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Effetto degli SNP DNMT sulla metilazione del DNA nell'ITP primario

23 settembre 2019 aggiornato da: Mennat-Allah Abdelnasser Mahmoud Ahmed, Assiut University

Effetto dei polimorfismi a singolo nucleotide della DNA metiltransferasi 3A-448 G/A e 3B-149 C/T sulla metilazione globale del DNA nella trombocitopenia immunitaria primaria

  • Per confrontare lo stato di metilazione del DNA globale tra pazienti con ITP e soggetti sani.
  • Per determinare l'effetto dell'allele A variante DNMT3A -448 G/A SNP e dell'allele T variante DNMT3B -149C/T SNP sulla metilazione globale del DNA sia nei pazienti ITP che nei soggetti di controllo sani.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

La trombocitopenia immunitaria (ITP) è una malattia acquisita immuno-mediata di adulti e bambini caratterizzata da diminuzione transitoria o persistente della conta piastrinica e, a seconda del grado di trombocitopenia, aumento del rischio di sanguinamento (Rodeghiero et al., 2009). Le linee guida internazionali definiscono la trombocitopenia come una conta piastrinica nel sangue periferico inferiore a 100.000/uL (Raj, 2017). Valori di conta piastrinica compresi tra 100.000/uL e 150.000/uL si riscontrano frequentemente in persone apparentemente sane (Adibi et al., 2007) e questa soglia riduce la preoccupazione per la lieve trombocitopenia "fisiologica" associata alla gravidanza (Neunert et al., 2011).

La trombocitopenia immunitaria può essere primaria o secondaria. La PTI primaria è una diagnosi di esclusione. La PTI secondaria si verifica a causa di malattie/condizioni sottostanti. Le cause di PTI secondaria includono infezione (CMV, Helicobacter pylori, HCV, HIV, Varicella zoster), lupus eritematoso sistemico, sindrome antifosfolipidica, disturbi linfoproliferativi indotti da farmaci, post trapianto di midollo osseo e post vaccinazione (Neunert et al., 2011). .

La PTI primaria è una malattia autoimmune acquisita che causa sia un aumento della distruzione piastrinica che una produzione insufficiente di piastrine. Più di un meccanismo potrebbe contribuire a questo, compresi i linfociti B autoreattivi, la polarizzazione Th1/Tc1, la lisi piastrinica mediata dalle cellule T e le cellule Treg circolanti anomale. Inoltre, la metilazione del DNA può partecipare alla fisiopatologia dell'ITP (Semple et al., 2010, Wang et al., 2011).

La metilazione del DNA è un modo ereditabile, stabile e anche reversibile di modificazione del DNA; può regolare l'espressione genica senza modificare le sequenze nucleotidiche (Huiyuan et al., 2013). La metilazione del DNA è mediata dalle DNA metiltransferasi (DNMT). Ci sono cinque membri nel gruppo DNMT inclusi DNMT3A e DNMT3B (Okano et al., 1999). DNMT3A e DNMT3B catalizzano la metilazione de novo ed è importante nella creazione di modelli di metilazione del DNA all'interno dell'embrione e durante lo sviluppo fetale (Sawalha, 2008).

Lo stato di metilazione del DNA prende parte alla regolazione della risposta immunitaria, la perdita del modello di metilazione nelle cellule immunitarie si tradurrà in una malattia autoimmune inducendo un'espressione genica aberrante. L'ITP è una malattia autoimmune con molte deficienze immunitarie con metilazione del DNA anomala coinvolta nell'eziologia della malattia (Huiyuan et al., 2013). Chen et al., 2011, hanno concluso che la metilazione aberrante del DNA può prendere parte alla patogenesi dell'ITP quantificando la concentrazione di metilcitosina del DNA genomico. Hanno trovato un modello di ipometilazione nelle cellule T CD4 dei pazienti con ITP.

Le DNA metiltransferasi DNMT3A e DNMT3B sono codificate da geni diversi su cromosomi distinti (Sawalha, 2008). Ci sono molti polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) nel gene DNMT3A che possono influenzare l'attività catalitica dell'enzima DNMT3A, incluso -448G/A SNP (Zhao et al., 2012). Ventuno polimorfismi sono stati identificati nel gene DNMT3B tra cui -149 C/T SNP e -579 G/T SNP (Zhang et al., 2015).

In uno studio precedente presso l'Assiut University Hospital (AbdelKader et al., 2018), l'allele variante A DNMT3A -448 G/A SNP era significativamente associato a un ridotto rischio di ITP primaria, mentre, l'allele T variante DNMT3B -149C/T SNP era significativamente associato a un aumento quasi doppio del rischio di ITP primaria. Tuttavia, il meccanismo alla base di questa associazione non è stato studiato. Gli autori hanno raccomandato di studiare l'espressione dell'mRNA dei geni DNMT, l'attività enzimatica delle DNA metiltransferasi, la quantificazione del DNA metilato globale e/o lo stato di metilazione dei geni sensibili alla metilazione coinvolti nella patogenesi primaria dell'ITP per comprendere questa associazione.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

90

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 75 anni (ADULTO, ANZIANO_ADULTO)

Accetta volontari sani

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

: 60 pazienti con ITP primaria e 30 soggetti sani di controllo appaiati per età e sesso .

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • . Pazienti egiziani con trombocitopenia isolata, nessuna organomegalia o linfoadenopatia, nessun sintomo costituzionale (dolori alle ossa, perdita di peso e sudorazione notturna) e nessuna storia di precedente assunzione di farmaci (chinino, eparina).

Criteri di esclusione:

  • Condizioni/malattie associate a ITP secondaria.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
pazienti con ITP primaria.
60 pazienti con ITP primaria .
La metilazione globale del DNA sarà quantificata nei campioni di DNA mediante colorimetria
soggetti sani.
30 soggetti sani di controllo abbinati per età e sesso .
La metilazione globale del DNA sarà quantificata nei campioni di DNA mediante colorimetria

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Confronto dello stato di metilazione del DNA globale tra pazienti con ITP e soggetti sani.
Lasso di tempo: linea di base.
Per comprendere il meccanismo alla base dell'associazione dell'allele DNMT3A -448 G/A SNP variante A con ridotto rischio di ITP primaria e DNMT3B -149C/T SNP variante T-allele con aumentato rischio di ITP primaria che è stato osservato in uno studio precedente in Ospedale universitario di Assiut (AbdelKader et al., 2018).
linea di base.

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Direttore dello studio: Heba A Abdel-Hafeez, Professor, Clinical Pathology Department in Assuit University Hospital

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (ANTICIPATO)

1 dicembre 2019

Completamento primario (ANTICIPATO)

1 ottobre 2021

Completamento dello studio (ANTICIPATO)

1 dicembre 2021

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

23 settembre 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

23 settembre 2019

Primo Inserito (EFFETTIVO)

24 settembre 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)

24 settembre 2019

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

23 settembre 2019

Ultimo verificato

1 settembre 2019

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

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