Переосмысление CNV с неизвестным значением: 5-летний ретроспективный анализ (ReAC)

Array-CGH является передовым методом при многих генетических показаниях как в пренатальном, так и в постнатальном периоде. Он позволяет обнаруживать хромосомные перестройки (например, дупликацию или делецию) в рутинных условиях. Интерпретация и классификация этих вариаций числа копий или CNV важны, но сложны. Это требует систематического и методического анализа вариации в контексте научной литературы. Когда эти ревизии не соответствуют ни критериям патогенности, ни критериям доброкачественности, они называются вариациями неизвестной значимости (или VUS). На их долю приходится значительная доля изменений до 75% (Palmer et al., 2013).

Обнаружение ВУС в большинстве случаев не позволяет поставить диагноз и часто требует использования других дорогостоящих методов. Воздействие человека также может быть значительным при отсутствии возможного генетического консультирования (например, в контексте будущей беременности). Повторный анализ ВУС представляет большой интерес, по крайней мере, по двум причинам: (1) первая, если она классифицируется как доброкачественная, позволяет закрыть исследование варианта, рассмотреть другие отведения без скрытых мотивов и успокоить больного об отсутствии патогенности варианта. (2) если ВУС является в конечном счете патогенным, это позволяет назвать болезнь для пациента, назначить генетическое консультирование, избежать дальнейшего длительного и дорогостоящего обследования и, возможно, предложить лечение.

В настоящее время VUS может быть повторно проанализирован в лаборатории по запросу лечащего врача или, возможно, другого врача. Однако в настоящее время отсутствует процедура систематического повторного анализа.

Хотя эти вариации неизвестных значений встречаются часто и представляют собой важную проблему, насколько нам известно, систематического изучения базы данных не проводилось. Тем не менее, некоторая аналогичная работа была проведена в течение более короткого периода времени или на разовой основе, что свидетельствует об интересе к этому типу подхода (Palmer et al., 2014).

Действительно, представляется важным определить интерес к повторному анализу таких вариаций в нескольких режимах: диагностическом, экономическом и человеческом.