Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Comparison of Different Methods for the Analysis of Gut Microbiome Composition (COLLECT)

9 september 2019 uppdaterad av: Dr. Lajos Marko, Charite University, Berlin, Germany

The Influence of Different Sample Collection and DNA Extraction Methods on the Bacterial Composition of the Gut of Healthy Subjects

The human gastrointestinal tract shelters a complex and dynamic population of microorganisms, the gut microbiota, which plays an important role in immune and metabolic homeostasis. In recent years several major diseases were linked with alterations in the gut microbiome composition.

There are known factors which can influence gut microbiata composition. For example diet is known to play a fundamental role in determining the composition of the intestinal microbiota over time. However, there are very few studies evaluating how collection and DNA isolation methods affect microbiome composition.

Studieöversikt

Status

Avslutad

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

An observational clinical study with 28 healthy subjects is planned to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome. Participants will be instructed to collect stool samples at two time points separated by one week using six different methods (naïve and Zymo DNA/RNA Shield kit on dry ice as well as OMNIgene GUT, RNALater, 95% EtOH, Zymo DNA/RNA Shield at room temperature). DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.).

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Faktisk)

28

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

  • Tyskland
      • Berlin, Tyskland, 13125
        • Experimental and Clinical Research Center, Clinical Research Unit

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år till 60 år (Vuxen)

Tar emot friska volontärer

Ja

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Healthy subjects

Beskrivning

Inclusion Criteria:

  • Age between 18-60
  • Body mass index (BMI) 18,5- 29,9 kg/m2
  • Willingness to participate in the study examination and fecal sample collection process

Exclusion Criteria:

  • Subjects currently on medication (with the exception of contraceptives)
  • Subjects with acute or chronic disease
  • Pregnant or lactating women
  • Subjects with a history of drug or alcohol abuse
  • Subjects on a vegan diet
  • Subjects who are legal incapacitated or their circumstances do not enable the patient to fully understand the nature, significance and scope of this study.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Collection of stool samples
Tidsram: one week

Collection of 2 stool samples in one week using different conditions

DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.) to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome
one week

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Charite University, Berlin, Germany

Utredare

  • Studiestol: Anja Mähler, PhD, Franz-Volhard-Centr. at the Experimental and Clinicial Research Center

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

11 mars 2019

Primärt slutförande (Faktisk)

30 juni 2019

Avslutad studie (Faktisk)

5 september 2019

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

5 september 2019

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

6 september 2019

Första postat (Faktisk)

9 september 2019

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

11 september 2019

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

9 september 2019

Senast verifierad

1 september 2019

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Andra studie-ID-nummer

  • ChariteU-ECRC-COLLECT

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

OBESLUTSAM

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Friska

Kliniska prövningar på inget ingripande

Sök liknande försök

Sponsorer och medarbetare

Medicinska tillstånd

Läkemedelsinterventioner

CROs by country

CROs in Sweden

Betingelser

Sällsynta sjukdomar

Läkemedelsinterventioner

Kosttillskott

Sponsor / medarbetare

Platser

3
Prenumerera