Bakterielle seksuelt overførbare infeksjoner (SOI) levedyktighet ved polymerasekjedereaksjon (PCR) (VISTH)

Screening for C. trachomatis og N. gonorrhoeae STIs på 3 anatomiske steder, dvs. svelg, urogenital og anal, anbefales hver tredje til sjette måned ved MSM med høyrisiko seksuell atferd, ved bruk av NAAT. Et positivt NAAT-resultat definerer pasienten som infisert, og pasienten vil få antibiotikabehandling. Gjentatt bruk av antibiotika har imidlertid ført til fremveksten av multi-legemiddelresistente stammer av M. genitalium, et annet STI-middel, og N. gonorrhoeae, og til endringer i tarmmikrobiota. En ulempe med NAAT er at de forsterker nukleinsyrene til levedyktige og døde bakterier. Dermed er det ikke mulig å bekrefte at pasienten har en "aktiv" infeksjon, definert av tilstedeværelsen av levedyktige bakterier. Bakteriell levedyktighet kan studeres ved sanntids PCR (kalt V-PCR). Denne metoden kombinerer den høye sensitiviteten og spesifisiteten til PCR med evnen til å utelukke påvisning av nukleinsyrerester fra ikke-levedyktige bakterier. Det gjør det ved å inkorporere et prøveforbehandlingstrinn med et membranugjennomtrengelig DNA-interkalerende fargestoff før molekylær analyse ved å blokkere amplifikasjon av gjenværende DNA fra ikke-levedyktige bakterier. Dette gjør at V-PCR-analysen kan oppdage DNA som stammer fra intakt (dvs. levedyktige) bakterier. Ved bruk av V-PCR har studier på kvinner vist at bare halvparten av anorektale prøvene og en fjerdedel av svelgprøvene positive for C. trachomatis inneholder levedyktige bakterier.

Teamet foreslår å undersøke tilstedeværelsen av levedyktige C. trachomatis-, N. gonorrhoeae- og M. genitalium-bakterier ved V-PCR i svelg-, urogenitale og anale prøver fra MSM påvist som positive av NAAT for disse bakteriene.

Resultatene av dette arbeidet vil tillate oss å vurdere om alle typer prøver testet på disse pasientene inneholder levedyktige bakterier, og i så fall i hvilke proporsjoner.