Dechiffrere rollen til sirkulære RNA-er i ALK-positivt anaplastisk storcellet lymfom (CIRComa)

Anaplastisk storcellet lymfom (ALCL) er et aggressivt T-celle pediatrisk lymfom. 85 % av ALK+ ALCL-tilfellene inneholder en fusjon mellom genene nukleofosmin (NPM) og anaplastisk lymfomkinase (ALK), noe som fører til et konstitutivt aktivert og onkogent fusjonsprotein. De fleste ALK+ ALCL-tilfeller reagerer i utgangspunktet godt på frontlinjekjemoterapien, men 30 % av pasientene får tilbakefall og har dårlig prognose. Å forstå opprinnelsen til terapiresistens er av stor betydning for å forbedre behandling og pasientprognose. Nåværende forskning fremhever deregulert uttrykk av regulatoriske ikke-kodende RNA (ncRNA) som en viktig faktor i terapiresistens. Til dags dato har mikroRNA og lange ikke-kodende RNA blitt knyttet til terapiresistens i ALK+ ALCL. Sirkulære RNA-er (circRNA-er) er en klasse av svært stabile ikke-kodende RNA-er som nylig har kommet i fokus for forskere. circRNA kan kontrollere målgenekspresjon ved f.eks. interagerer med mikroRNA eller proteiner. Dette prosjektet tar sikte på å belyse deres rolle i ALK+ ALCL-biologi, inkludert deres innvirkning på ikke-kodende RNA-nettverk og terapiresistens. Dette prosjektet vil (1) identifisere en signatur av circRNA-er assosiert med terapiresistens i ALK+ ALCL, (2) analysere deres effekt på behandlingsrespons, (3) belyse deres virkningsmekanisme, og (4) evaluere circRNA-kandidater som prediktivt og prognostisk plasma biomarkører som bruker flytende biopsier. Målet med studien er å karakterisere rollen til kandidat circRNAs i denne veldefinerte krefttypen, som kan tjene som modell for andre ALK+ kreftformer. Prosjektresultater vil legge til den nåværende mekanistiske forståelsen av ALK+ ALCL-patogenesen og opprinnelsen til terapiresistens, og kan definere nye medisinerbare mål og tilhørende prediktive biomarkører for høyrisikosykdom. Etablering av den blodbaserte alternative bekreftelsen for ALK+ ALCL-diagnosen kan også produsere et mindre invasivt prediktivt verktøy som er i stand til langsgående pasientovervåking for tidlig tilbakefallsdeteksjon.