Żywotność bakteryjnych zakażeń przenoszonych drogą płciową (STI) na podstawie reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) (VISTH)

Badania przesiewowe w kierunku chorób przenoszonych drogą płciową przez C. trachomatis i N. gonorrhoeae w 3 miejscach anatomicznych, tj. gardle, układzie moczowo-płciowym i odbycie, są zalecane co trzy do sześciu miesięcy u MSM z zachowaniami seksualnymi wysokiego ryzyka, przy użyciu NAAT. Dodatni wynik testu NAAT oznacza, że ​​pacjent jest zakażony i otrzyma antybiotykoterapię. Jednak wielokrotne stosowanie antybiotyków doprowadziło do pojawienia się wielolekoopornych szczepów M. genitalium, innego czynnika przenoszonego drogą płciową i N. gonorrhoeae oraz do zmian w mikroflorze jelitowej. Wadą NAAT jest to, że wzmacniają one kwasy nukleinowe żywych i martwych bakterii. Dlatego nie można stwierdzić, że pacjent ma „aktywną” infekcję, definiowaną przez obecność żywych bakterii. Żywotność bakterii można badać metodą PCR w czasie rzeczywistym (tzw. V-PCR). Metoda ta łączy w sobie wysoką czułość i swoistość PCR z możliwością wykluczenia wykrycia resztek kwasu nukleinowego z nieżywotnych bakterii. Czyni to poprzez włączenie etapu wstępnej obróbki próbki z nieprzepuszczalnym dla błony barwnikiem interkalującym DNA przed analizą molekularną poprzez blokowanie amplifikacji pozostałości DNA z nieżywotnych bakterii. Pozwala to analizie V-PCR na wykrycie DNA pochodzącego z nienaruszonego (tj. żywe) bakterie. Za pomocą V-PCR badania przeprowadzone na kobietach wykazały, że tylko połowa próbek z odbytu i odbytu oraz jedna czwarta próbek z gardła pozytywnych dla C. trachomatis zawiera żywe bakterie.

Zespół proponuje zbadanie obecności żywotnych bakterii C. trachomatis, N. gonorrhoeae i M. genitalium za pomocą metody V-PCR w próbkach z gardła, układu moczowo-płciowego i odbytu z MSM wykrytych jako dodatnie przez NAAT dla tych bakterii.

Wyniki tej pracy pozwolą nam ocenić, czy wszystkie typy próbek badanych u tych pacjentów zawierają żywe bakterie, a jeśli tak, to w jakich proporcjach.