Přenos HIV v éře rozšiřování antiretrovirové terapie v Etiopii (THESA)

Pozadí Osoby s neúplnou virovou supresí během antiretrovirové terapie (ART) mohou přechovávat viry rezistentní vůči lékům, které mají kapacitu pro další přenos. Předpokládáme, že jedinci s předchozí nebo současnou expozicí ART přispívají k přenosu HIV, a že to zahrnuje přenos virů odolných vůči lékům. Tato hypotéza je řešena použitím molekulární epidemiologické analýzy virových sekvencí od osob nově diagnostikovaných s HIV a osob s probíhající virovou replikací během ART, v kombinaci s údaji o rizikovém chování přenosu. Na základě výše popsaných zjištění navíc do této analýzy zahrneme údaje o sociodemografických podmínkách.

Šance na dosažení virové suprese po modifikaci léčby u osob s detekovatelnou virémií během ART je často ohrožena přítomností mutací rezistentních vůči lékům, problémy s adherencí nebo nepravidelným přísunem léků. K dispozici jsou omezené údaje o účinnosti dolutegraviru (v současnosti doporučovaného jako součást ART režimů 1. a 2. linie v subsaharské Africe) jako součásti režimů ART v prostředí s nízkými příjmy. Předpokládáme, že osoby s neúplnou virovou supresí během předchozí ART jsou vystaveny zvýšenému riziku vzniku mutací lékové rezistence během léčby založené na dolutegraviru, včetně mutací udělujících rezistenci na dolutegravir. Tuto hypotézu prozkoumáme pomocí hlubokého sekvenování HIV RNA detekované během longitudinálního sledování se zvláštním ohledem na předchozí zkušenosti s ART.

Metody Účastníci budou nabíráni a sledováni ve veřejných zdravotnických zařízeních (nemocnice a zdravotní střediska) ve městě Adama a okolí (populace > 600 000 obyvatel), které se nacházejí podél hlavní dopravní dálnice v Etiopii. Prevalence HIV v této oblasti je výrazně vyšší než celostátní průměr (9,3 % mezi těhotnými ženami).

Dvě kategorie HIV pozitivních mužů a žen ve věku >16 let jsou způsobilé k zařazení, pokud jsou splněna specifická kritéria pro různé kategorie (vysvětlena níže) a je poskytnut písemný informovaný souhlas.

i. Nově diagnostikované osoby; rekrutováni v souvislosti s testováním na HIV a/nebo prvním předvedením do péče bez současného nebo předchozího vystavení ART.

ii. Pacienti se současnou nebo předchozí expozicí ART; identifikované a rekrutované na klinikách ART. Na těchto klinikách jsou všichni příjemci ART každoročně testováni na virovou zátěž (VL; podle národních doporučení). Budou zahrnuti všichni pacienti s detekovatelnou virémií, s výběrem kontrol s virovou supresí ze stejné kohorty.

Bude zahrnuto cca 800 nově diagnostikovaných osob a 1600 příjemců ART (celkový odhadovaný počet účastníků cca 2400 osob). Studijní šetření budou provádět projektově zaměstnané výzkumné sestry. Všichni způsobilí účastníci obdrží ústní a písemné informace o studii. Sledování bude prováděno specializovanými sledovači. Zdrojová data studie budou uchovávána v příslušném zdravotnickém zařízení. Zaměstnanci projektu jej budou kódovat a průběžně zaznamenávat do databáze REDCAP.

Účastníci budou dotazováni na základě strukturovaných dotazníků zahrnujících demografické, socio-ekonomické, behaviorální a lékařské podrobnosti, stejně jako podrobnosti o testování na HIV a ART. U pacientů s předchozí a/nebo současnou historií péče o HIV budou získány předchozí výsledky testů VL a CD4 buněk. Bude provedeno fyzikální vyšetření. Jedinci se symptomy a/nebo známkami akutního nebo chronického onemocnění budou dále vyšetřeni v závislosti na klinickém obrazu. Rozhodnutí o režimu ART budou učiněna podle etiopských směrnic.

V návaznosti na zařazení budou odebrány vzorky žilní krve, pro VL, CD4 buňky a kompletní krevní obraz, sérologie na syfilis, hepatitidu B a C. Dále budou odebrány vzorky sputa od všech účastníků (bez ohledu na klinické projevy) pro bakteriologické vyšetření pro Mycobacterium tuberculosis (včetně tekuté kultury a GeneXpert PCR). Vzorky stolice budou mikroskopicky analyzovány pro detekci střevních červů a parazitů. Vyšetření na další oportunní infekce bude provedeno v závislosti na klinickém obrazu. Alikvoty plazmy budou skladovány při -80 °C.

Účastníci budou sledováni po dobu 2 let po zařazení, se studijními návštěvami ve 3měsíčních intervalech během prvního roku a v 6měsíčních intervalech během druhého roku. Při všech návštěvách budou účastníci dotazováni a vyšetřeni s opakovaným odběrem krve pro testování počtu buněk VL a CD4 a skladování plazmy, jak je popsáno výše.

Analýzy Pro charakterizaci vzorců přenosu HIV budou data z fylogenetických analýz virových sekvencí korelována s přítomností mutací lékové rezistence a sociodemografickými charakteristikami. Vzorky s detekovatelnou VL (>150 kopií/ml) budou podrobeny PCR amplifikaci celé oblasti proteáza-polymeráza (obsahující tři hlavní oblasti spojené s lékovou rezistencí; oblasti proteázy, polymerázy a integrázy), následovanou sekvenováním pomocí 3. generace. sekvenační technologie. Tyto sekvence budou použity pro fylogenetickou analýzu a pro stanovení subtypu HIV, rekombinantních forem a přítomnosti mutací lékové rezistence. Pro další charakterizaci dynamiky přenosu HIV bude provedeno testování avidity na vzorcích nově diagnostikovaných jedinců, aby bylo možné odhadnout trvání infekce HIV a identifikovat osoby s nedávno získanou infekcí HIV.

Pro analýzu výsledků léčby budou účastníci sledováni po dobu 2 let po zařazení. Všechny vzorky s detekovatelnou VL získanou >3 měsíce po zařazení budou podrobeny sekvenování pro detekci mutací lékové rezistence. Míry virové suprese (definované jako VL