Effekt av DNMT SNP på DNA-metylering i primär ITP

Immuntrombocytopeni (ITP), är en immunmedierad förvärvad sjukdom hos vuxna och barn som kännetecknas av övergående eller ihållande minskning av trombocytantalet och, beroende på graden av trombocytopeni, ökad risk för blödning (Rodeghiero et al., 2009). Internationella riktlinjer definierar trombocytopeni som ett perifert blodplättsantal mindre än 100 000/uL (Raj, 2017). Trombocytvärden mellan 100 000/uL och 150 000/uL återfinns ofta hos till synes friska personer (Adibi et al., 2007) och denna tröskel minskar oron över den milda "fysiologiska" trombocytopenin i samband med graviditet (Neunert et al., 2011).

Immun trombocytopeni kan vara primär eller sekundär. Primär ITP är en diagnos av uteslutning. Sekundär ITP uppstår på grund av en underliggande sjukdom/tillstånd. Orsaker till sekundär ITP inkluderar infektion (CMV, Helicobacter pylori, HCV, HIV, Varicella zoster), systemisk lupus erythematosus, antifosfolipidsyndrom, läkemedelsinducerade, lymfoproliferativa störningar, efter benmärgstransplantation och efter vaccination (Neunert et al.), 2011. .

Primär ITP är en förvärvad autoimmun sjukdom som orsakar både ökad destruktion av blodplättar och otillräcklig trombocytproduktion. Mer än en mekanism kan bidra till detta inklusive autoreaktiva B-lymfocyter, Th1/Tc1-polarisering, T-cellsmedierad trombocytlys och onormalt cirkulerande Treg-celler. DNA-metylering kan också delta i patofysiologin för ITP (Semple et al., 2010, Wang et al., 2011).

DNA-metylering är ett ärftligt, stabilt och även reversibelt sätt att modifiera DNA; den kan reglera genuttryck utan att ändra nukleotidsekvenserna (Huiyuan et al., 2013). DNA-metylering medieras av DNA-metyltransferaser (DNMT). Det finns fem medlemmar i DNMT-gruppen inklusive DNMT3A och DNMT3B (Okano et al., 1999). DNMT3A och DNMT3B katalyserar de novo-metylering och det är viktigt för att etablera DNA-metyleringsmönster inom embryot och under fosterutvecklingen (Sawalha, 2008).

DNA-metyleringsstatus tar del i regleringen av immunsvaret, förlusten av metyleringsmönster i immunceller kommer att resultera i autoimmun sjukdom genom att inducera avvikande genuttryck. ITP är en autoimmun sjukdom med många immunbrister med onormal DNA-metylering involverad i sjukdomens etiologi (Huiyuan et al., 2013). Chen et al., 2011, drog slutsatsen att avvikande DNA-metylering kan delta i patogenesen av ITP genom att kvantifiera metylcytosinkoncentrationen av genomiskt DNA. De hittade hypometyleringsmönster i CD4 T-celler hos ITP-patienter.

DNMT3A och DNMT3B DNA-metyltransferaser kodas av olika gener på distinkta kromosomer (Sawalha, 2008). Det finns många enkelnukleotidpolymorfier (SNP) i DNMT3A-genen som kan påverka katalytisk aktivitet hos DNMT3A-enzymet, inklusive -448G/A SNP (Zhao et al., 2012). Tjugoen polymorfismer har identifierats i DNMT3B-genen inklusive -149 C/T SNP och -579 G/T SNP (Zhang et al., 2015).

I en tidigare studie vid Assiut University Hospital (AbdelKader et al., 2018) var DNMT3A -448 G/A SNP variant A-allelen signifikant associerad med minskad risk för primär ITP, medan DNMT3B -149C/T SNP-variant T-allel var signifikant associerad med nästan dubbelt så stor risk för primär ITP. Den underliggande mekanismen bakom denna association undersöktes dock inte. Författare rekommenderade att studera mRNA-uttryck av DNMT-gener, enzymatisk aktivitet av DNA-metyltransferaser, kvantifiering av globalt metylerat DNA och/eller metyleringsstatus för metyleringskänsliga gener involverade i primär ITP-patogenes för att förstå detta samband.