Neuinterpretation von CNV mit unbekannter Bedeutung: eine 5-Jahres-Retrospektivanalyse (ReAC)

Array-CGH ist eine Technik an vorderster Front bei vielen genetischen Indikationen sowohl im pränatalen als auch im postnatalen Umfeld. Es ermöglicht den routinemäßigen Nachweis chromosomaler Umlagerungen (z. B. Duplikation oder Deletion). Die Interpretation und Klassifizierung dieser Kopienzahlvariationen oder CNVs ist wesentlich, aber komplex. Es erfordert eine systematische und methodische Analyse der Variation im Kontext der wissenschaftlichen Literatur. Wenn diese Revisionen weder die Pathogenitäts- noch die Benignitätskriterien erfüllen, werden sie als Variation unbekannter Signifikanz (oder VUS) bezeichnet. Sie machen mit bis zu 75 % einen erheblichen Anteil der Revisionen aus (Palmer et al., 2013).

Der Nachweis von VUS lässt in den meisten Fällen keine Diagnose zu und erfordert oft den Einsatz anderer, kostspieliger Techniken. Die Auswirkungen auf den Menschen können auch ohne mögliche genetische Beratung (z. B. im Zusammenhang mit einer zukünftigen Schwangerschaft) erheblich sein. Die erneute Analyse eines VUS ist aus mindestens zwei Gründen von großem Interesse: (1) Der erste, wenn er als gutartig eingestuft wird, ermöglicht es, die Untersuchung der Variante abzuschließen, andere Hinweise ohne Hintergedanken in Betracht zu ziehen und den Patienten zu beruhigen Patient über das Fehlen einer Pathogenität der Variante. (2) wenn der VUS letztendlich pathogen ist, ermöglicht dies, die Krankheit für den Patienten zu benennen, eine genetische Beratung festzulegen, weitere langwierige und kostspielige Untersuchungen zu vermeiden und möglicherweise einen Behandlungsvorschlag zu machen.

Derzeit können VUS vom Labor auf Anfrage des verschreibenden Arztes oder möglicherweise eines anderen Arztes erneut analysiert werden. Allerdings gibt es derzeit kein systematisches Reanalyseverfahren.

Obwohl diese Variationen unbekannter Bedeutungen häufig vorkommen und ein wichtiges Problem darstellen, wurde unseres Wissens keine systematische Datenbankstudie durchgeführt. Einige ähnliche Arbeiten wurden jedoch über einen kürzeren Zeitraum oder auf Ad-hoc-Basis durchgeführt, was ein Interesse an dieser Art von Ansatz zeigt (Palmer et al., 2014).

In der Tat scheint es wesentlich zu sein, das Interesse an der Neuanalyse solcher Variationen auf verschiedene Arten festzustellen: diagnostisch, wirtschaftlich und menschlich.