Bakterielle seksuelt overførte infektioner (STI'er) levedygtighed ved polymerasekædereaktion (PCR) (VISTH)

Screening for C. trachomatis og N. gonorrhoeae STI'er på 3 anatomiske steder, dvs. pharyngeal, urogenital og anal, anbefales hver tredje til sjette måned i MSM med højrisiko seksuel adfærd, ved hjælp af NAAT. Et positivt NAAT-resultat definerer patienten som inficeret, og patienten vil modtage antibiotikabehandling. Gentagen brug af antibiotika har imidlertid ført til fremkomsten af ​​multi-lægemiddelresistente stammer af M. genitalium, et andet STI-agens, og N. gonorrhoeae og til ændringer i tarmmikrobiotaen. En ulempe ved NAAT'er er, at de amplificerer nukleinsyrerne i levedygtige og døde bakterier. Det er således ikke muligt at bekræfte, at patienten har en "aktiv" infektion, defineret ved tilstedeværelsen af ​​levedygtige bakterier. Bakteriel levedygtighed kan studeres ved real-time PCR (kaldet V-PCR). Denne metode kombinerer PCR's høje sensitivitet og specificitet med evnen til at udelukke påvisning af nukleinsyrerester fra ikke-levedygtige bakterier. Det gør det ved at inkorporere et prøveforbehandlingstrin med et membranuigennemtrængeligt DNA-interkalerende farvestof før molekylær analyse ved at blokere amplifikation af rest-DNA fra ikke-levedygtige bakterier. Dette gør det muligt for V-PCR-analysen at detektere DNA, der stammer fra intakt (dvs. levedygtige) bakterier. Ved hjælp af V-PCR har undersøgelser af kvinder vist, at kun halvdelen af ​​de anorektale prøver og en fjerdedel af de pharyngeale prøver, der er positive for C. trachomatis, indeholder levedygtige bakterier.

Holdet foreslår at undersøge tilstedeværelsen af ​​levedygtige C. trachomatis-, N. gonorrhoeae- og M. genitalium-bakterier ved V-PCR i pharyngeale, urogenitale og anale prøver fra MSM, som er påvist som positive af NAAT for disse bakterier.

Resultaterne af dette arbejde vil give os mulighed for at vurdere, om alle typer prøver, der er testet på disse patienter, indeholder levedygtige bakterier, og i givet fald i hvilke proportioner.