La trasmissione dell'HIV nell'era del potenziamento della terapia antiretrovirale in Etiopia (THESA)

Contesto Le persone con soppressione virale incompleta durante la terapia antiretrovirale (ART) possono ospitare virus resistenti ai farmaci, che hanno capacità di trasmissione successiva. Ipotizziamo che gli individui con esposizione precedente o attuale all'ART contribuiscano alla trasmissione dell'HIV e che ciò includa la trasmissione di virus resistenti ai farmaci. Questa ipotesi è indirizzata dall'uso dell'analisi epidemiologica molecolare delle sequenze virali di persone con nuova diagnosi di HIV e di quelle con replicazione virale in corso durante l'ART, combinate con dati sul comportamento a rischio di trasmissione. Inoltre, sulla base dei nostri risultati sopra descritti, in questa analisi includeremo dati sulle condizioni socio-demografiche.

La possibilità di ottenere la soppressione virale dopo la modifica del trattamento per le persone con viremia rilevabile durante l'ART è spesso compromessa dalla presenza di mutazioni farmaco-resistenti, problemi di aderenza o fornitura irregolare di farmaci. Esistono dati limitati sull'efficacia di dolutegravir (attualmente raccomandato come parte dei regimi ART di 1a e 2a linea nell'Africa sub-sahariana) come componente dei regimi ART in contesti a basso reddito. Ipotizziamo che le persone con soppressione virale incompleta durante una precedente ART siano a maggior rischio di insorgenza di mutazioni farmaco-resistenti durante il trattamento a base di dolutegravir, comprese le mutazioni che conferiscono resistenza a dolutegravir. Esploreremo questa ipotesi con il sequenziamento profondo dell'HIV RNA rilevato durante il follow-up longitudinale, con particolare riguardo alla precedente esperienza ART.

Metodi I partecipanti saranno reclutati e seguiti presso strutture sanitarie pubbliche (ospedali e centri sanitari) nella città di Adama e nell'area circostante (popolazione >600.000 abitanti), situate lungo la principale autostrada di trasporto in Etiopia. La prevalenza dell'HIV in quest'area è notevolmente superiore alla media nazionale (9,3% tra le donne incinte).

Due categorie di uomini e donne sieropositivi di età >16 anni possono essere incluse se vengono soddisfatti i criteri specifici per le diverse categorie (spiegati di seguito) e viene fornito il consenso informato scritto.

io. Persone di nuova diagnosi; reclutati in relazione al test HIV e/o alla prima presentazione in cura, senza esposizione attuale o precedente all'ART.

ii. Pazienti con esposizione attuale o precedente all'ART; identificati e reclutati presso le cliniche ART. In queste cliniche, tutti i destinatari di ART vengono testati annualmente per la carica virale (VL; secondo le linee guida nazionali). Saranno inclusi tutti i pazienti con viremia rilevabile, con selezione di controlli con soppressione virale dalla stessa coorte.

Saranno incluse circa 800 persone di nuova diagnosi e 1600 destinatari di ART (numero totale stimato di partecipanti circa 2400 individui). Le indagini di studio saranno eseguite da infermieri di ricerca impiegati a progetto. Tutti i partecipanti idonei riceveranno informazioni orali e scritte sullo studio. Il tracciamento sarà effettuato da traccianti dedicati. I dati della fonte dello studio saranno conservati presso la rispettiva struttura sanitaria. Sarà codificato e registrato continuamente in un database REDCAP dal personale impiegato a progetto.

I partecipanti saranno intervistati seguendo questionari strutturati che coprono dettagli demografici, socio-economici, comportamentali e medici, nonché dettagli sui test HIV e ART. Per i pazienti con storia di cura dell'HIV precedente e/o attuale, verranno recuperati i precedenti risultati dei test delle cellule VL e CD4. Verrà eseguito un esame fisico. Gli individui con sintomi e/o segni di malattia acuta o cronica saranno ulteriormente studiati, a seconda della presentazione clinica. Le decisioni sul regime ART saranno prese seguendo le linee guida etiopi.

Verranno ottenuti campioni di sangue venoso in relazione all'inclusione, per VL, cellule CD4 ed emocromo completo, sierologia per sifilide, epatite B e C. Inoltre, verranno ottenuti campioni di espettorato da tutti i partecipanti (indipendentemente dalle manifestazioni cliniche) per i test batteriologici per Mycobacterium tuberculosis (incluse colture liquide e GeneXpert PCR). I campioni di feci saranno analizzati al microscopio per il rilevamento di vermi e parassiti intestinali. Verranno eseguite indagini per altre infezioni opportunistiche a seconda della presentazione clinica. Aliquote di plasma saranno conservate a -80° C.

I partecipanti saranno seguiti per 2 anni dopo l'inclusione, con visite di studio a intervalli di 3 mesi durante il primo anno ea intervalli di 6 mesi durante il secondo anno. In tutte le visite, i partecipanti saranno intervistati ed esaminati, con ripetuti prelievi di sangue per il test della conta delle cellule VL e CD4 e la conservazione del plasma come descritto sopra.

Analisi Per la caratterizzazione dei modelli di trasmissione dell'HIV, i dati delle analisi filogenetiche delle sequenze virali saranno correlati alla presenza di mutazioni farmaco-resistenti e alle caratteristiche socio-demografiche. I campioni con VL rilevabile (>150 copie/ml) saranno sottoposti ad amplificazione PCR dell'intera regione della proteasi-polimerasi (contenente le tre regioni principali associate alla resistenza ai farmaci; le regioni della proteasi, della polimerasi e dell'integrasi), seguita dal sequenziamento mediante metodica di 3a generazione tecnologia di sequenziamento. Queste sequenze saranno utilizzate per l'analisi filogenetica e per la determinazione del sottotipo di HIV, delle forme ricombinanti e della presenza di mutazioni farmaco-resistenti. Per un'ulteriore caratterizzazione delle dinamiche di trasmissione dell'HIV, verranno eseguiti test di avidità su campioni di individui di nuova diagnosi, al fine di stimare la durata dell'infezione da HIV e identificare le persone con infezione da HIV di recente acquisizione.

Per l'analisi dei risultati del trattamento, i partecipanti saranno seguiti per 2 anni dopo l'inclusione. Tutti i campioni con VL rilevabile ottenuti >3 mesi dopo l'inclusione saranno sottoposti a sequenziamento per il rilevamento di mutazioni farmaco-resistenti. I tassi di soppressione virale (definiti come VL