Wpływ SNP DNMT na metylację DNA w pierwotnym ITP

Małopłytkowość immunologiczna (ITP) jest nabytą chorobą o podłożu immunologicznym dorosłych i dzieci, charakteryzującą się przejściowym lub trwałym zmniejszeniem liczby płytek krwi oraz, w zależności od stopnia małopłytkowości, zwiększonym ryzykiem krwawień (Rodeghiero i in., 2009). Międzynarodowe wytyczne definiują małopłytkowość jako liczbę płytek krwi obwodowej poniżej 100 000/ul (Raj, 2017). Wartości liczby płytek krwi między 100 000/ul a 150 000/ul często stwierdza się u pozornie zdrowych osób (Adibi i in., 2007), a ten próg zmniejsza obawy związane z łagodną „fizjologiczną” trombocytopenią związaną z ciążą (Neunert i in., 2011).

Małopłytkowość immunologiczna może być pierwotna lub wtórna. Pierwotna ITP jest diagnozą wykluczenia. Wtórna ITP występuje z powodu podstawowych chorób/stanów. Przyczyny wtórnej ITP obejmują infekcje (CMV, Helicobacter pylori, HCV, HIV, Varicella zoster), toczeń rumieniowaty układowy, zespół antyfosfolipidowy, polekowe, zaburzenia limfoproliferacyjne, po przeszczepie szpiku kostnego i po szczepieniu (Neunert i in., 2011) .

Pierwotna ITP jest nabytą chorobą autoimmunologiczną powodującą zarówno zwiększone niszczenie płytek krwi, jak i niedostateczną produkcję płytek krwi. Przyczynić się do tego może więcej niż jeden mechanizm, w tym autoreaktywne limfocyty B, polaryzacja Th1/Tc1, liza płytek krwi za pośrednictwem limfocytów T i nieprawidłowe krążące limfocyty Treg. Również metylacja DNA może uczestniczyć w patofizjologii ITP (Semple i in., 2010, Wang i in., 2011).

Metylacja DNA jest dziedzicznym, stabilnym, a także odwracalnym sposobem modyfikacji DNA; może regulować ekspresję genów bez zmiany sekwencji nukleotydowych (Huiyuan i in., 2013). W metylacji DNA pośredniczą metylotransferazy DNA (DNMT). W grupie DNMT jest pięciu członków, w tym DNMT3A i DNMT3B (Okano i in., 1999). DNMT3A i DNMT3B katalizują metylację de novo i jest to ważne w ustalaniu wzorców metylacji DNA w zarodku i podczas rozwoju płodu (Sawalha, 2008).

Status metylacji DNA bierze udział w regulacji odpowiedzi immunologicznej, utrata wzorca metylacji w komórkach odpornościowych spowoduje chorobę autoimmunologiczną poprzez indukcję nieprawidłowej ekspresji genów. ITP jest chorobą autoimmunologiczną z wieloma niedoborami odporności z nieprawidłową metylacją DNA zaangażowaną w etiologię choroby (Huiyuan i in., 2013). Chen i wsp., 2011, doszli do wniosku, że nieprawidłowa metylacja DNA może brać udział w patogenezie ITP poprzez ilościowe określenie stężenia metylocytozyny w genomowym DNA. Znaleźli wzorzec hipometylacji w limfocytach T CD4 pacjentów z ITP.

Metylotransferazy DNA DNMT3A i DNMT3B są kodowane przez różne geny na różnych chromosomach (Sawalha, 2008). Istnieje wiele polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) w genie DNMT3A, które mogą wpływać na aktywność katalityczną enzymu DNMT3A, w tym -448G/A SNP (Zhao et al., 2012). W genie DNMT3B zidentyfikowano dwadzieścia jeden polimorfizmów, w tym SNP -149 C/T i SNP -579 G/T (Zhang i in., 2015).

W poprzednim badaniu w Szpitalu Uniwersyteckim Assiut (AbdelKader i in., 2018) allel A wariantu SNP DNMT3A -448 G/A był istotnie związany ze zmniejszonym ryzykiem pierwotnej ITP, podczas gdy allel T wariantu SNP DNMT3B -149C/T było istotnie związane z prawie dwukrotnym wzrostem ryzyka pierwotnej ITP. Jednak mechanizm leżący u podstaw tego związku nie został zbadany. Autorzy zalecili zbadanie ekspresji mRNA genów DNMT, aktywności enzymatycznej metylotransferaz DNA, ilościowego oznaczenia globalnego metylowanego DNA i/lub statusu metylacji genów wrażliwych na metylację zaangażowanych w pierwotną patogenezę ITP, aby zrozumieć ten związek.