Профилирование экспрессии генов в РВМС как инструмент прогнозирования чувствительности к инфликсимабу при ревматоидном артрите

Целью исследования является выявление и валидация прогностических маркеров чувствительности к инфликсимабу у пациентов с РА с помощью двух подходов: i) измерение биохимических, иммунологических и костных маркеров в сыворотке из-за их участия в патогенных механизмах; ii) идентификация сигнатур экспрессии генов в РВМС с помощью транскриптомного анализа.

Пациентам с активным РА (критерии ACR) вводили внутривенно 3 мг/кг инфликсимаба в сочетании с метотрексатом на 0, 2, 6 неделе и каждую 8-ю неделю. Эффективность инфликсимаба оценивали на 14-й неделе с использованием критериев ответа EULAR.

1. Непосредственно перед началом лечения инфликсимабом в сыворотке измеряли следующие параметры: i) иммунологические тесты: ревматоидный фактор (IgA, IgG, IgM), анти-ССР, аутоАТ, узнающие 27 С-концевой фрагмент (ACAST-C27) и домен I (ACAST-DI) кальпастатина, анти-G6PI, анти-энолаза, анти-кератин и анти-перинуклеарный фактор; ii) биохимические маркеры: СРБ, ММП-1, ММП-3, ТИМП-1, ТИМП-2; маркеры костной резорбции: пиридинолин, дезоксипиридинолин, остеопротегерин, sRANKL, COMP. Прогностическое значение каждого параметра для ответа/отсутствия ответа на инфликсимаб анализировали с использованием точного теста Фишера, теста Манна-Уитни и Chi2.
2. Образец крови собирали непосредственно перед началом лечения инфликсимабом, и из мононуклеарных клеток периферической крови выделяли общую РНК. мРНК, меченные радиоактивным изотопом [33P], гибридизовали (дублировать или трипликатировать) на наборе из 10 000 зондов кДНК человека, нанесенных с высокой плотностью на нейлоновые мембраны. Данные были нормализованы и отфильтрованы, чтобы можно было сравнивать образцы РНК. Статистический анализ был выполнен с помощью программного обеспечения R, а иерархическая кластеризация была выполнена с помощью программного обеспечения Cluster и Tree View.