HIV-transmission i æraen af ​​opskalering af antiretroviral terapi i Etiopien (THESA)

Baggrund Personer med ufuldstændig viral suppression under antiretroviral terapi (ART) kan rumme lægemiddelresistente vira, som har kapacitet til videre transmission. Vi antager, at personer med tidligere eller nuværende eksponering for ART bidrager til HIV-overførsel, og at dette inkluderer overførsel af lægemiddelresistente vira. Denne hypotese adresseres ved brug af molekylær epidemiologisk analyse af virale sekvenser fra personer, der er nyligt diagnosticeret med HIV, og personer med igangværende viral replikation under ART, kombineret med data om transmissionsrisikoadfærd. Derudover vil vi, baseret på vores resultater beskrevet ovenfor, inkludere data om sociodemografiske forhold i denne analyse.

Chancen for at opnå viral suppression efter behandlingsmodifikation for personer med påviselig viræmi under ART er ofte kompromitteret af tilstedeværelsen af ​​lægemiddelresistensmutationer, adhærensproblemer eller uregelmæssig lægemiddelforsyning. Der er begrænsede data om effektiviteten af ​​dolutegravir (anbefales i øjeblikket som en del af 1. og 2. linje ART regimer i Afrika syd for Sahara) som en del af ART regimer i lavindkomst regimer. Vi antager, at personer med ufuldstændig viral suppression under tidligere ART har øget risiko for fremkomst af lægemiddelresistensmutationer under dolutegravir-baseret behandling, herunder mutationer, der giver dolutegravir-resistens. Vi vil undersøge denne hypotese med dyb sekventering af HIV RNA påvist under langsgående opfølgning, med særlig hensyntagen til tidligere ART-erfaring.

Metoder Deltagerne vil blive rekrutteret og fulgt på offentlige sundhedsfaciliteter (hospitaler og sundhedscentre) i byen Adama og det omkringliggende område (befolkning >600 000 indbyggere), beliggende langs hovedtransportmotorvejen i Etiopien. HIV-prævalensen i dette område er betydeligt højere end landsgennemsnittet (9,3 % blandt gravide).

To kategorier af hiv-positive mænd og kvinder i alderen >16 år er berettigede til inklusion, hvis specifikke kriterier for de forskellige kategorier (forklaret nedenfor) er opfyldt, og der gives skriftligt informeret samtykke.

jeg. Nydiagnosticerede personer; rekrutteret i forbindelse med HIV-testning og/eller første præsentation til pleje, uden aktuel eller tidligere eksponering for ART.

ii. Patienter med aktuel eller tidligere eksponering for ART; identificeret og rekrutteret på ART-klinikker. I disse klinikker testes alle ART-modtagere årligt for virusbelastning (VL; i henhold til nationale retningslinjer). Alle patienter med påviselig viræmi vil blive inkluderet, med udvalg af kontroller med viral suppression fra samme kohorte.

Ca. 800 nydiagnosticerede personer og 1600 ART-modtagere vil blive inkluderet (samlet anslået antal deltagere ca. 2400 personer). Studieundersøgelser vil blive udført af projektansatte forskningssygeplejersker. Alle kvalificerede deltagere vil modtage mundtlig og skriftlig information om undersøgelsen. Sporing vil blive udført af dedikerede sporstoffer. Studiekildedata vil blive opbevaret på det respektive sundhedscenter. Det vil blive kodet og løbende registreret i en REDCAP-database af projektansatte medarbejdere.

Deltagerne vil blive interviewet efter strukturerede spørgeskemaer, der dækker demografiske, socioøkonomiske, adfærdsmæssige og medicinske detaljer, samt detaljer om HIV-test og ART. For patienter med tidligere og/eller nuværende hiv-behandlingshistorie, vil tidligere VL- og CD4-celletestresultater blive hentet. Fysisk undersøgelse vil blive udført. Personer med symptomer og/eller tegn på akut eller kronisk sygdom vil blive undersøgt yderligere afhængigt af klinisk præsentation. Beslutninger om ART-kur vil blive truffet efter etiopiske retningslinjer.

Der vil blive indhentet venøse blodprøver i forbindelse med inklusion, for VL, CD4-celler og fuldstændig blodtælling, serologi for syfilis, hepatitis B og C. Derudover vil der blive indhentet sputumprøver fra alle deltagere (uanset kliniske manifestationer) til bakteriologisk testning for Mycobacterium tuberculosis (herunder væskekultur og GeneXpert PCR). Afføringsprøver vil blive analyseret mikroskopisk for påvisning af indvoldsorm og parasitter. Undersøgelse for andre opportunistiske infektioner vil blive udført afhængigt af klinisk præsentation. Alikvoter af plasma vil blive opbevaret ved -80°C.

Deltagerne vil blive fulgt i 2 år efter inklusion, med studiebesøg med 3-måneders intervaller i løbet af det første år og med 6-måneders intervaller i løbet af det andet år. Ved alle besøg vil deltagerne blive interviewet og undersøgt med gentagne blodprøver til VL- og CD4-celletalstestning og opbevaring af plasma som beskrevet ovenfor.

Analyser Til karakterisering af HIV-transmissionsmønstre vil data fra fylogenetiske analyser af virale sekvenser blive korreleret til tilstedeværelsen af ​​lægemiddelresistensmutationer og sociodemografiske karakteristika. Prøver med påviselig VL (>150 kopier/ml) vil blive udsat for PCR-amplifikation af hele protease-polymerase-regionen (indeholdende de tre hovedregioner forbundet med lægemiddelresistens; protease-, polymerase- og integraseregionerne), efterfulgt af sekventering ved brug af 3. generation sekventeringsteknologi. Disse sekvenser vil blive brugt til fylogenetisk analyse og til bestemmelse af HIV-subtype, rekombinante former og tilstedeværelse af lægemiddelresistensmutationer. For yderligere karakterisering af HIV-transmissionsdynamikken vil aviditetstestning blive udført på prøver fra nydiagnosticerede individer for at estimere varigheden af ​​HIV-infektion og for at identificere personer med nyligt erhvervet HIV-infektion.

Til analyse af behandlingsresultater vil deltagerne blive fulgt i 2 år efter inklusion. Alle prøver med påviselig VL opnået >3 måneder efter inklusion vil blive udsat for sekventering til påvisning af lægemiddelresistensmutationer. Rate af viral suppression (defineret som VL