Rozszyfrowanie roli okrągłych RNA w ALK-dodatnim anaplastycznym chłoniaku wielkokomórkowym (CIRComa)

Chłoniak anaplastyczny z dużych komórek (ALCL) jest agresywnym chłoniakiem dziecięcym z komórek T. 85% przypadków ALK + ALCL zawiera fuzję między genami nukleofosminy (NPM) i kinazy chłoniaka anaplastycznego (ALK), co prowadzi do konstytutywnie aktywowanego i onkogennego białka fuzyjnego. Większość przypadków ALK+ ALCL początkowo dobrze reaguje na chemioterapię pierwszego rzutu, ale u 30% pacjentów dochodzi do nawrotu i rokowania są złe. Zrozumienie źródeł oporności na leczenie ma ogromne znaczenie dla poprawy leczenia i rokowania pacjentów. Obecne badania podkreślają rozregulowaną ekspresję regulatorowych niekodujących RNA (ncRNA) jako ważny czynnik oporności na terapię. Do tej pory mikroRNA i długie niekodujące RNA były łączone z opornością na terapię w ALK+ ALCL. Okrągłe RNA (circRNA) to klasa wysoce stabilnych niekodujących RNA, które ostatnio znalazły się w centrum zainteresowania naukowców. circRNA mogą kontrolować ekspresję docelowego genu m.in. interakcji z mikroRNA lub białkami. Projekt ten ma na celu wyjaśnienie ich roli w biologii ALK+ ALCL, w tym ich wpływu na sieci niekodującego RNA i oporność na terapię. Ten projekt (1) zidentyfikuje sygnaturę circRNA związaną z opornością na terapię w ALK+ ALCL, (2) przeanalizuje ich wpływ na odpowiedź na leczenie, (3) wyjaśni mechanizm działania oraz (4) oceni kandydatów na circRNA jako predykcyjne i prognostyczne osocze biomarkerów przy użyciu biopsji płynnych. Celem badania jest scharakteryzowanie roli kandydujących circRNA w tym dobrze zdefiniowanym typie raka, który może służyć jako model dla innych nowotworów ALK+. Wyniki projektu przyczynią się do poszerzenia obecnego mechanistycznego rozumienia patogenezy ALK+ ALCL i źródeł oporności na terapię, a także mogą zdefiniować nowe cele dla leków i powiązane biomarkery prognostyczne dla chorób wysokiego ryzyka. Ustalenie opartego na krwi alternatywnego potwierdzenia diagnozy ALK+ ALCL może również stworzyć mniej inwazyjne narzędzie prognostyczne zdolne do długoterminowego monitorowania pacjenta w celu wczesnego wykrywania nawrotów.