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Comparison of Different Methods for the Analysis of Gut Microbiome Composition (COLLECT)

9 settembre 2019 aggiornato da: Dr. Lajos Marko, Charite University, Berlin, Germany

The Influence of Different Sample Collection and DNA Extraction Methods on the Bacterial Composition of the Gut of Healthy Subjects

The human gastrointestinal tract shelters a complex and dynamic population of microorganisms, the gut microbiota, which plays an important role in immune and metabolic homeostasis. In recent years several major diseases were linked with alterations in the gut microbiome composition.

There are known factors which can influence gut microbiata composition. For example diet is known to play a fundamental role in determining the composition of the intestinal microbiota over time. However, there are very few studies evaluating how collection and DNA isolation methods affect microbiome composition.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

An observational clinical study with 28 healthy subjects is planned to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome. Participants will be instructed to collect stool samples at two time points separated by one week using six different methods (naïve and Zymo DNA/RNA Shield kit on dry ice as well as OMNIgene GUT, RNALater, 95% EtOH, Zymo DNA/RNA Shield at room temperature). DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.).

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

28

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Germania
      • Berlin, Germania, 13125
        • Experimental and Clinical Research Center, Clinical Research Unit

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 60 anni (Adulto)

Accetta volontari sani

Sì

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Healthy subjects

Descrizione

Inclusion Criteria:

  • Age between 18-60
  • Body mass index (BMI) 18,5- 29,9 kg/m2
  • Willingness to participate in the study examination and fecal sample collection process

Exclusion Criteria:

  • Subjects currently on medication (with the exception of contraceptives)
  • Subjects with acute or chronic disease
  • Pregnant or lactating women
  • Subjects with a history of drug or alcohol abuse
  • Subjects on a vegan diet
  • Subjects who are legal incapacitated or their circumstances do not enable the patient to fully understand the nature, significance and scope of this study.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Collection of stool samples
Lasso di tempo: one week

Collection of 2 stool samples in one week using different conditions

DNA extraction from all samples will be performed using QIAamp Power Fecal (Qiagen, N. V) and ZymoBIOMICS (Zymo Research, CA.) to assess how different commercially available stool sampling kits and fecal DNA extraction kits influence the apparent composition of the gut microbiome
one week

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Charite University, Berlin, Germany

Investigatori

  • Cattedra di studio: Anja Mähler, PhD, Franz-Volhard-Centr. at the Experimental and Clinicial Research Center

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

11 marzo 2019

Completamento primario (Effettivo)

30 giugno 2019

Completamento dello studio (Effettivo)

5 settembre 2019

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

5 settembre 2019

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

6 settembre 2019

Primo Inserito (Effettivo)

9 settembre 2019

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

11 settembre 2019

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

9 settembre 2019

Ultimo verificato

1 settembre 2019

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • ChariteU-ECRC-COLLECT

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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