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克罗恩病患者的粪便微生物移植

2022年2月18日 更新者:Ellen Li、Stony Brook University
粪便微生物群移植将作为研究性新药治疗提供给符合条件的克罗恩病患者

研究概览

地位

完全的

条件

详细说明

本研究将检验以下假设:

  1. 粪便微生物群移植是一种安全、可耐受的手术。
  2. 粪便移植后粪便受体的粪便微生物多样性、组成和功能将变为与供体粪便中相似的微生物多样性、组成和功能。

主要目标:

1. 确定克罗恩病患者在移植后 12 周内粪便微生物群移植的短期安全性和耐受性。

次要目标:

  1. 确定粪便微生物群移植 (FMT) 对克罗恩病患者长达一年的长期安全性和耐受性。
  2. 将健康供体粪便中的微生物多样性与从克罗恩病患者(接受者)收集的 FMT 前接受者粪便进行比较。
  3. 将健康供体粪便中的微生物组成与克罗恩病患者(受体)的 FMT 前受体粪便进行比较。
  4. 将健康供体粪便中的微生物功能与来自克罗恩病患者(受体)的 FMT 前受体粪便进行比较
  5. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物多样性与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 1 周接受者粪便样本。
  6. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物组成与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 1 周接受者粪便样本。
  7. 将健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物功能与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 1 周接受者粪便样本进行比较。
  8. 将健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物多样性与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 12 周接受者粪便样本进行比较。
  9. 将健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物组成与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 12 周接受者粪便样本进行比较。
  10. 比较健康供体粪便和 FMT 前接受者粪便中的微生物功能与从克罗恩病患者(接受者)收集的移植后 12 周接受者粪便样本。
  11. 在 FMT 前、FMT 后 1 周和 12 周的基线时,将在接受者中测量粪便钙卫蛋白水平,以确定 FMT 是否会导致统计上显着的变化。

研究类型

介入性

注册 (实际的)

9

阶段

  • 第一阶段早期

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • New York
      • Stony Brook、New York、美国、11794
        • Stony Brook University Hospital

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

7年 及以上 (孩子、成人、年长者)

接受健康志愿者

有资格学习的性别

全部

描述

克罗恩病初始粪便微生物移植的纳入标准:

所有年龄≥7 岁且由初级胃肠病学家根据病史、体格检查、实验室/放射学研究和胃肠道组织学确诊为克罗恩病并符合以下一项或多项标准的患者:

  1. 已接受类固醇治疗至少一个月
  2. 接受过至少一个月的免疫调节治疗
  3. 至少接受过一个月的生物疗法

所有未满 18 岁的患者或患者的法定监护人都必须同意。 同意书将概述,尽管根据过去的研究,粪便微生物群移植似乎是安全的,但理论上存在传播未被识别的传染原或物质的风险,并可能导致意想不到的疾病。 所有年龄≥7 岁且 <18 岁的患者都必须同意

排除标准:

  1. 7岁以下患者
  2. 计划在未来 12 周内进行腹部手术
  3. 过去 3 个月内进行过腹部大手术
  4. 怀孕(这将在手术当天通过尿检进行检查)
  5. 贫血:血红蛋白 < 6 g/dL,
  6. 中性粒细胞减少症:绝对中性粒细胞计数<1500 上述两个标准将在手术前一个月内通过筛查测试或血液测试报告进行检查
  7. 已知的移植物抗宿主病诊断
  8. 存在腹腔内或肛周脓肿。
  9. 存在肠皮瘘
  10. 存在严重的肠狭窄和/或肠梗阻
  11. 在过去 2 个月内服用过任何研究药物
  12. 在建议的移植日期后 2 周内使用了 TNF-α 拮抗剂
  13. 过去 4 周(28 天)内的菌血症
  14. 严重的克罗恩病,由小儿克罗恩病活动指数 (PCDAI) 值确定超过 29。
  15. 对食物有严重过敏反应的人;
  16. 患有并发疾病的个体,包括但不一定限于:发热性疾病、失代偿性肝硬化、过去 150 天内的 HIV/AIDS BMT、恶性肿瘤或其他严重的免疫缺陷。
  17. 内窥镜检查或程序镇静并发症风险增加的个体(例如,ASA IV 级及以上)。
  18. 以前的裂变材料

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 主要用途:治疗
  • 分配:不适用
  • 介入模型:单组作业
  • 屏蔽:无(打开标签)

武器和干预

参与者组/臂
干预/治疗
实验性的:粪便微生物移植
粪便微生物移植将提供给有资格参与研究的患者。
将向符合条件的克罗恩病患者提供粪便微生物移植
其他名称:
  • 裂变材料

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
根据 CTCAE v4.0 评估的与治疗相关的不良事件的参与者人数。
大体时间:5年
将报告 FMT 后一年内发生大于 2 级的治疗相关不良事件的参与者人数。
5年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周受体粪便相比,测量粪便微生物移植对健康供体粪便微生物多样性的影响。
大体时间:6年
粪便 DNA 样本将进行 V3-V4 16S rRNA 测序。 操作分类单元 (OTU) 将通过具有相同分类分配的聚类序列产生。 Alpha 多样性指数(例如 Chao1、Shannon 复杂度 H、Shannon 均匀度 H/Hmax) 将使用 Explicet 通过 1000 次重复重采样推断得出。 Beta 多样性(Bray-Curtis 和 Jaccard 距离)将计算接受者在 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周,与他们在门的 R vegan 包中使用 adonis 功能的捐赠者相比,科和属的水平。 将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的α多样性(ShannonH)和β多样性(Bray-Curtis和Jaccard距离)。 小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
6年
与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周受体粪便相比,测量粪便微生物移植对健康供体粪便中微生物组成的影响。
大体时间:6年
粪便 DNA 样本将进行 V3-V4 16S rRNA 测序。 . 操作分类单元 (OTU) 将通过具有相同分类分配的聚类序列产生。 在剔除供体和受体前FMT样本中平均相对丰度<0.001%的OTU,并丢弃超过75%的OTU后,将对105个OTU进行属水平个体OTU的线性混合模型分析。样品计数为零。 比较 FMT 前后时间点之间每个 OTU 的相对丰度 [移植前接受者,1-wk。 FMT 后接受者,3 个月。 FMT后接受者]和每个疾病组,将使用广义线性混合模型(GLMM)或广义估计方程(GEE),将每个OTU的实际计数作为假定服从负二项分布的结果。 将通过 Bonferroni 校正或 Benjamin-Hochberg 方法(FDR < 0.05)针对多重比较调整 p 值。
6年
与 FMT 前、FMT 后 1 周和 FMT 后 12 周的受体粪便相比,使用鸟枪法 DNA 宏基因组测量粪便微生物移植对健康供体粪便中微生物功能的影响。
大体时间:6年
粪便 DNA 样本将进行鸟枪法 DNA 宏基因组测序。 去除人类序列后,将使用 HUMANN2 软件计算单个细菌蛋白质/酶和途径的每千碱基基因长度读数 (RKP)。 . 将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间与通路和单个蛋白质相关的RPK。 小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。将使用 FMT 前后时间点之间的线性混合模型分析与个体基因和途径相关的 RPK 的线性混合模型分析 [移植前接受者,1 周。 FMT 后接受者,3 个月。 FMT 后接受者]和每个疾病组,使用广义线性混合模型(GLMM)或广义估计方程(GEE),将实际 RPK 作为假设服从负二项分布的结果。
6年
使用细菌元转录组测序测量粪便微生物移植对微生物功能的影响
大体时间:6年
粪便 RNA 样本将进行细菌宏转录组 RNA 测序。 去除人类序列后,将计算单个细菌蛋白质/酶和途径的每千碱基转录本读数 (RKP)。 将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间与通路和单个蛋白质相关的RPK。 小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
6年
使用靶向代谢组学测定法测量粪便微生物移植对微生物功能的影响。
大体时间:6年
粪便样本将经过提取,使用气相色谱-质谱法对短链脂肪酸(微克/克粪便)进行靶向代谢组学分析,并使用液相色谱-质谱法对胆汁酸(微克/克粪便)进行靶向代谢组学分析。 将使用线性混合模型分别比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的短链脂肪酸和胆汁酸代谢物。 小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
6年
确定 FMT 是否会导致受体粪便钙卫蛋白水平发生统计学上的显着变化
大体时间:6年
粪便钙卫蛋白(微克/克粪便)水平将在 FMT 前、1 周和 FMT 后 12 周的基线时在接受者中测量。 将使用线性混合模型来比较每个时间点(FMT)和每个疾病组(Group)之间的粪便钙卫蛋白水平。 小于 0.05 的 P 值被认为具有统计学意义。
6年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Ellen Li, MD, PhD、Stony Brook University

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2017年6月16日

初级完成 (实际的)

2022年2月15日

研究完成 (实际的)

2022年2月15日

研究注册日期

首次提交

2017年7月24日

首先提交符合 QC 标准的

2017年8月28日

首次发布 (实际的)

2017年8月30日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2022年2月21日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2022年2月18日

最后验证

2022年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • 973349

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

IPD 计划说明

没有计划共享 IPD

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

是的

研究美国 FDA 监管的设备产品

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