Kliniske kohorter i koronarsykdomssamarbeid (4C)

Innhenting av deltakersamtykke Pasienter ble invitert til å lese et studieinformasjonsark og oppfordret til å stille spørsmål om forskningen, hvoretter det ble bedt om skriftlig informert samtykke fra pasienter for: a) utfylling av et helsespørreskjema for baseline; b) fremskaffelse av en blodprøve for langtidslagring og analyse av DNA og biomarkører; c) uttrekk av pasientdata fra deres medisinske journaler; og d) kobling av pasientdata med nasjonale elektroniske helsejournaldatakilder (f.eks. kodede sykehusinnleggelser og prosedyrer, akuttinnleggelser og årsaksspesifikk dødelighet).

Prøvestørrelse For tilstrekkelig kraft til å oppdage relative risikoforskjeller på 1,2 ved et 5 % signifikansnivå var det nødvendig med minimum 3000 pasienter.

Baseline datainnsamling og tiltak Tre unike datakilder bidro til deltakerens baselinevurdering, som fant sted under pasientenes planlagte sykehusavtaler. Forskningstiltak (biologiske prøver og informasjon som ikke rutinemessig samles inn under pasientenes kliniske vurderinger) inkluderte 1) blodprøver for DNA- og biomarkøranalyse og et 2) kort helsespørreskjema utfylt av deltakerne (vanlig gjennomføringstid 5-10 minutter). Kliniske tiltak var 3) detaljert klinisk informasjon samlet inn som en del av vanlig behandling, hentet fra sykehusets elektroniske helsejournal inntil seks måneder etter baseline-vurderingen for å gi tid til prosedyre og testresultater å lastes opp til sykehusets elektroniske systemer.

A. Innsamling av forskningstiltak (i) Blodressurs Venøs blodprøvetaking og behandling av prøver Ikke-fastende blodprøver ble innhentet fra samtykkende deltakere, inkludert de hvor diagnosen angina senere ble utelukket, av personale som var trent i venepunktur under sykehuset avtale. Tjue milliliter blod ble tappet for å gjøre det mulig å oppnå et bredt spekter av forskningstiltak. Blod ble trukket inn i fem vacutainere i følgende rekkefølge: 2x 4,0 mL etylendiamintetraeddiksyrerør (EDTA), 1x 4,5 mL gel-separator litiumheparinrør (plasmaseparasjonsrør (PST)), 1x 5,0 mL gel serumseparatorrør (SST), 2x 4,0 mL og 1x 2,5 mL PAXgene ribonukleinsyre (RNA) blodrør (PreAnalytiX, Franklin Lakes, NJ). Vacutainere ble forsiktig snudd og snudd opp til fem ganger for å la tilsetningsstoffer blandes med blodet, merket og midlertidig lagret ved ca. 5°C frem til behandling. Dato og tidspunkt for innsamling ble registrert. Ulike blodfraksjoner ble separert ved sentrifugering ved 2500 g i 10 minutter. EDTA- og PST-prøver ble sentrifugert innen fire timer etter prøvetaking og SST-prøven fikk koagulere ved romtemperatur i 25-30 minutter før sentrifugering.

EDTA-plasma, heparinisert plasma, serum og hvite celler (buffy coat) ble delt opp i totalt nitten 0,5 ml 2D QR-kodede kryoviale rør egnet for langvarig kryokonservering. Hver kryovial ble individuelt logget i to ukoblede databaser ved hjelp av en enkeltrørs QR-kodeleser, plassert i et 96-posisjonsstativ og lagret lokalt ved -20 °C. PAXgene RNA-rør ble lagret som fullblod ved -20°C.

Innsamling av bukkal vattpinneprøve Pasienter som samtykket som ikke ga en venøs blodprøve ble invitert til å gi en bukkal vattpinne for påfølgende DNA-ekstraksjon. Prøver ble samlet ved å gni en steril vattpinne fast mot innsiden av deltakerens kinn eller mellom leppene og tannkjøttkanten i ett minutt. Vatten ble lagret i en steril beholder med en silikagelkapsel (Isohelix Dri-Capsules, Cell Projects Ltd) for å stabilisere prøven ved romtemperatur i opptil to år.

Prøver ble fraktet i temperaturkontrollerte forsendelsesbokser for langtidslagring i en biobank ved -80°C.

Ekstraksjon av DNA og enkelt-nukleotid polymorfisme (SNP) genotype-DNA ble ekstrahert fra 2556 individuelle deltakerprøver og genotyping av 51 CHD-spesifikke SNP-er identifisert i koronararteriesykdom Genome wide Replication and Meta-analyse (CARDIoGRAM PlusC4D) ble fullført, i henhold til spesifikasjonen , av et selskap med spesialiserte tjenester for utvinning av DNA og genotyping.

Biomarkører og metabolomisk profilering av pasienter. Etterforskerne foreslår å måle rutinemessig innsamlede og nye markører som virker mest lovende for klinisk prediktiv verdi, inkludert N-terminalt hjerne natriuretisk peptid (NT-BNP), høysensitivt C-reaktivt protein (hs-CRP) , apolipoprotein A1 (apoA1), apolipoprotein B (apoB), lipoprotein A (Lp(a)), og cystatin C.

(ii) Baseline helsespørreskjema Alle deltakerne ble invitert til å fylle ut et spørreskjema for å fastslå eller validere deltakernes kjønn, utdanningsnivå, etnisitet og helse. Generell helsefunksjon ble vurdert ved hjelp av EQ-5D, (http://www.euroqol.org/) et 5-element standardisert mål på helseutfall. Funksjonelle brystsmerter ble bestemt ved hjelp av Rose angina spørreskjema og angina alvorlighetsgrad ved bruk av Canadian Cardiovascular Society (CCS) klassifiseringen. Symptomer på depresjon ble vurdert ved hjelp av Patient Health Questionnaire-9 (PHQ-9), som scorer hvert av de ni diagnostiske og statistiske manualene for psykiske lidelser (DSM-IV 4th Edition, American Psychiatric Association) kriteriene for depresjon i PRIME-MD (Primary Care Evaluation of Mental Disorders screening spørreskjema for depressive symptomer) diagnostisk instrument for vanlige psykiske lidelser. Angst ble vurdert ved å bruke 7-elements Generalized Anxiety Disorder (GAD-7) skalaen, et selvrapportert mål for screening og kvantifisering av alvorlighetsgraden av generalisert angstlidelse.

(iii) Utvidet fysisk undersøkelse og mål oppnådd i delstudie Ytterligere mål oppnådd fra en undergruppe av deltakere inkluderte en seksti-minutters fysisk undersøkelse (antropometriske mål, lungefunksjon, aortablodtrykk, pulsbølge [augmentation]-indeks, pulsbølgehastighet og ankel brachial indeks), 31-timers ambulant EKG, tri-aksial akselerometri og søvnmål. Deltakere i delstudien fullførte også et utvidet helsespørreskjema som inkluderte spørsmål om kosthold og søvn.

B. Uttrekk av klinisk informasjon fra den elektroniske journalen Trente ekstraktorer gjennomgikk sykehusdatabaser og registrerte detaljert klinisk informasjon på standardiserte saksrapportskjemaer. Avhengig av klinikk eller sykehus ble forskjellige kliniske systemer søkt for å manuelt trekke ut data som ikke kunne lastes ned eller eksporteres som en datafil. Informasjon inkluderte årsak(er) for henvisning, historie med brystsmerter, legeregistrerte risikofaktorer for koronararteriesykdom, tidligere diagnostisert sykehistorie, nåværende medisinering og testresultater.

Alle deltakerne gjennomgikk et hvilende 12-avlednings elektrokardiogram (EKG) som en del av deres rutinemessige kliniske vurdering. En treningstoleransetest (ETT) ble utført av en erfaren hjerteelektrofysiolog på sykehus som utførte ETTs for rutinemessig vurdering av brystsmerter. ETT fulgte den modifiserte Bruce-protokollen (Bruce, RA, 1963) og ble utført med samtidig 12-avlednings elektrokardiografi.

Data ble manuelt lagt inn i en forskningsdatabase ved studiekoordineringssenteret, renset og kodet klar for analyse.

Oppfølgingsspørreskjema Et postalt oppfølgingsskjema ble sendt til studiedeltakerne etter rekruttering (gjennomsnittlig tid til oppfølging 469 dager) for å vurdere generell helsestatus (EQ-5D), funksjonsstatus (spørreskjema Rose angina, Seattle angina spørreskjema) , symptomer på depresjon (PHQ-2) og angst (GAD-7) og bruk av nitratmedisiner.

Elektroniske journalkoblinger Med deres samtykke koblet etterforskerne deltakerne til data fra Hospital Episode Statistics, et nasjonalt datavarehus med administrative data som inneholder ICD-10-kodede sykehusdiagnoser og OPCS4-kodede prosedyrer. Etterforskerne koblet i tillegg deltakerne med ICD-10-kodede årsaksspesifikke dødelighetsdata fra Office for National Statistics. Koblingene ble utført via NHS Health and Social Care Information Center (tidligere kjent som NHS Information Centre) og pasienter ble identifisert ved å bruke deres NHS-nummer (en unik tisifret numerisk identifikator for NHS), kjønn, fødselsdato og postnummer.

Datainnsamling og håndtering Utformingen, gjennomføringen, analysen og rapporteringen av studien følger de metodiske standardene som er angitt i retningslinjene for rapporteringsanbefalinger for tumor MARKer prognostiske studier (REMARK). For å opprettholde konfidensialitet ble identifikatorer fjernet fra alle datakilder og erstattet med et unikt deltakerstudienummer som ble tildelt ved registreringen. Forskere ble opplært til å følge standardiserte operasjonsprosedyrer for å sikre høy kvalitet og konsistent innsamling av data. Data ble sjekket og validert, og inkonsekvenser i kliniske data ble løst ved å gå tilbake til sykehusdata ved kilden.