Screening van gevoeligheidsgenen voor door APAP geïnduceerde door drugs geïnduceerde leverbeschadiging bij de Chinese populatie: een case-control onderzoek (PAIN)

I. Studieobject

(i) In de groepsstrategie: continu in groep.

(ii) Groeperingsstrategie:

1. Casusgroep.

   Inclusiecriteria:

   • Een duidelijke geschiedenis van inname van acetaminophen (of acetaminophen-bevattende medicijnen).
   • Plasma en/of urinetesten voor acetaminophencomponenten als de geschiedenis van inname onduidelijk is.
   • Monitoring van alanineaminotransferase (ALT) of aspartaataminotransferase (AST) ≥ 1000 IE/L op elk moment na APAP -toediening en Roussel Causality Assessment Method (RUCAM) score> 6
   • Leeftijd ≥ 14 jaar oud.
   • Het onderwerp of de Guardian stemt ermee in om aan dit project deel te nemen en ondertekent een geïnformeerde toestemmingsformulier.

   Uitsluitingscriteria: • Het gebruik van geneesmiddelen waarvoor frequentie van bijwerkingen op leverschade wordt gedefinieerd als "gemeenschappelijk of heel gebruikelijk" (≥1%) in de instructies.

   • Gelijktijdig gebruik van kruiden die duidelijk vatbaar zijn voor leverschade (zie lijst met definities in de bijlage).
   • Een bekende duidelijke oorzaak van leverschade hebben: actieve virale hepatitis; alcoholische leverziekte; auto -immuun leverziekte; primaire of secundaire levertumoren; en andere onderliggende leverziekte die de leverfunctie heeft beïnvloed.
   • Degenen die geen volledige algemene informatie en klinische informatie verstrekken.
   • Onderwerpen of voogden die niet instemmen om dit project te zien, ondertekenen het geïnformeerde toestemmingsformulier niet.

2. Controlegroep

   Inclusiecriteria:

   • Een duidelijke geschiedenis van inname van acetaminophen (of acetaminophen-bevattende medicijnen).
   • Plasma en/of urinetesten voor acetaminophencomponenten als de geschiedenis van APAP -inname onduidelijk is.
   • Leeftijd: ≥ 14 jaar oud.
   • Het onderwerp of de Guardian stemt ermee in om aan dit project deel te nemen en ondertekent een geïnformeerde toestemmingsformulier.

   Uitsluitingscriteria: • Het gebruik van geneesmiddelen waarvoor frequentie van bijwerkingen op leverschade wordt gedefinieerd als "gemeenschappelijk of heel gebruikelijk" (≥1%) in de instructies.

   • Gelijktijdig gebruik van kruiden die duidelijk vatbaar zijn voor leverschade (zie lijst met definities in de bijlage).

   • Er zijn bekende duidelijke oorzaken van leverschade (zie bijgevoegde lijst met definities): actieve virale hepatitis; alcoholische leverziekte; auto -immuun leverziekte; primaire of secundaire levertumoren; en andere onderliggende leverziekte die de leverfunctie heeft beïnvloed.

   • Degenen die geen volledige algemene informatie en klinische informatie verstrekken.

   • Onderwerpen of voogden die niet akkoord gaan om dit project te zien, ondertekenen niet het geïnformeerde toestemmingsformulier.

   (iii) matching -strategie.

   Matching Principle:

   • Deelnemers aan geval en controle werden gekoppeld aan de ingenomen dosis, duur van toediening van antidote en de duur van de maagspoeling.

   • 1: 2 matching.

   Verwarrende factoren:

   • Dosisinname: patiëntrapport (primair) + bloedconcentratietest (secundair)

   • Gebruikstijd tegengif: <4 uur, 4-24 uur,> 24 uur

   • Maagstroomtijd: <1 uur, ≥1 uur

   (iv) Schatting van de steekproefomvang

   Parameterbron:

   • Focus op het metaboliseren van enzymen van geneesmiddelen, immunogene loci
   • De verdeling van APAP-afhankelijke DILI-gevoeligheids allelfrequenties in Aziatische populaties op basis van literatuurbevindingen.

2. Parameterwaarde ：

• Hypothese: gen-omgeving.
• Uitkomstmodel: basisrisico P0 = 0,10.
• Genetisch effect = 1,2,
• Vermogen = 0,8, type I foutpercentage = 0,05 (tweezijdig).

Resultaten: De steekproefgrootte van de casus moet 113 zijn met een controleproefgrootte van 226.

II. Blootstelling/risicofactoren.

(i) Definitie. Blootstellingsfactoren verwijzen naar gevoeligheidsgenen voor DILI veroorzaakt door APAP, waaronder ：

• 2.036.060 markersites
• Human Leukocyte Antigen (HLA): HLA-A en HLA-B Immune Loci.
• Genotype-imputatie.

(ii) Meetmethoden.

1. Neem kandidaat -genstrategie aan. De kandidaat -genstrategie is een flexibele benadering met lage kosten, relatief eenvoudige kwaliteitscontrole en statistische analyse, en een relatief eenvoudige biologische verklaring achter de associatie omdat de geselecteerde genen allemaal belangrijk zijn voor de ziekte.
2. Met behulp van de hypothese-gedreven benadering. Gezien de hypothese dat sommige specifieke genen kunnen worden geassocieerd met het onderzoeksresultaat, werd een op sequentie gebaseerde benadering gekozen voor de analyse van potentieel functionele single nucleotide polymorfisme (SNP's), het selecteren van SNP's die meer kans hebben op functionele waarde geassocieerd met geneesmiddelen-metaboliserende enzymen, immunogene loci, geneesmiddelenproducten, geneesmiddelen, geneesmiddelen, geneesmiddelen die recidives en andere koppelingen bevinden, met name die in kandidaten zijn, in het kandidaat van de kandidaat-gegenen die in het kandidaat zijn, in het bijzonder in kandidaat-gegenes die worden geassocieerd met candides van geneesmiddelen.
3. Aangepaste chips gebruiken. De uitgebreide multi-etnische genotyperingsarray (megaex), een microarray gebouwd door consortia met verbeterde mogelijkheden om complexe ziekten in verschillende populaties te begrijpen. Deze commercieel verkrijgbare microarray bepaalt de individuele geneesmiddelenrespons door de detectie van 2.036.060 markerloci. Het is ook een aanvulling op HLA-A en HLA-B Immuun Loci-informatie om genotype-imputatie te voltooien.

Iii. Kwaliteitscontrole De studie heeft een strikte standaard testoperatieprocedure en relevante training wordt gegeven voor het personeel dat bij de test betrokken is vóór het begin van het experiment, en de test kan alleen worden uitgevoerd na het doorstaan ​​van de training. We hebben een kwaliteitscontrolecentrum met toegewijd personeel dat verantwoordelijk is voor de voortgang van het onderwerp en de gegevenskwaliteitscontrole. Een online digitaal randomisatieplatform en het beheer van informatie -entry -management is ingesteld op basis van de webserverterminal, die in staat is om tijdige case randomisatiegroepering en elektronisch klinisch case observatievorminformatie -invoer te vormen, en kan effectief en automatisch fouten controleren en corrigeren tijdens het procesinvoerproces. Dat wil zeggen, het helpt om de nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van de ingevoerde informatie te waarborgen en kan realtime gegevensbewaking voor de supervisors bieden. Bovendien zal deze studie het uitvoeren van experimenten en gegevensinvoer volgen.

IV. Gegevensbeheerplan

• Data Center: het gegevensbeheercentrum van de National Data Management Standard onderneemt werkbeheerwerkzaamheden.
• Gegevensbeheersysteem: REDCAP wordt gebruikt om elektronische casusrapportformulieren op te zetten voor online gegevensverzameling en -beheer.
• Gegevensverzameling: gegevensinvoer door onafhankelijke gegevensregistranten die niet betrokken zijn bij de studie in de lead -eenheid van de studies.
• Gegevensconsistentie Monitoring: monitoring van gegevensconsistentie door een onafhankelijke monitor van derden.
• Gegevensaudit en vergrendeling: gegevens worden gecontroleerd, gereinigd en vergrendeld door een speciale datamanager.

V. Statistisch analyseplan

(i) Hypothesetesten. H0: Geen verschil in genen tussen proefpersonen met en zonder leverschade na inname van APAP H1: significante genetische verschillen tussen proefpersonen met en zonder leverschade na inname van APAP

(ii) analytische strategieën.

• Continue variabelen werden beschreven als gemiddelde ± standaardafwijking (SD) of mediaan van interkwartielbereik (IQR), en verschillen tussen groepen werden geanalyseerd door twee-factor ANOVA of niet-parametrische tests. Categorische variabelen werden uitgedrukt als getallen en percentages en geanalyseerd door logistieke regressiemodellen.
• Hardy-Weinberg-evenwicht (HWE) tussen controlegroepen werd getest met behulp van de goodness-of-fit χ2-test. Met behulp van haplotype -analyseweergave （Haploview） 4.2 -software werd de haplotypegebied groep geselecteerd gezien de koppelingsonevenwicht tussen tags van enkele nucleotide polymorfismen (tagSNP's).
• Multivariate voorwaardelijke logistieke regressieanalyse werd uitgevoerd om de associatie tussen genotype en risico van DILI uit APAP te schatten door dominantieverhoudingen (OR's) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI's) met maagstam en gebruik tegengif als covariaten.
• Drie verschillende genetische modellen werden gebruikt om de rol van tagSNP's te synthetiseren. Softwarepakket voor Hardy-Weinberg Analysis (SHESE) Online programma werd gebruikt voor haplotype-analyse onder logistiek regressiemodel.
• Alle analyses werden uitgevoerd met behulp van statistieken is een krachtig statistisch softwareplatform (SPSS) voor Windows (versie 26.0 VS). Tweezijdige P-waarden <0,05 werden als statistisch significant beschouwd.