Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Comparison of Different Methods for the Analysis of Gut Microbiome Composition (COLLECT)

9 сентября 2019 г. обновлено: Dr. Lajos Marko, Charite University, Berlin, Germany

The Influence of Different Sample Collection and DNA Extraction Methods on the Bacterial Composition of the Gut of Healthy Subjects

The human gastrointestinal tract shelters a complex and dynamic population of microorganisms, the gut microbiota, which plays an important role in immune and metabolic homeostasis. In recent years several major diseases were linked with alterations in the gut microbiome composition.

There are known factors which can influence gut microbiata composition. For example diet is known to play a fundamental role in determining the composition of the intestinal microbiota over time. However, there are very few studies evaluating how collection and DNA isolation methods affect microbiome composition.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

An observational clinical study with 28 healthy subjects is planned to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome. Participants will be instructed to collect stool samples at two time points separated by one week using six different methods (naïve and Zymo DNA/RNA Shield kit on dry ice as well as OMNIgene GUT, RNALater, 95% EtOH, Zymo DNA/RNA Shield at room temperature). DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.).

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

28

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

      • Berlin, Германия, 13125
        • Experimental and Clinical Research Center, Clinical Research Unit

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 60 лет (Взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Healthy subjects

Описание

Inclusion Criteria:

  • Age between 18-60
  • Body mass index (BMI) 18,5- 29,9 kg/m2
  • Willingness to participate in the study examination and fecal sample collection process

Exclusion Criteria:

  • Subjects currently on medication (with the exception of contraceptives)
  • Subjects with acute or chronic disease
  • Pregnant or lactating women
  • Subjects with a history of drug or alcohol abuse
  • Subjects on a vegan diet
  • Subjects who are legal incapacitated or their circumstances do not enable the patient to fully understand the nature, significance and scope of this study.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Collection of stool samples
Временное ограничение: one week

Collection of 2 stool samples in one week using different conditions

DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.) to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome

one week

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Следователи

  • Учебный стул: Anja Mähler, PhD, Franz-Volhard-Centr. at the Experimental and Clinicial Research Center

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

11 марта 2019 г.

Первичное завершение (Действительный)

30 июня 2019 г.

Завершение исследования (Действительный)

5 сентября 2019 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

5 сентября 2019 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

6 сентября 2019 г.

Первый опубликованный (Действительный)

9 сентября 2019 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

11 сентября 2019 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

9 сентября 2019 г.

Последняя проверка

1 сентября 2019 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Другие идентификационные номера исследования

  • ChariteU-ECRC-COLLECT

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕ РЕШЕНО

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Здоровый

Клинические исследования без вмешательства

Подписаться