HIV-tartunta antiretroviraalisen hoidon laajentamisen aikakaudella Etiopiassa (THESA)

Tausta Henkilöillä, joilla on epätäydellinen virussuppressio antiretroviraalisen hoidon (ART) aikana, saattaa olla lääkeresistenttejä viruksia, joilla on kyky levitä eteenpäin. Oletamme, että henkilöt, jotka ovat aiemmin tai tällä hetkellä altistuneet ART:lle, myötävaikuttavat HIV:n leviämiseen, ja tämä sisältää myös lääkeresistenttien virusten leviämisen. Tätä hypoteesia käsitellään käyttämällä molekyyliepidemiologista analyysiä virussekvensseistä henkilöiltä, ​​joilla on äskettäin diagnosoitu HIV, ja henkilöiltä, ​​joilla on käynnissä viruksen replikaatio ART:n aikana, yhdistettynä tartuntariskikäyttäytymiseen liittyviin tietoihin. Lisäksi sisällytämme tähän analyysiin yllä kuvattujen havaintojen perusteella tietoja sosiodemografisista olosuhteista.

Mahdollisuus saada viruksen suppressio hoidon modifioinnin jälkeen henkilöillä, joilla on havaittavissa oleva viremia ART:n aikana, vaarantuu usein lääkeresistenssimutaatioiden, tarttumisongelmien tai epäsäännöllisen lääkkeiden vuoksi. Dolutegraviirin tehosta (suositellaan tällä hetkellä osana 1. ja 2. linjan ART-hoitoa Saharan eteläpuolisessa Afrikassa) on vain vähän tietoa ART-hoitojen osana pienituloisissa olosuhteissa. Oletamme, että henkilöillä, joilla on epätäydellinen virussuppressio aikaisemman ART:n aikana, on lisääntynyt lääkeresistenssimutaatioiden syntymisen riski dolutegraviiripohjaisen hoidon aikana, mukaan lukien mutaatiot, jotka aiheuttavat dolutegraviiriresistenssin. Tutkimme tätä hypoteesia pitkittäisen seurannan aikana havaitun HIV-RNA:n syvällä sekvensoinnilla, ottaen erityisesti huomioon aikaisemman ART-kokemuksen.

Menetelmät Osallistujia rekrytoidaan ja seurataan julkisissa terveydenhuollon laitoksissa (sairaaloissa ja terveyskeskuksissa) Adamin kaupungissa ja sitä ympäröivällä alueella (väkiluku > 600 000 asukasta), jotka sijaitsevat Etiopian pääliikenteen valtatien varrella. HIV:n esiintyvyys tällä alueella on huomattavasti korkeampi kuin koko maassa keskimäärin (9,3 % raskaana olevilla naisilla).

Kaksi yli 16-vuotiaiden HIV-positiivisten miesten ja naisten luokkaa voidaan ottaa mukaan, jos eri luokkien erityiset kriteerit (selvitetty alla) täyttyvät ja kirjallinen tietoinen suostumus annetaan.

i. Äskettäin diagnosoidut henkilöt; rekrytoitu HIV-testauksen ja/tai ensimmäisen hoitoon saapumisen yhteydessä, ilman nykyistä tai aikaisempaa altistumista ART:lle.

ii. Potilaat, jotka ovat altistuneet ART:lle tai ovat jo aiemmin altistuneet; tunnistettu ja rekrytoitu ART-klinikoilla. Näillä klinikoilla kaikille ART-saajille tehdään vuosittain viruskuormitustesti (VL; kansallisten ohjeiden mukaan). Mukaan otetaan kaikki potilaat, joilla on havaittavissa oleva viremia, ja samasta kohortista valitaan virussuppressiota sisältävät kontrollit.

Mukana on noin 800 äskettäin diagnosoitua henkilöä ja 1 600 ART-saajaa (arvioitu osallistujien kokonaismäärä noin 2 400 henkilöä). Tutkimustutkimukset tekevät projektityössä olevat tutkimushoitajat. Kaikki osallistujat saavat suullista ja kirjallista tietoa tutkimuksesta. Jäljityksen suorittavat omistetut jäljittäjät. Tutkimuksen lähdetiedot säilytetään vastaavassa terveyskeskuksessa. Projektihenkilöstö koodaa sen ja tallentaa sen jatkuvasti REDCAP-tietokantaan.

Osallistujia haastatellaan strukturoiduilla kyselylomakkeilla, jotka kattavat demografiset, sosioekonomiset, käyttäytymis- ja lääketieteelliset tiedot sekä HIV-testauksen ja ART-tiedot. Potilailta, joilla on aiempi ja/tai nykyinen HIV-hoitohistoria, aiemmat VL- ja CD4-solutestien tulokset haetaan. Fyysinen tarkastus suoritetaan. Henkilöitä, joilla on akuutin tai kroonisen sairauden oireita ja/tai merkkejä, tutkitaan edelleen kliinisestä esityksestä riippuen. Päätökset ART-ohjelmasta tehdään Etiopian ohjeiden mukaisesti.

Laskimoverinäytteet otetaan inkluusiota varten, VL-, CD4-solu- ja täydellinen verenkuva, serologia kupan, hepatiitti B ja C:n varalta. Lisäksi kaikilta osallistujilta (kliinisistä ilmenemismuodoista riippumatta) otetaan yskösnäytteitä bakteriologista testausta varten. Mycobacterium tuberculosis (mukaan lukien nesteviljelmä ja GeneXpert PCR). Ulostenäytteet analysoidaan mikroskooppisesti suolistomatojen ja loisten havaitsemiseksi. Muiden opportunististen infektioiden tutkimus suoritetaan kliinisen esityksen mukaan. Plasman alikvootteja säilytetään -80 °C:ssa.

Osallistujia seurataan 2 vuoden ajan osallistumisen jälkeen. Opintovierailuja tehdään kolmen kuukauden välein ensimmäisen vuoden aikana ja kuuden kuukauden välein toisena vuonna. Kaikilla vierailuilla osallistujia haastatellaan ja tutkitaan ja otetaan toistuvasti verinäytteitä VL- ja CD4-solumäärän testausta ja plasman varastointia varten edellä kuvatulla tavalla.

Analyysit HIV:n leviämismallien karakterisoimiseksi virussekvenssien fylogeneettisten analyysien tiedot korreloidaan lääkeresistenssimutaatioiden ja sosio-demografisten ominaisuuksien kanssa. Näytteille, joissa on havaittavissa oleva VL (> 150 kopiota/ml), tehdään PCR-monistus koko proteaasipolymeraasialueelta (joka sisältää kolme lääkeresistenssiin liittyvää pääaluetta; proteaasi-, polymeraasi- ja integraasialueet), minkä jälkeen suoritetaan sekvensointi käyttämällä 3. sukupolvea. sekvensointitekniikkaa. Näitä sekvenssejä käytetään fylogeneettiseen analyysiin ja HIV-alatyypin, rekombinanttimuotojen ja lääkeresistenssimutaatioiden esiintymisen määrittämiseen. Hiv-tartuntadynamiikan karakterisointia varten tehdään aviditeettitestejä äskettäin diagnosoitujen henkilöiden näytteille, jotta voidaan arvioida HIV-tartunnan kestoa ja tunnistaa henkilöt, joilla on äskettäin saatu HIV-infektio.

Hoitotulosten analysoimiseksi osallistujia seurataan 2 vuoden ajan mukaan ottamisesta. Kaikille näytteille, joilla on havaittavissa oleva VL, joka on saatu yli 3 kuukautta sisällyttämisen jälkeen, suoritetaan sekvensointi lääkeresistenssimutaatioiden havaitsemiseksi. Viruksen suppression määrä (määritelty VL