Effect van DNMT SNP's op DNA-methylering in primaire ITP

Immuuntrombocytopenie (ITP) is een immuungemedieerde verworven ziekte bij volwassenen en kinderen die wordt gekenmerkt door een voorbijgaande of aanhoudende afname van het aantal bloedplaatjes en, afhankelijk van de mate van trombocytopenie, een verhoogd risico op bloedingen (Rodeghiero et al., 2009). Internationale richtlijnen definiëren trombocytopenie als een perifere bloedplaatjestelling van minder dan 100.000/uL (Raj, 2017). Waarden van het aantal bloedplaatjes tussen 100.000/uL en 150.000/uL worden vaak gevonden bij ogenschijnlijk gezonde mensen (Adibi et al., 2007) en deze drempel vermindert de bezorgdheid over de milde "fysiologische" trombocytopenie geassocieerd met zwangerschap (Neunert et al., 2011).

Immuuntrombocytopenie kan primair of secundair zijn. Primaire ITP is een diagnose van uitsluiting. Secundaire ITP treedt op als gevolg van een onderliggende ziekte/aandoening. Oorzaken van secundaire ITP zijn infectie (CMV, Helicobacter pylori, HCV, HIV, Varicella zoster), systemische lupus erythematosus, antifosfolipidensyndroom, geneesmiddelgeïnduceerde, lymfoproliferatieve aandoeningen, post-beenmergtransplantatie en post-vaccinatie (Neunert et al., 2011) .

Primaire ITP is een verworven auto-immuunziekte die zowel een verhoogde afbraak van bloedplaatjes als een onvoldoende aanmaak van bloedplaatjes veroorzaakt. Meer dan één mechanisme zou hieraan kunnen bijdragen, waaronder autoreactieve B-lymfocyten, Th1/Tc1-polarisatie, T-cel-gemedieerde bloedplaatjeslysis en abnormale circulerende Treg-cellen. Ook kan DNA-methylering deelnemen aan de pathofysiologie van ITP (Semple et al., 2010; Wang et al., 2011).

DNA-methylatie is een erfelijke, stabiele en ook omkeerbare manier van DNA-modificatie; het kan genexpressie reguleren zonder de nucleotidesequenties te veranderen (Huiyuan et al., 2013). DNA-methylering wordt gemedieerd door DNA-methyltransferasen (DNMT's). Er zijn vijf leden in de DNMT-groep, waaronder DNMT3A en DNMT3B (Okano et al., 1999). DNMT3A en DNMT3B katalyseren de novo methylering en het is belangrijk bij het tot stand brengen van DNA-methylatiepatronen in het embryo en tijdens de ontwikkeling van de foetus (Sawalha, 2008).

De status van DNA-methylering neemt deel aan de regulatie van de immuunrespons, het verlies van het methylatiepatroon in immuuncellen zal resulteren in auto-immuunziekte door afwijkende genexpressie te induceren. ITP is een auto-immuunziekte met veel immuundeficiënties waarbij abnormale DNA-methylatie een rol speelt bij de etiologie van de ziekte (Huiyuan et al., 2013). Chen et al., 2011, concludeerden dat afwijkende DNA-methylering een rol kan spelen in de pathogenese van ITP door de methylcytosineconcentratie van genomisch DNA te kwantificeren. Ze vonden een hypomethyleringspatroon in CD4 T-cellen van ITP-patiënten.

DNMT3A en DNMT3B DNA-methyltransferasen worden gecodeerd door verschillende genen op verschillende chromosomen (Sawalha, 2008). Er zijn veel single nucleotide polymorphisms (SNP's) in het DNMT3A-gen die de katalytische activiteit van het DNMT3A-enzym kunnen beïnvloeden, waaronder -448G/A SNP (Zhao et al., 2012). Eenentwintig polymorfismen zijn geïdentificeerd in het DNMT3B-gen, waaronder -149 C/T SNP en -579 G/T SNP (Zhang et al., 2015).

In een eerder onderzoek in het Assiut University Hospital (AbdelKader et al., 2018) was het DNMT3A -448 G/A SNP-variant A-allel significant geassocieerd met een verminderd risico op primaire ITP, terwijl DNMT3B -149C/T SNP-variant T-allel was significant geassocieerd met bijna een verdubbeling van het risico op primaire ITP. Het onderliggende mechanisme achter deze associatie is echter niet onderzocht. Auteurs adviseerden om mRNA-expressie van DNMT-genen, enzymatische activiteit van DNA-methyltransferasen, kwantificering van globaal gemethyleerd DNA en/of methyleringsstatus van methyleringsgevoelige genen die betrokken zijn bij primaire ITP-pathogenese te bestuderen om deze associatie te begrijpen.