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대장암과 비소세포폐암에서 수지상세포의 이질성 (TUM-DC)

2023년 12월 29일 업데이트: University of Milano Bicocca

결장암 및 비소세포폐암에서 수지상세포와 기타 골수성 및 림프성 기원 세포의 이질성

생물학적 샘플을 사용한 전향적 연구. 관련된 센터는 몬차에 있는 San Gerardo 병원의 흉부외과 및 외과 1단위입니다.

연구 개요

상세 설명

적응 면역 반응의 활성화는 수지상 세포(DC) 및 대식세포, 항원 제시 및 T 세포 활성화에 특화된 선천성 면역계의 골수 세포에 의존한다. 골수 세포의 이러한 특이성은 감염성 질병뿐만 아니라 암과 관련하여 기본적입니다. 식세포는 암세포와 관련된 항원을 선택하여 종양 미세 환경 또는 종양 배수 림프절 내의 T 세포에 제시하여 항종양 반응을 얻습니다. .

특히, DC의 전체 종양 함량과 다른 종양을 가진 암 환자의 생존 사이에 양의 상관관계가 관찰되었으며, 면역관문억제제(ICB) 사용에 기초한 치료법에 대한 더 나은 반응성이 관찰되었습니다.

서로 다른 수지상 세포 아형의 존재와 종양 환경에 대한 각 아형의 특정 적응이 최근에 밝혀졌습니다.

이것은 종양 미세 환경에서 DC, 대식세포 및 T 세포의 기능적 이질성이 아마도 항암 면역 요법의 성공 또는 실패를 담당하는 요인 중 하나이기 때문에 중요한 포인트입니다. ICB 기반 치료법은 흑색종 및 폐암과 같은 암 환자의 치료에 혁명을 일으켰지만 현재는 소수의 환자에게만 유익합니다. 종양 면역 미세 환경에 대한 이해를 높이는 것은 기존 치료법에 대한 임상 반응을 예측하고 새로운 면역 치료법을 개발하는 데 핵심입니다.

근거 수지상 세포 및 대식세포와 같은 골수 세포는 다양한 유형의 종양에 침투하여 T 및 NK 세포를 활성화하여 항종양 기능을 발휘하거나 항염증성 사이토카인 및 억제 분자를 생성하여 전종양 활동을 수행할 수 있습니다. 몇 가지 기존의 DC 하위 유형의 종양 내 존재는 더 나은 예후와 관련이 있는 반면, CD14 + CD1c + DC와 같은 비전통적인 DC에 대해 프로-종양 기능이 제안되었습니다. 대식세포의 존재는 원종양 작용과 관련이 있습니다.

연구자들은 종양 미세 환경 내 골수 세포와 T 세포의 기능적 이질성이 항종양 면역 반응의 성공 또는 실패에 책임이 있는 요인 중 하나라는 가설을 세웠습니다. 골수 세포 아형 및 종양 관련 T 세포, 표현형, 종양 내 분포, 기능적 특성의 고해상도 정의는 종양 미세 환경의 복잡성을 이해하는 데 도움이 될 것입니다.

연구 설계 수집 시 각 샘플을 식별하고 고유 ID로 레이블을 지정합니다. 병리학자는 재료를 샘플링하고 진단 목적에 필요한 모든 것을 취한 후 실험에 사용할 수 있는 조직을 선택합니다. 연구 샘플은 시험관에 넣고 얼음에 보관합니다. 그런 다음 University of Milano-Bicocca 실험실로 보내집니다. 종양을 조각으로 자르고 단일 세포 현탁액을 표준 프로토콜에 따라 인간 종양 해리 키트 및 gentleMACS™ 해리기(Miltenyi Biotech)로 준비합니다. 세포 현탁액은 밀도 구배 원심 분리에 의해 분리됩니다.

조사관은 면역형광 연구를 위해 약 60명의 환자를 분석하고 단일 세포 전사체 분석(단일 세포 RNA-seq)을 위해 4명의 환자를 분석할 것입니다. 4명의 환자가 수행한 단일 세포 분석은 이미 면역 세포의 다른 아형을 식별하기에 충분한 것으로 나타났습니다. 면역 세포는 골수 세포가 풍부한 세포 현탁액을 얻기 위해 처리됩니다. 이를 통해 DC, 대식세포 및 CD4 + T 세포의 정확한 아형 분석이 가능하고 희석으로 인해 선택되지 않은 샘플에서 손실될 수 있는 매우 희귀한 집단도 식별할 수 있습니다. 사전 분류 전략은 T, B, NK 및 호중구를 제외하기 위해 CD45 및 MHC 클래스 II의 발현과 CD3, CD19, CD56, Ly6G의 발현 부재를 기반으로 합니다.

잔여 자료는 저장되지 않습니다. 5년 동안 환자를 등록하고 분석할 것으로 가정합니다.

5가지 다른 작업이 있습니다.

작업 1: 단일 세포 RNA-seq 라이브러리의 준비 및 시퀀싱 작업 2: 단일 세포 RNA-seq 생물 정보학 분석; 작업 3: 종양 미세 환경에 존재하는 DC 아형의 유세포 분석; 작업 4: 종양 미세환경에서 DC 아형의 공간적 분포 작업 5: 종양 미세환경에 존재하는 골수 세포의 아형과 생존 사이의 연관성 평가;

연구는 데이터의 생물 정보학 분석 및 유세포 분석을 통한 검증으로 끝납니다.

연구 유형

관찰

등록 (추정된)

64

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

연구 연락처 백업

연구 장소

      • Monza, 이탈리아
        • 아직 모집하지 않음
        • ASST Monza-C. CHIRURGIA GENERALE E D'URGENZA I
        • 연락하다:
          • Luca Nespoli
      • Monza, 이탈리아
        • 모병
        • ASST Monza-Ospedale San Gerardo, S.C. Chirurgia Toracica
        • 연락하다:
          • Francesca Granucci
        • 연락하다:
          • Marco Scarci

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

NSCLC(원발 종양, 인접 건강한 조직, 혈액) 또는 대장암(원발 종양, 정상 인접 조직, 혈액) 환자

설명

포함 기준:

  • 18세 이상의 남녀;
  • 결장암 또는 폐암의 존재를 확립하기 위한 일반 조사에 의해 확인된 임상 진단;
  • 병변> 1cm;
  • ICH/EU GCP 및 국가/지역 규정에 따라 정보에 입각한 동의를 제공할 수 있는 법적 능력.

제외 기준:

  • 임신;
  • 추정 임신;
  • 알려진 응고 결함;
  • 알코올 또는 약물 남용

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 관찰 모델: 보병대
  • 시간 관점: 유망한

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
NSCLC 또는 결장암 환자

대상자는 결장암 또는 폐암을 앓고 있는 18세 이상의 남성 또는 여성이고; 병변은 1cm 이상입니다. 그들은 또한 정보에 입각한 동의를 할 수 있습니다.

병리학자는 재료를 샘플링하고 진단 목적에 필요한 모든 것을 취한 후 실험에 사용할 수 있는 조직을 선택합니다. 연구 샘플은 시험관에 넣고 얼음에 보관합니다.

그런 다음 University of Milano-Bicocca 실험실로 보내어 면역형광 연구를 위해 약 60명의 환자를 분석하고 단일 세포 전사체 분석을 위해 4명의 환자를 분석합니다.

  1. 샘플 수집: 골수 세포 정제 + 단일 세포 시퀀싱
  2. 1차 분석: QC 시퀀싱 데이터 + 판독 정렬 + UMI 정량화
  3. 생물 정보학 분석: 품질 관리(유전자 수, UMI 함량, 미토콘드리아 유전자 %, 리보단백질 유전자 %, 저품질 세포 필터링) + 정규화 및 스케일링(정규화, 원치 않는 변이원 제거, HVG 검출) + PCA 클러스터링 마커(PCA 및 PC 선택, 클러스터링, t-SNE, 마커 식별을 위한 미분 표현)
  4. 검증: FACS 분석 + 면역조직화학

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
단세포 생물정보학 분석 RNA-seq
기간: 연구 종료시까지(약 5년).
단일 세포 RNA-seq 데이터 분석을 위해 10x Genomics 및 사용자 정의 R/Python 스크립트에서 제공하는 최신 방법론을 활용하여 세포 하위 집합의 식별 및 특성화를 수행합니다.
연구 종료시까지(약 5년).
단일 세포 RNA-seq 라이브러리 준비 및 시퀀싱.
기간: 연구 종료시까지(약 5년).
각 샘플에 대해 10,000개의 세포가 Chromium 10X(10x genomics)라는 기기에 로드됩니다.
연구 종료시까지(약 5년).

2차 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
종양 미세 환경에서 DC 하위 유형의 공간 분포
기간: 연구 종료시까지(약 5년).

Shapiro-Wilks 테스트는 연속 변수가 정규 분포를 따르는지 여부를 확인하는 데 사용됩니다.

그룹 간 비교는 2개 이상의 그룹을 비교할 때 t-테스트 또는 분산 분석(ANOVA)을 사용하여 수행됩니다.

ANOVA 테스트에 대한 귀무가설이 기각되는 경우 여러 비직교 비교가 있는 경우 α 오류를 확인하기 위해 Tukey 방법을 사용하여 쌍대 비교를 수행합니다. 변수가 정규 분포를 따르지 않으면 해당하는 비모수 검정(Wilcoxon Mann Whitney 및 Kruskal-Wallis 검정)이 적용됩니다.

많은 수의 테스트가 수행되는 경우 다중성 문제를 고려하기 위해 pFDR(positive false discovery rate) 방법이 적용됩니다.

연구 종료시까지(약 5년).
종양미세환경에 존재하는 골수세포의 아형과 생존의 상관관계
기간: 연구 종료시까지(약 5년).
생존과 관련된 실제 유전자를 선택하고 위험 비율을 추정하기 위해 "LASSO(최소 절대 축소 및 선택 연산자)" 방법을 공동으로 사용하는 각 모델에서 모든 유전자를 포함하는 전체 생존을 위한 다변량 Cox 모델 및 무병 생존을 위한 하나의 Cox 모델( HR) 및 해당 95% CI.
연구 종료시까지(약 5년).

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2021년 2월 9일

기본 완료 (추정된)

2026년 2월 9일

연구 완료 (추정된)

2026년 2월 9일

연구 등록 날짜

최초 제출

2021년 2월 17일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2021년 3월 4일

처음 게시됨 (실제)

2021년 3월 9일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (추정된)

2024년 1월 1일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2023년 12월 29일

마지막으로 확인됨

2023년 12월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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비소세포폐암에 대한 임상 시험

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