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Microbiome Alterations in IL10RA-deficient Patients After HSCT

10 agosto 2020 aggiornato da: Ying HUANG, Children's Hospital of Fudan University

Longitudinal Development of Intestinal Microbiome in IL10RA-deficient Patients After Hematopoietic Stem Cell Transplantation

To elucidate the longitudinal development of intestinal microbiota in patients with IL10RA deficiency after hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). The investigators planned to collect fecal samples from IL10RA-deficient patients who received HSCT. Samples were collected more than once every three days after engraftment in lamina flow ward and at least once a week before discharge. Microbial DNA was extracted from the fecal samples. And all analysis was based on the next generation sequencing data.

Panoramica dello studio

Stato

Terminato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Hematopoietic stem cell transplantation is considered the only curative therapy for patients with interleukin-10 receptor-A(IL10RA) deficiency. The investigators aimed to collect the fecal samples of these patients throughout the conditioning, transplantation until discharge, providing a dense insight into the longitudinal development of intestinal microbiota.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

13

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

    • Shanghai
      • Shanghai, Shanghai, Cina, 201102
        • Children's Hospital of Fudan University

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 1 giorno a 6 anni (Bambino)

Accetta volontari sani

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Patients who were diagnosed with IL10RA deficiency and who received the hematopoietic stem cell transplantation in a tertiary hospital were enrolled.

Descrizione

Inclusion Criteria:

  • IL10RA gene mutations;
  • Eligible for hematopoietic stem cell transplantation.

Exclusion Criteria:

  • Unwilling to participate.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
HSCT cohort
IL10RA-deficient patients who received hematopoietic stem cell transplantation
  1. Reduced intensity conditioning(RIC) chemotherapy regimen before transplantation
  2. All patients were cared for in single rooms ventilated with a highly effective particulate air filtration system. All patients received intravenous immunoglobulin and antimicrobial prophylaxis, which included antiviral, antifungal, and Pneumocystis jirovecii prophylaxis with ganciclovir and micafungin, as per routine clinical practice before transplantation.
  3. Umbilical cord blood transplantation

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Shannon indices
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Shannon index is a popular diversity index in the ecological literature; minimum score is zero, higher values represent a better outcome
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Simpson indices
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Simpson index in ecology is to measure the degree of concentration when individuals are classified into types; scale ranges [0,1]; lower values represent a better outcome
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
relative abundance of Proteobacteria
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the microbiome at the phylum level
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
relative abundance of Firmicutes
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the microbiome at the phylum level
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Clostridium sensus_stricto_1
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the microbiome at the genus level
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Escherichia - Shigella
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the microbiome at the genus level
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
chimerism
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
The level of chimerism of each patient will be reported as percentages [0,100%]
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
manifestation of graft-versus-host disease
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the graft-versus-host disease happened to each patient
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Sobs indices
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the the observed richness of each sample
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Chao1 estimator
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the operational taxonomic unit(OTU) numbers of each sample
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
neutrophil cell count
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
blood test results
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
platelet count
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
blood test results
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient

Altre misure di risultato

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
relative abundance of Clostridiales
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
describe the microbiome at the order level
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Shannoneven indices
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
measure the community evenness, scale ranges [0,1]; higher values represent a better outcome
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
Simpsoneven indices
Lasso di tempo: during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient
measure community evenness, scale ranges [0,1]; higher values represent a better outcome
during the hospitalization of each eligible patient, an average of 90 days per patient

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Investigatori

  • Investigatore principale: Ying Huang, MD, Children's Hospital of Fudan University

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 ottobre 2017

Completamento primario (Effettivo)

28 febbraio 2020

Completamento dello studio (Effettivo)

28 febbraio 2020

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

19 novembre 2018

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

21 novembre 2018

Primo Inserito (Effettivo)

26 novembre 2018

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

12 agosto 2020

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

10 agosto 2020

Ultimo verificato

1 agosto 2020

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • HSCT microbiomte

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

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