Reinterpretace CNV s neznámým významem: 5letá retrospektivní analýza (ReAC)

Array-CGH je přední technika v mnoha genetických indikacích v prenatálním i postnatálním prostředí. Umožňuje rutinně detekovat chromozomální přestavby (například duplikaci nebo deleci). Interpretace a klasifikace těchto variací počtu kopií nebo CNV je zásadní, ale složitá. Vyžaduje systematickou a metodickou analýzu odchylek v kontextu vědecké literatury. Pokud tyto revize nesplňují kritéria patogenity ani benignosti, označují se jako variace neznámého významu (nebo VUS). Tvoří významný podíl revizí až 75 % (Palmer et al., 2013).

Detekce VUS ve většině případů neumožňuje diagnózu a často vyžaduje použití jiných, nákladných technik. Dopad na člověka může být také významný při absenci možného genetického poradenství (např. v souvislosti s budoucím těhotenstvím). Reanalýza VUS je velmi zajímavá minimálně ze dvou důvodů: (1) první, pokud je klasifikován jako benigní, umožňuje uzavřít vyšetřování varianty, zvážit další vodítka bez postranních úmyslů a uklidnit pacienta o absenci patogenity varianty. (2) pokud je VUS v konečném důsledku patogenní, umožňuje to pacientovi pojmenovat nemoc, upřesnit genetické poradenství, vyhnout se dalšímu dlouhému a nákladnému vyšetřování a případně navrhnout léčbu.

V současné době může být VUS znovu analyzován laboratoří na žádost předepisujícího lékaře, případně jiného lékaře. V současnosti však není zaveden žádný postup systematické opětovné analýzy.

Ačkoli jsou tyto variace neznámých významů časté a představují důležitý problém, podle našich znalostí nebyla provedena žádná systematická databázová studie. Některé podobné práce byly nicméně provedeny během kratšího období nebo na základě ad hoc, což prokázalo zájem o tento typ přístupu (Palmer et al., 2014).

Zdá se, že je nezbytné určit zájem na opětovné analýze takových variací v několika režimech: diagnostickém, ekonomickém a lidském.