- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT05030805
Transcriptional Map of Ovarian Cancer at the Single Cell Level (Ova-seq)
In 2020, epithelial ovarian cancer (EOC) accounts for 313,959 new cases and 207,252 deaths worldwide. The standardized 5-year net survival of a woman with EOC is 44% for cases diagnosed between 2005-2010. This is because 2 out of 3 cancers are found at an advanced stage with invasion beyond the ovaries to the entire peritoneum or distant metastasis. Treatment of EOC is currently based on platinum-based chemotherapy combined with paclitaxel and maximal cytoreduction surgery. Newer combination therapies may be introduced such as bevacizumab and oral poly ADP-ribose polymerase (PARP) inhibitors. Despite the combination of different therapeutic modes, the 5-year survival has not progressed much since the 1980s. The development of new and more effective therapies is essential but requires a better understanding of cancer heterogeneity and the identification of new therapeutic targets.
Cancer heterogeneity results from genetic and transcriptional variations between tumors but also between cells of the same tumor. This heterogeneity has an impact on the development of the tumor and its resistance to treatment. One of the methods to study this heterogeneity is single cell RNA sequencing (scRNAseq) which allows to analyze individually and simultaneously the gene expression (transcriptomics) of thousands of cells. Studies on EOC using this technique have already been performed but they were based on small numbers with very different tumor types and stages.
The objective of this protocol is to characterize by scRNA-seq the architecture and microenvironment of primary and secondary tumors of 50 patients with EOC at the single cell level and to correlate the data with the clinical characteristics of the patients, especially during recurrence and/or chemoresistance, in order to identify the molecular parameters allowing tumor cells to acquire survival, invasion, metastasis and chemoresistance capacity as well as to carry out the inventory of cell populations within the different sites of EOC. We will also analyze the interaction between tumor cells and the microenvironment, by studying on the one hand the involvement of immune cells in the antitumor response and on the other hand how tumor cells modulate the microenvironment to make it permissive to the development of the EOC. We will compare the data obtained for each patient with healthy tissue (from the same patient) in order to determine the common and specific tumor molecular signatures in EOC, the latter point allowing us to evaluate the intra and inter-patient variability. Similarly, the comparison of the transcriptomic profile of the same tumor subtype in several patients will allow us to determine if certain transcriptional perturbations are ubiquitous. The identification of these common pathways would allow the discovery of potential therapeutic targets.
Furthermore, the molecular processes leading to chemoresistance are still unknown. We will investigate whether known chemoresistance markers are present in tumor cells from primary sites and whether their presence correlates with the response to treatment in patients. We will also study the molecular mechanisms of resistance to treatment in our patients which will ultimately allow the development of new therapies. We will also try to find new prognostic markers which is made possible by the clinical follow-up of the patients.
The existence of this heterogeneity will be confirmed by complementary genetic analyses of the genome and exome (search for mutations, variation in gene copy number or chromosome copy number, epigenetic effects) by different molecular biology techniques (qPCR, NGS sequencing) and the markers that will be identified can be confirmed by histochemical analysis.
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Cherif Akladios, MD
- Numer telefonu: +33 3 88 12 74 55
- E-mail: Cherif.AKLADIOS@chru-strasbourg.fr
Lokalizacje studiów
-
-
Alsace
-
Strasbourg, Alsace, Francja, 67000
- Rekrutacyjny
- Service Gynécologie Obstétrique, Hôpital de Hautepierre
-
Kontakt:
- Chérif AKLADIOS, MD, PhD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
- Women of legal age (≥ 18 years)
- With an ovarian cancer confirmed by anatomopathological analysis
- Operated in the gynecology department of the Strasbourg University Hospital between 2021 and 2024
- Patients having given their agreement to participate in the present trial and to the constitution of the collection of biological samples
Exclusion criteria:
- Chronic inflammatory disease (Lupus, rheumatoid arthritis, chronic inflammatory bowel disease, etc.)
- History of immunotherapy treatment (anti PDL1...)
- Previous appendixctomy for another reason
- Impossibility to give the patient informed information (subject in an emergency situation, difficulties in understanding, language barrier, altered cognitive abilities)
- Patient under legal protection or tutorship or curatorship.
- Pregnant patient, breastfeeding
- Persons deprived of liberty by judicial or administrative decision.
- Persons under forced psychiatric care.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
Cellular heterogeneity in ovarian cancer
Ramy czasowe: Within 24 hours of receiving the tissue from the surgery
|
We will study the cellular populations constituting ovarian tumors by comparing the existing cellular heterogeneity between patients (inter-patient) but also within the same patient, between primary and secondary sites on the one hand and within the same tumor tissue on the other hand (intra-patient) as well as the comparison with tissue considered as healthy between patients.
|
Within 24 hours of receiving the tissue from the surgery
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
Neoantigens study
Ramy czasowe: Immediately at the time of the reception of the tissues resulting from the surgery
|
Neoantigens present on the surface of tumor cells will be isolated by immunoprecipitation from cell lysates and their nature will be determined by LC-MS/MS.
These proteomic results will be compared to the transcriptomic results by single cell sequencing obtained in the main objective.
|
Immediately at the time of the reception of the tissues resulting from the surgery
|
Współpracownicy i badacze
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Nowotwory według typu histologicznego
- Nowotwory
- Nowotwory układu moczowo-płciowego
- Nowotwory według lokalizacji
- Rak
- Nowotwory gruczołowe i nabłonkowe
- Nowotwory narządów płciowych, kobiety
- Choroby układu hormonalnego
- Choroby jajników
- Choroby przydatków
- Zaburzenia gonad
- Nowotwory gruczołów dokrewnych
- Nowotwory jajnika
- Rak, nabłonek jajnika
Inne numery identyfikacyjne badania
- 8180 (University of Washington)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Rak jajnika
-
Emory UniversityNational Cancer Institute (NCI)WycofanePrognostyczny rak piersi IV stopnia AJCC v8 | Przerzutowy nowotwór złośliwy w mózgu | Przerzutowy rak piersi | Anatomiczny IV stopień raka piersi American Joint Committee on Cancer (AJCC) v8
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterZakończonyRak prostaty oporny na kastrację | Przerzutowy rak prostaty | Stadium IVA raka prostaty AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IVB AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IV American Joint Committee on Cancer (AJCC) v8Stany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterZakończonyBiochemicznie nawracający rak prostaty | Przerzutowy rak prostaty | Nowotwór złośliwy z przerzutami w kości | Stadium IVA raka prostaty AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IVB AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IV American Joint Committee on Cancer (AJCC) v8Stany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterEli Lilly and Company; Genentech, Inc.RekrutacyjnyNiedrobnokomórkowy rak płuc z przerzutami | Oporny na leczenie niedrobnokomórkowy rak płuc | Rak płuca w stadium IV American Joint Committee on Cancer (AJCC) v8 | Rak płuc w stadium IVA AJCC v8 | Rak płuc w stadium IVB AJCC v8Stany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterNational Cancer Institute (NCI)ZakończonyGruczolakorak gruczołu krokowego III stopnia AJCC v7 | Gruczolakorak gruczołu krokowego II stopnia AJCC v7 | Stopień I gruczolakoraka gruczołu krokowego American Joint Committee on Cancer (AJCC) v7Stany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterRekrutacyjnyRak prostaty oporny na kastrację | Przerzutowy rak prostaty | Stadium IVA raka prostaty AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IVB AJCC v8 | Rak prostaty w stadium IV American Joint Committee on Cancer (AJCC) v8Stany Zjednoczone
-
NRG OncologyNational Cancer Institute (NCI)Aktywny, nie rekrutującyAnatomiczny rak piersi IV stadium AJCC v8 | Prognostyczny rak piersi IV stopnia AJCC v8 | Nowotwór złośliwy z przerzutami w kości | Przerzutowy nowotwór złośliwy w węzłach chłonnych | Przerzutowy nowotwór złośliwy w wątrobie | Przerzutowy rak piersi | Przerzutowy nowotwór złośliwy w płucach | Nowotwór... i inne warunkiStany Zjednoczone, Kanada, Arabia Saudyjska, Republika Korei
-
National Cancer Institute (NCI)ZakończonyOporny na leczenie złośliwy nowotwór lity | Nawracający złośliwy nowotwór lity | Przerzutowy złośliwy nowotwór lity | Nieoperacyjny lity nowotwór | Nawracający rak drobnokomórkowy płuca | Stopień IIIA Rak drobnokomórkowy płuca AJCC v7 | Etap IIIB Rak drobnokomórkowy płuca AJCC v7 | Rak drobnokomórkowy... i inne warunkiStany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterBeiGene; Driven To CureWycofanePrzerzutowy rak nerkowokomórkowy | Rak nerkowokomórkowy IV stopnia AJCC v8 | Rak brodawkowaty nerki | Zbieranie raka przewodów | Nieoperacyjny rak nerki | Dziedziczna leiomyomatoza i rak nerkowokomórkowy | Jasnokomórkowy brodawkowaty nowotwór nerki | Dziedziczny rak brodawkowaty nerki | Niesklasyfikowany... i inne warunkiStany Zjednoczone
-
Jonsson Comprehensive Cancer CenterAstraZenecaZakończonyRak płaskonabłonkowy jamy ustnej i gardła | Stopień kliniczny III zależny od HPV (p16-dodatni) rak jamy ustnej i gardła AJCC v8 | Stopień kliniczny II, w którym pośredniczy HPV (p16-dodatni) rak jamy ustnej i gardła AJCC v8 | Patologiczny etap I, w którym pośredniczy HPV (p16-dodatni) rak jamy... i inne warunkiStany Zjednoczone