Reinterpretazione di CNV con significato sconosciuto: un'analisi retrospettiva di 5 anni (ReAC)

Array-CGH è una tecnica di prima linea in molte indicazioni genetiche sia in ambito prenatale che postnatale. Permette il rilevamento di riarrangiamenti cromosomici (duplicazione o delezione per esempio) nella routine. L'interpretazione e la classificazione di queste variazioni del numero di copie o CNV è essenziale ma complessa. Richiede un'analisi sistematica e metodica della variazione nel contesto della letteratura scientifica. Quando queste revisioni non soddisfano né i criteri di patogenicità né quelli di benignità, vengono indicate come variazione di significato sconosciuto (o VUS). Rappresentano una percentuale significativa delle revisioni fino al 75% (Palmer et al., 2013).

Il rilevamento di VUS, nella maggior parte dei casi, non consente una diagnosi e spesso richiede l'uso di altre tecniche costose. L'impatto umano può anche essere significativo in assenza di una possibile consulenza genetica (ad esempio nel contesto di una futura gravidanza). La rianalisi di un VUS è di grande interesse per almeno due ragioni: (1) la prima, se classificata come benigna, permette di chiudere l'indagine sulla variante, di prendere in considerazione altre piste senza secondi fini e di rassicurare il paziente circa l'assenza di patogenicità della variante. (2) se la VUS è in ultima analisi patogena, ciò rende possibile nominare la malattia per il paziente, specificare la consulenza genetica, evitare ulteriori indagini lunghe e costose ed eventualmente proporre un trattamento.

Attualmente, la VUS può essere rianalizzata dal laboratorio su richiesta del medico prescrittore o eventualmente di un altro medico. Tuttavia, attualmente non è in atto alcuna procedura di rianalisi sistematica.

Sebbene queste variazioni di significati sconosciuti siano frequenti e rappresentino un problema importante, a nostra conoscenza non è stato effettuato alcuno studio sistematico di database. Alcuni lavori simili sono stati tuttavia svolti per un periodo più breve o su base ad hoc, mostrando un interesse per questo tipo di approccio (Palmer et al., 2014).

In effetti, sembra essenziale determinare l'interesse di rianalizzare tali variazioni in diverse modalità: diagnostiche, economiche e umane.