Передача ВИЧ в эпоху расширения масштабов антиретровирусной терапии в Эфиопии (THESA)

Исходная информация Лица с неполной вирусной супрессией во время антиретровирусной терапии (АРТ) могут быть переносчиками устойчивых к лекарствам вирусов, способных к дальнейшей передаче. Мы предполагаем, что люди, которые ранее или в настоящее время подвергались АРТ, способствуют передаче ВИЧ, включая передачу резистентных к лекарствам вирусов. Эта гипотеза проверяется с помощью молекулярно-эпидемиологического анализа вирусных последовательностей у лиц, у которых впервые диагностирован ВИЧ, и у лиц с продолжающейся репликацией вируса во время АРТ, в сочетании с данными о поведении, связанном с риском передачи. Кроме того, на основе наших выводов, описанных выше, мы включим в этот анализ данные о социально-демографических условиях.

Вероятность достижения вирусной супрессии после модификации лечения у лиц с выявляемой виремией во время АРТ часто снижается из-за наличия мутаций лекарственной устойчивости, проблем с соблюдением режима лечения или нерегулярного снабжения лекарствами. Имеются ограниченные данные об эффективности долутегравира (в настоящее время рекомендуемого в качестве компонента схем АРТ 1-го и 2-го ряда в странах Африки к югу от Сахары) в качестве компонента схем АРТ в странах с низким уровнем дохода. Мы предполагаем, что лица с неполной вирусной супрессией во время предшествующей АРТ подвержены повышенному риску возникновения мутаций лекарственной устойчивости во время лечения на основе долутегравира, включая мутации, придающие устойчивость к долутегравиру. Мы изучим эту гипотезу с помощью глубокого секвенирования РНК ВИЧ, обнаруженного в ходе лонгитюдного наблюдения, с особым вниманием к предыдущему опыту АРТ.

Методы Участники будут набираться и наблюдаться в государственных медицинских учреждениях (больницах и медицинских центрах) в городе Адама и его окрестностях (население >600 000 жителей), расположенных вдоль главной транспортной магистрали Эфиопии. Распространенность ВИЧ в этом районе значительно выше, чем в среднем по стране (9,3% среди беременных женщин).

Две категории ВИЧ-позитивных мужчин и женщин в возрасте старше 16 лет имеют право на включение, если соблюдены определенные критерии для разных категорий (поясняются ниже) и предоставлено письменное информированное согласие.

я. лица с впервые выявленным диагнозом; набраны в связи с тестированием на ВИЧ и/или впервые обращаются за медицинской помощью, не получая АРТ в настоящее время или ранее.

II. Пациенты, которые в настоящее время или ранее подвергались АРТ; выявлены и набраны в клиниках ВРТ. В этих клиниках все реципиенты АРТ ежегодно проходят тестирование на вирусную нагрузку (ВН; в соответствии с национальными рекомендациями). Будут включены все пациенты с обнаруживаемой виремией с выбором контрольной группы с вирусной супрессией из той же когорты.

Будет включено около 800 человек с впервые выявленным диагнозом и 1600 реципиентов АРТ (общее расчетное количество участников около 2400 человек). Исследовательские исследования будут проводиться нанятыми в рамках проекта медсестрами-исследователями. Все подходящие участники получат устную и письменную информацию об исследовании. Отслеживание будет осуществляться специальными трейсерами. Исходные данные исследования будут храниться в соответствующем медицинском учреждении. Он будет кодироваться и постоянно записываться в базу данных REDCAP сотрудниками проекта.

Участники будут опрошены с помощью структурированных анкет, охватывающих демографические, социально-экономические, поведенческие и медицинские данные, а также сведения о тестировании на ВИЧ и АРТ. Для пациентов с предшествующей и/или текущей историей лечения ВИЧ будут получены предыдущие результаты теста на ВН и клетки CD4. Будет проведен физический осмотр. Лица с симптомами и/или признаками острого или хронического заболевания будут дополнительно обследованы в зависимости от клинической картины. Решения о схеме АРТ будут приниматься в соответствии с руководящими принципами Эфиопии.

Образцы венозной крови будут получены в связи с включением, для ВН, клеток CD4 и полного анализа крови, серологии на сифилис, гепатиты В и С. Кроме того, у всех участников будут получены образцы мокроты (независимо от клинических проявлений) для бактериологического исследования. для Mycobacterium tuberculosis (включая жидкую культуру и ПЦР GeneXpert). Образцы стула будут подвергнуты микроскопическому анализу на наличие кишечных глистов и паразитов. Исследование на другие оппортунистические инфекции будет проводиться в зависимости от клинической картины. Аликвоты плазмы будут храниться при температуре -80°C.

За участниками будут наблюдать в течение 2 лет после включения, с учебными визитами с интервалом в 3 месяца в течение первого года и с интервалом в 6 месяцев в течение второго года. Во время всех посещений участники будут опрошены и осмотрены, с повторным забором крови для определения количества клеток VL и CD4 и хранения плазмы, как описано выше.

Анализы Для характеристики моделей передачи ВИЧ данные филогенетического анализа вирусных последовательностей будут сопоставлены с наличием мутаций лекарственной устойчивости и социально-демографическими характеристиками. Образцы с обнаруживаемой ВН (>150 копий/мл) будут подвергнуты ПЦР-амплификации всей протеазно-полимеразной области (содержащей три основные области, связанные с лекарственной устойчивостью: протеазная, полимеразная и интегразная области) с последующим секвенированием с использованием 3-го поколения технология секвенирования. Эти последовательности будут использованы для филогенетического анализа, а также для определения подтипа ВИЧ, рекомбинантных форм и наличия мутаций лекарственной устойчивости. Для дальнейшей характеристики динамики передачи ВИЧ будут проведены тесты на авидность образцов от впервые выявленных лиц с целью оценки продолжительности ВИЧ-инфекции и выявления лиц с недавно инфицированным ВИЧ.

Для анализа результатов лечения участников будут наблюдать в течение 2 лет после включения. Все образцы с обнаруживаемой ВН, полученные более чем через 3 месяца после включения, будут подвергнуты секвенированию для выявления мутаций лекарственной устойчивости. Показатели вирусной супрессии (определяемой как VL