Prevalentie van enterobacteriën met verminderde gevoeligheid voor carbapenems in de oostelijke interregio (CARBAFREST)

Bij de introductie van penicillines werd de inactivering van bèta-lactam-antibiotica door door bacteriën geproduceerde enzymen aangetoond. Tot voor kort waren carbapenems een relatief gespaarde subklasse van deze enzymen, waardoor de moleculen het laatste redmiddel zijn bij ernstige infecties. De laatste tijd neemt in sommige landen de prevalentie toe van enzymen die carbapenem hydrolyseren, de carbapenemasen. Maar deze carbapenemasen zijn niet het enige mechanisme dat betrokken is bij een verminderde gevoeligheid voor carbapenems, wat soms verband houdt met de combinatie van verschillende resistentiemechanismen. De beschikbare gegevens over de epidemische situatie van deze nieuwe resistentie zijn essentieel voor het verbeteren van de detectie ervan, het beheersen van infecties bij patiënten en het voorkomen van een epidemie. In deze context stellen de onderzoekers een studie voor in de noordoostelijke interregio om de prevalentie van Enterobacteriaceae met verminderde gevoeligheid voor carbapenems te schatten en te zoeken naar risicofactoren voor infectie met dit type bacterie. De studie wordt uitgevoerd in vijf academische ziekenhuizen (Besançon, Dijon, Nancy, Reims en Straatsburg) en twee algemene ziekenhuizen (Colmar en Troyes) in Noordoost-Frankrijk. Gedurende een jaar worden alle Enterobacteriaceae-isolaten met een verminderde gevoeligheid voor carbapenems (CDSE) volgens de 2012 Antibiogram Comity of the French Microbiology Society (CA-SFM) (MIC van ertapenem > 0,5 μg/ml) verzameld en naar de bacteriologie gestuurd laboratorium van het Universitair Ziekenhuis van Reims. Van deze stammen worden er willekeurig 105 geselecteerd. De klinische studie wordt als volgt uitgevoerd: voor elke patiënt met CDSE-isolaat die in een centrum is opgenomen, worden 2 controlepatiënten geselecteerd. Dit zijn de patiënten met de 2 Enterobacteriaceae-isolaten, zonder verminderde gevoeligheid voor carbapenems en die het CDSE-isolaat in hetzelfde centrum volgen.

Microbiologisch onderzoek: identificatie van isolaten wordt uitgevoerd met behulp van MALDI-TOF (Bruker Daltonics, Bremen, Duitsland). Gevoeligheid voor antibiotica wordt bepaald door de schijfdiffusiemethode volgens de richtlijnen van de European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) (www.EUCAST.org) en uitgebreid-spectrum bèta-lactamase (ESBL's) worden gedetecteerd door de dubbele schijf-synergietest en carbapenem minimale remmende concentraties (MIC's voor Imipenem, Ertapenem, Doripenem en Meropenem) bepaald met behulp van E-test®-strips. De productie van metallo-β-lactamase werd gescreend met de MβL Etest (bioMérieux, Marcy l'Etoile, Frankrijk). Beta-lactamasen gedetecteerd met behulp van polymerasekettingreactie (PCR). Voor carbapenemase coderende genen (blaKPC, blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaOXA-23-achtig, blaOXA-24-achtig, blaOXA-58-achtig en blaOXA-48-achtig) werden gescreend met multiplex PCR's en blaIMI en blaGES met simplex PCR's. Alle gedetecteerde blaOXA-48-achtige werden vervolgens gesequenced. Genen blaTEM, blaSHV, blaCTX-M en blaOXA werden gedetecteerd door PCR met behulp van specifieke primers. Plasmide-gemedieerde AmpC-type genen blaACC, blaFOX, blaMOX, blaDHA, blaCMY en blaMIR werden gescreend met behulp van multiplex PCR's. Alle beta-lactamasen zijn gesequenced. Mutaties in het chinolonresistentie-bepalende gebied (QRDR) worden geïdentificeerd door middel van PCR en sequentiebepaling in de gyrA-, gyrB-, parC- en parE-genen. Qnr- en qepA-genen worden gedetecteerd door real-time PCR, aac(6')-Ib-cr door pyrosequencing en oqxAB door conventionele PCR. Genotypering wordt uitgevoerd met pulsed-field gelelektroforese (PFGE) en multilocus sequentietypering (MLST).

Statistische analyse : kwalitatieve variabelen worden geanalyseerd met de Chi2-test en de tweezijdige Fisher exact-test. Kwantitatieve variabelen worden vergeleken met behulp van de Mann-Whitney-test. Vervolgens wordt een multivariate analyse uitgevoerd: logistische regressie met stapsgewijze factoren als verklarende variabelen met p < 0,20 in de univariate analyse als ingangsdrempel en output vastgesteld op 0,20. De resultaten worden als statistisch significant beschouwd wanneer P < 0,05.

Verwachte resultaten: deze studie zal het aandeel van de verschillende betrokken soorten van carbapenemase in vergelijking met de andere mechanismen, het niveau van resistentie in MIC geven. Risicofactoren zoals eerdere antibioticabehandeling, onderliggende ziekte-ernst of overdracht van klonale stam zullen worden aangetoond, waardoor preventiemaatregelen kunnen worden geïdentificeerd die moeten worden geïmplementeerd.