Forekomst af enterobakterier med nedsat følsomhed over for carbapenemer i østlige interregioner (CARBAFREST)

Ved introduktion af penicilliner blev inaktivering af betalactamantibiotika påvist af enzymer produceret af bakterier. Indtil for nylig var carbapenemer en relativt skånet underklasse af disse enzymer, hvilket gør molekylerne til sidste udvej ved alvorlig infektion. For nylig var udbredelsen af ​​enzymer, der hydrolyserer carbapenem, carbapenemaserne, stigende i nogle lande. Men disse carbapenemaser er ikke den eneste mekanisme, der er involveret i en nedsat følsomhed over for carbapenemer, som nogle gange er forbundet med en kombination af flere resistensmekanismer. De tilgængelige data om den epidemiske situation for denne nye resistens er afgørende for at forbedre deres påvisning, håndtering af infektioner hos patienter og forhindre forekomsten af ​​epidemier. I denne sammenhæng foreslår efterforskerne en undersøgelse i den nordøstlige interregion for at estimere prævalensen af ​​Enterobacteriaceae med nedsat modtagelighed for carbapenemer og se efter risikofaktorer for infektion med denne type bakterier. Undersøgelsen udføres på fem undervisningshospitaler (Besançon, Dijon, Nancy, Reims og Strasbourg) og to almene hospitaler (Colmar og Troyes) i det nordøstlige Frankrig. I et år opsamles alle Enterobacteriaceae-isolater med en nedsat modtagelighed for carbapenemer (CDSE) i henhold til 2012 Antibiogram Comity of the French Microbiology Society (CA-SFM) (MIC for ertapenem > 0,5 μg/mL) og sendes til bakteriologien laboratorium på Reims Universitetshospital. Blandt disse stammer er 105 tilfældigt udvalgt. Den kliniske undersøgelse udføres som følger: For hver patient med CDSE-isolat inkluderet i et center udvælges 2 kontrolpatienter. Det er de patienter, der har de 2 Enterobacteriaceae-isolater, uden reduceret modtagelighed for carbapenemer og følger CDSE-isolatet i samme center.

Mikrobiologisk undersøgelse: identifikation af isolater udføres ved hjælp af MALDI-TOF (Bruker Daltonics, Bremen, Tyskland). Antibiotikafølsomhed bestemmes af diskdiffusionsmetoden i henhold til retningslinjerne fra European Committee on Antimicrobial Suceptibility Testing (EUCAST) (www.EUCAST.org) og udvidet spektrum beta-lactamase (ESBL'er) påvises ved dobbelt-skive synergitest og carbapenem minimale hæmmende koncentrationer (MIC'er til Imipenem, Ertapenem, Doripenem og Meropenem) bestemt ved hjælp af E-test®-strimler. Metallo-β-lactamase-produktion blev screenet med MβL Etest (bioMérieux, Marcy l'Etoile, Frankrig). Beta-lactamaser påvist ved hjælp af polymerasekædereaktion (PCR). Carbapenemase-kodende gener (blaKPC, blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaOXA-23-lignende, blaOXA-24-lignende, blaOXA-58-lignende og blaOXA-48-lignende) blev screenet ved hjælp af multiplekse PCR'er og blaIMI og blaGES med simplex PCR'er. Alle de påviste blaOXA-48-lignende blev efterfølgende sekventeret. Gener blaTEM, blaSHV, blaCTX-M og blaOXA blev påvist ved PCR under anvendelse af specifikke primere. Plasmid-medierede AmpC-type gener blaACC, blaFOX, blaMOX, blaDHA, blaCMY og blaMIR blev screenet ved hjælp af multiplekse PCR'er. Alle beta-lactamaserne er sekventeret. Mutationer i den quinolonresistensbestemmende region (QRDR) identificeres ved PCR og sekventering i gyrA-, gyrB-, parC- og parE-generne. Qnr- og qepA-gener detekteres ved real-time PCR, aac(6')-Ib-cr ved pyrosequencing og oqxAB ved konventionel PCR. Genotyping udføres med pulseret felt gelelektroforese (PFGE) og multilocus sekvenstypning (MLST).

Statistisk analyse: Kvalitative variable analyseres med Chi2-testen og den to-halede Fisher-eksakte test. Kvantitative variable sammenlignes ved hjælp af Mann-Whitney testen. Derefter udføres en multivariat analyse: logistisk regression med trinvise faktorer som forklarende variable med p <0,20 i den univariate analyse som inputtærskel og output sat til 0,20. Resultaterne anses for statistisk signifikante, når P < 0,05.

Forventede resultater: denne undersøgelse vil give andelen af ​​de forskellige involverede arter, af carbapenemasen i forhold til de andre mekanismer, niveauet af resistens i MIC. Risikofaktorer såsom tidligere antibiotikabehandling, underliggende sygdoms sværhedsgrad eller overførsel af klonal stamme vil blive påvist, hvilket gør det muligt at identificere forebyggende kontrolforanstaltninger, der skal implementeres.