il est indiqué que les types d'agriculture sont différents dans leurs propriétés et leur prévalence dans diverses zones géographiques. Ainsi, l'identification des types prédominants dans chaque région pourrait bien être fonctionnelle.