Prevalens av enterobakterier med redusert følsomhet for karbapenemer i østlige interregioner (CARBAFREST)

Ved introduksjon av penicilliner ble det påvist inaktivering av betalaktamantibiotika av enzymer produsert av bakterier. Inntil nylig var karbapenemer en relativt spart underklasse av disse enzymene som gjør molekylene til siste utvei ved alvorlig infeksjon. Nylig har forekomsten av enzymer som hydrolyserer karbapenem, karbapenemasene, økt i noen land. Men disse karbapenemasene er ikke den eneste mekanismen involvert i en redusert mottakelighet for karbapenemer som noen ganger er knyttet til kombinasjonen av flere motstandsmekanismer. Data tilgjengelig om epidemien til denne nye resistensen er avgjørende for å forbedre deteksjonen, håndteringen av infeksjoner hos pasienter og forhindre forekomsten av epidemier. I denne sammenhengen foreslår etterforskerne en studie i den nordøstlige interregionen for å estimere prevalensen av Enterobacteriaceae med redusert følsomhet for karbapenemer og se etter risikofaktorer for infeksjon med denne typen bakterier. Studien er utført ved fem undervisningssykehus (Besançon, Dijon, Nancy, Reims og Strasbourg) og to generelle sykehus (Colmar og Troyes) i Nord-Øst-Frankrike. I ett år samles alle Enterobacteriaceae-isolatene med redusert følsomhet for karbapenemer (CDSE) i henhold til 2012 Antibiogram Comity of the French Microbiology Society (CA-SFM) (MIC av ertapenem > 0,5 μg/mL) og sendes til bakteriologien laboratoriet ved Reims universitetssykehus. Blant disse stammene er 105 tilfeldig valgt. Den kliniske studien gjennomføres som følger: for hver pasient med CDSE-isolat inkludert i et senter velges 2 kontrollpasienter. De er pasientene som har de to Enterobacteriaceae-isolatene, uten redusert følsomhet for karbapenemer og følger CDSE-isolatet i samme senter.

Mikrobiologisk studie: identifikasjon av isolater utføres ved bruk av MALDI-TOF (Bruker Daltonics, Bremen, Tyskland). Antibiotikafølsomhet bestemmes av skivediffusjonsmetoden i henhold til retningslinjer fra European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) (www.EUCAST.org) og utvidet-spektrum beta-laktamase (ESBLs) påvises ved dobbelt-skive synergitest og karbapenem minimale hemmende konsentrasjoner (MICs til Imipenem, Ertapenem, Doripenem og Meropenem) bestemt ved bruk av E-test®-strimler. Metallo-β-laktamase-produksjonen ble screenet med MβL Etest (bioMérieux, Marcy l'Etoile, Frankrike). Beta-laktamaser påvist ved bruk av polymerasekjedereaksjon (PCR). Karbapenemase-kodende gener (blaKPC, blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaOXA-23-lignende, blaOXA-24-lignende, blaOXA-58-lignende og blaOXA-48-lignende) ble screenet ved bruk av multiplekse PCR og blaIMI og blaGES med simpleks PCR. Alle de blaOXA-48-lignende påviste ble deretter sekvensert. Gener blaTEM, blaSHV, blaCTX-M og blaOXA ble påvist ved PCR ved bruk av spesifikke primere. Plasmid-mediert AmpC-type gener blaACC, blaFOX, blaMOX, blaDHA, blaCMY og blaMIR ble screenet ved bruk av multiplekse PCR. Alle beta-laktamasene er sekvensert. Mutasjoner i den kinolonresistensbestemmende regionen (QRDR) identifiseres ved PCR og sekvensering i gyrA-, gyrB-, parC- og parE-genene. Qnr- og qepA-gener påvises ved sanntids PCR, aac(6')-Ib-cr ved pyrosekvensering og oqxAB ved konvensjonell PCR. Genotyping utføres med pulserende felt gelelektroforese (PFGE) og multilocus sekvenstyping (MLST).

Statistisk analyse: kvalitative variabler analyseres med Chi2-testen og den to-halede Fisher-eksakte testen. Kvantitative variabler sammenlignes ved hjelp av Mann-Whitney-testen. Deretter gjennomføres en multivariat analyse: logistisk regresjon med trinnvise faktorer som forklaringsvariable med p <0,20 i den univariate analysen som inngangsterskel og utgang satt til 0,20. Resultatene anses som statistisk signifikante når P < 0,05.

Forventede resultater: denne studien vil gi andelen av de forskjellige artene involvert, av karbapenemasen sammenlignet med de andre mekanismene, nivået av resistens i MIC. Risikofaktorer som tidligere antibiotikabehandling, alvorlighetsgrad av underliggende sykdom eller overføring av klonal stamme vil bli dokumentert, noe som gjør det mulig å identifisere forebyggende kontrolltiltak som skal implementeres.