Badanie badań genów podatności na uszkodzenie wątroby indukowane przez APAP indukowane przez APAP uszkodzenie wątroby w populacji chińskiej: badanie kontroli przypadków (PAIN)

I. Obiekt badania

(i) do strategii grupowej: ciągły w grupie.

(ii) Strategia grupowania ：

1. Grupa przypadków.

   Kryteria włączenia ：

   • Wyraźna historia spożycia acetaminofenu (lub leków zawierających acetaminofen).
   • Testy osocza i/lub moczu pod kątem elementów acetaminofenu, jeśli historia spożycia jest niejasna.
   • Monitorowanie aminotransferazy alaniny (ALT) lub aminotransferazy asparaginianowej (AST) ≥ 1000 IU/L w dowolnym momencie po podaniu APAP i metodę oceny przyczynowej ROUSSEL (RUCAM)> 6
   • Wiek ≥ 14 lat.
   • Temat lub Guardian zgadza się wziąć udział w tym projekcie i podpisuje formularz świadomej zgody.

   Kryteria wykluczenia ： • Zastosowanie leków, dla których częstotliwość niepożądanych reakcji na uszkodzenie wątroby jest zdefiniowane jako „powszechne lub bardzo powszechne” (≥1%) w instrukcjach.

   • Współbieżne użycie ziół, które są wyraźnie podatne na uszkodzenia wątroby (patrz lista definicji w załączniku).
   • Mają znaną określoną przyczynę uszkodzenia wątroby: aktywne wirusowe zapalenie wątroby; alkoholowa choroba wątroby; Autoimmunologiczna choroba wątroby; pierwotne lub wtórne guzy wątroby; i inne leżące u podstaw choroby wątroby, które wpłynęły na funkcję wątroby.
   • Ci, którzy nie podają pełnych informacji ogólnych i informacji klinicznych.
   • Tematy lub opiekunowie, którzy nie zgadzają się zobaczyć ten projekt, nie podpisują formularza świadomej zgody.

2. Grupa kontrolna

   Kryteria włączenia ：

   • Wyraźna historia spożycia acetaminofenu (lub leków zawierających acetaminofen).
   • Testy osocza i/lub moczu dla składników acetaminofenu, jeśli historia spożycia APAP jest niejasna.
   • Wiek: ≥ 14 lat.
   • Temat lub Guardian zgadza się wziąć udział w tym projekcie i podpisuje formularz świadomej zgody.

   Kryteria wykluczenia ： • Zastosowanie leków, dla których częstotliwość niepożądanych reakcji na uszkodzenie wątroby jest zdefiniowane jako „powszechne lub bardzo powszechne” (≥1%) w instrukcjach.

   • Współbieżne użycie ziół, które są wyraźnie podatne na uszkodzenia wątroby (patrz lista definicji w załączniku).

   • Istnieją znane określone przyczyny uszkodzenia wątroby (patrz dołączona lista definicji): aktywne wirusowe zapalenie wątroby; alkoholowa choroba wątroby; Autoimmunologiczna choroba wątroby; pierwotne lub wtórne guzy wątroby; i inne leżące u podstaw choroby wątroby, które wpłynęły na funkcję wątroby.

   • Osoby, które nie podają pełnych informacji ogólnych i informacji klinicznych.

   • Tematy lub opiekunowie, którzy nie zgadzają się zobaczyć ten projekt, nie podpisują formularza świadomej zgody.

   (iii) Strategia dopasowywania.

   Zasada dopasowania ：

   • Uczestnicy przypadków i kontroli zostały dopasowane zgodnie z przyjmowaną dawką, czasem podawania antidotum i czasem trwania płukania żołądka.

   • Dopasowanie 1: 2.

   Czynniki mylące ：

   • Spożycie dawki: raport pacjenta (pierwotny) + test stężenia krwi (wtórny)

   • Czas używania antidotum: <4 godziny, 4-24 godziny,> 24 godziny

   • Czas płukania żołądka: <1 godzina, ≥1 godziny

   (iv) oszacowanie wielkości próby

   Źródło parametrów ：

   • Skoncentruj się na enzymach metabolizujących leki, loci immunogenne
   • Rozkład zależnych od APAP częstotliwości alleli podatności DILI w populacjach azjatyckich w oparciu o wyniki literatury.

2. Wartość parametru ：

• Hipoteza: gen-środowisko.
• Model wyniku: ryzyko podstawowe P0 = 0,10.
• Efekt genetyczny = 1,2,
• Moc = 0,8, stopa błędu typu I = 0,05 (dwustronny).

Wyniki ： Rozmiar próbki przypadku powinien wynosić 113 z kontrolą próbki 226.

Ii. Czynniki narażenia/ryzyka.

(i) Definicja. Czynniki narażenia odnoszą się do genów podatności DILI spowodowanych przez APAP, w tym ：

• 2 036,060 witryn markerów
• Ludzki antygen leukocytowy (HLA): loci immunologiczne HLA-A i HLA-B.
• Imputowanie genotypu.

(ii) Metody pomiarowe.

1. Przyjmij strategię genów kandydatów. Strategia genów kandydata jest elastycznym podejściem o niskim koszcie, stosunkowo prostej kontroli jakości i analizie statystycznej oraz stosunkowo łatwym wyjaśnieniem biologicznym stowarzyszenia, ponieważ wybrane geny są ważne dla choroby.
2. Stosując podejście oparte na hipotezie. Biorąc pod uwagę hipotezę, że niektóre specyficzne geny mogą być powiązane z wynikiem badania, wybrano podejście oparte na sekwencji do analizy potencjalnie funkcjonalnego polimorfizmu pojedynczego nukleotydowego (SNP), wybierając SNP, które częściej mają wartość funkcjonalną związaną z enzymami metabolizującymi leki, kodującymi enzymami regionami.
3. Za pomocą niestandardowych układów. Rozszerzona wieloetniczna tablica genotypowania (MegaEx), mikromacierz zbudowana przez konsorcję o zwiększonych możliwościach do zrozumienia złożonych chorób w różnych populacjach. Ta dostępna w handlu mikromacierzy określa indywidualną odpowiedź leku poprzez wykrycie 2 036 060 loci markerów. Uzupełnia także informacje o loci immunologicznych HLA-A i HLA-B w celu ukończenia impulsowania genotypu.

Iii. Kontrola jakości Badanie ma ścisłą standardową procedurę działania testowego i przeprowadzane jest odpowiednie szkolenie dla personelu zaangażowanego w test przed rozpoczęciem eksperymentu, a test można przeprowadzić dopiero po przejściu szkolenia. Mamy centrum kontroli jakości z oddanym personelem odpowiedzialnym za postęp podmiotu i kontrolę jakości danych. Online cyfrowa platforma randomizacji i system zarządzania wprowadzaniem informacji jest skonfigurowany na podstawie terminalu serwera WWW, który jest w stanie w odpowiednim czasie grupować randomizację i elektroniczną kliniczną obserwację przypadków wprowadzania informacji, i może skutecznie i automatycznie sprawdzać i poprawić błędy podczas procesu wprowadzania informacji. Oznacza to, że pomaga zapewnić dokładność i niezawodność wprowadzonych informacji oraz może zapewnić monitorowanie danych w czasie rzeczywistym dla przełożonych. Ponadto badanie to będzie monitorować prowadzenie eksperymentów i wprowadzania danych.

Iv. Plan zarządzania danymi

• Centrum danych: Centrum zarządzania danymi ustalonymi przez National Data Management Standard podejmuje prace zarządzania danymi.
• System zarządzania danymi: Redcap służy do ustanowienia elektronicznych formularzy raportów przypadków do gromadzenia i zarządzania danymi online.
• Zbieranie danych: Wprowadzanie danych przez niezależnych rejestrujących dane, które nie są zaangażowane w badanie w prowadzonej jednostce badania.
• Monitorowanie spójności danych: Monitorowanie spójności danych przez niezależny monitor stron trzecich.
• Audyt danych i blokowanie: dane są kontrolowane, czyszczone i zablokowane przez dedykowany menedżer danych.

V. Plan analizy statystycznej

(i) Testowanie hipotez. H0: Brak różnicy w genach między osobnikami z uszkodzeniem wątroby i bez niego po spożyciu APAP H1: znaczące różnice genetyczne między pacjentami z uszkodzeniem wątroby i bez niego po spożyciu APAP

(ii) Strategie analityczne.

• Zmienne ciągłe opisano jako średnią ± odchylenie standardowe (SD) lub medianę zakresu międzykwartylowego (IQR), a różnice między grupami analizowano za pomocą dwuskładnikowej ANOVA lub testów nieparametrycznych. Zmienne kategoryczne wyrażono jako liczby i wartości procentowe i analizowano za pomocą modeli regresji logistycznej.
• Równowaga Hardy-Weinberga (HWE) między grupami kontrolnymi przetestowano przy użyciu testu dobroci dopasowania χ2. Korzystając z widoku analizy haplotypu （oprogramowanie Haploview） 4.2, wybrano grupę regionu Haplotype, biorąc pod uwagę nierównowagę łączenia między znacznikami polimorfizmów pojedynczych nukleotydowych (TAGSNPS).
• Przeprowadzono wielowymiarową analizę warunkowej regresji logistycznej w celu oszacowania związku między genotypem a ryzykiem DILI z APAP według współczynników dominacji (ORS) i 95% przedziałów ufności (CI) z płukaniem żołądka i stosowaniem antidotum jako zmiennych towarzyszących.
• Do syntezy roli tagsnps zastosowano trzy różne modele genetyczne. Do analizy haplotypu zastosowano pakiet oprogramowania do analizy internetowego analizy Hardy-Weinberga (SHESIS) w ramach modelu regresji logistycznej.
• Wszystkie analizy przeprowadzono przy użyciu statystyki to potężna platforma oprogramowania statystycznego (SPSS) dla Windows (wersja 26.0 USA). Dwustronne wartości p <0,05 uznano za istotne statystycznie.