Herinterpretatie van CNV met onbekende betekenis: een 5-jarige retrospectieve analyse (ReAC)

Array-CGH is een eerstelijnstechniek bij veel genetische indicaties in zowel prenatale als postnatale settings. Hiermee kunnen chromosomale herschikkingen (bijvoorbeeld duplicatie of deletie) routinematig worden gedetecteerd. De interpretatie en classificatie van deze exemplaarnummervariaties of CNV's is essentieel maar complex. Het vereist een systematische en methodische analyse van de variatie in de context van de wetenschappelijke literatuur. Wanneer deze revisies niet voldoen aan de criteria voor pathogeniteit of goedaardigheid, worden ze variatie van onbekende significantie (of VUS) genoemd. Zij zijn goed voor een aanzienlijk deel van de revisies tot 75% (Palmer et al., 2013).

De detectie van VUS maakt in de meeste gevallen geen diagnose mogelijk en vereist vaak het gebruik van andere, kostbare technieken. De impact op de mens kan ook aanzienlijk zijn zonder mogelijke erfelijkheidsadvisering (bijvoorbeeld in het kader van een toekomstige zwangerschap). Heranalyse van een VUS is om ten minste twee redenen van groot belang: (1) de eerste maakt het mogelijk om, als het als goedaardig wordt geclassificeerd, het onderzoek naar de variant af te sluiten, andere aanknopingspunten te overwegen zonder bijbedoelingen, en om de patiënt gerust te stellen. patiënt over de afwezigheid van pathogeniteit van de variant. (2) als de VUS uiteindelijk pathogeen is, maakt dit het mogelijk om de ziekte voor de patiënt te benoemen, erfelijkheidsadvisering te specificeren, verder langdurig en kostbaar onderzoek te vermijden en eventueel een behandeling voor te stellen.

Momenteel kan VUS op verzoek van de voorschrijvende arts of eventueel een andere arts door het laboratorium opnieuw worden geanalyseerd. Er is momenteel echter geen systematische heranalyseprocedure.

Hoewel deze variaties van onbekende betekenissen frequent voorkomen en een belangrijk probleem vormen, is er, voorzover ons bekend, geen systematisch databaseonderzoek uitgevoerd. Desalniettemin zijn er gedurende een kortere periode of op ad-hocbasis soortgelijke werkzaamheden uitgevoerd, waaruit blijkt dat er belangstelling is voor dit soort benaderingen (Palmer et al., 2014).

Het lijkt inderdaad essentieel om het belang te bepalen van het opnieuw analyseren van dergelijke variaties op verschillende manieren: diagnostisch, economisch en menselijk.