Genfortolkning af CNV med ukendt betydning: en 5-årig retrospektiv analyse (ReAC)

Array-CGH er en frontlinjeteknik i mange genetiske indikationer i både prænatale og postnatale omgivelser. Det tillader påvisning af kromosomale omlejringer (duplikering eller sletning for eksempel) rutinemæssigt. Fortolkningen og klassificeringen af ​​disse kopinummervariationer eller CNV'er er væsentlig, men kompleks. Det kræver en systematisk og metodisk analyse af variationen i sammenhæng med den videnskabelige litteratur. Når disse revisioner ikke opfylder hverken patogenicitets- eller benignitetskriterier, omtales de som variation af ukendt betydning (eller VUS). De tegner sig for en betydelig del af revisionerne op til 75 % (Palmer et al., 2013).

Påvisningen af ​​VUS giver i de fleste tilfælde ikke mulighed for en diagnose og kræver ofte brug af andre, dyre teknikker. Den menneskelige påvirkning kan også være betydelig i mangel af mulig genetisk rådgivning (f.eks. i forbindelse med en fremtidig graviditet). Reanalyse af en VUS er af stor interesse af mindst to grunde: (1) den første, hvis den er klassificeret som godartet, gør det muligt at afslutte undersøgelsen af ​​varianten, at overveje andre tilledninger uden bagtanker og at berolige patient om fraværet af patogenicitet af varianten. (2) hvis VUS i sidste ende er sygdomsfremkaldende, gør dette det muligt at navngive sygdommen for patienten, at specificere genetisk rådgivning, for at undgå yderligere lang og bekostelig undersøgelse og eventuelt at foreslå behandling.

I øjeblikket kan VUS genanalyseres af laboratoriet efter anmodning fra den ordinerende læge eller eventuelt en anden læge. Der er dog i øjeblikket ingen systematisk reanalyseprocedure.

Selvom disse variationer af ukendte betydninger er hyppige og repræsenterer et vigtigt spørgsmål, er der så vidt vides ikke blevet udført nogen systematisk databaseundersøgelse. Noget lignende arbejde er ikke desto mindre blevet udført over en kortere periode eller på ad hoc basis, hvilket viser interesse for denne type tilgang (Palmer et al., 2014).

Det forekommer faktisk væsentligt at bestemme interessen for at genanalysere sådanne variationer på flere måder: diagnostisk, økonomisk og menneskelig.