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クローン病患者における糞便微生物移植

2022年2月18日 更新者:Ellen Li、Stony Brook University
糞便微生物叢移植は、治験中の新薬治療として適格なクローン病患者に提供されます

調査の概要

状態

完了

詳細な説明

この研究では、次の仮説を検証します。

  1. 糞便微生物叢の移植は、安全で許容可能な手順です。
  2. 糞便移植後の糞便レシピエントの糞便微生物の多様性、組成および機能は、ドナーの糞便に見られるのと同様の微生物の多様性、組成および機能に変化する。

主な目的:

1. クローン病患者における、移植後 12 週間までの糞便微生物叢移植の短期的な安全性と忍容性を判断すること。

副次的な目的:

  1. クローン病患者における糞便微生物叢移植 (FMT) の移植後 1 年までの長期的な安全性と忍容性を判断すること。
  2. クローン病の患者 (レシピエント) から採取した FMT 前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物多様性を比較します。
  3. クローン病患者(レシピエント)からのFMT前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物組成を比較する。
  4. クローン病患者(レシピエント)からのFMT前のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物機能を比較する
  5. クローン病の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエント便サンプルと、健康なドナー便および FMT 前のレシピエント便の微生物多様性を比較します。
  6. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエントの便の微生物組成を、クローン病の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエントの便サンプルと比較します。
  7. クローン病の患者 (レシピエント) から採取した移植後 1 週間のレシピエント便サンプルと、健康なドナー便および FMT 前のレシピエント便の微生物機能を比較します。
  8. クローン病の患者 (レシピエント) から採取した 12 週間後の移植レシピエントの便サンプルと、健康なドナーの便および FMT 前のレシピエントの便における微生物の多様性を比較します。
  9. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエントの便中の微生物組成を、クローン病の患者 (レシピエント) から収集した移植後 12 週間のレシピエントの便サンプルと比較します。
  10. 健康なドナーの便と FMT 前のレシピエントの便の微生物機能を、クローン病の患者 (レシピエント) から採取した移植後 12 週間のレシピエントの便サンプルと比較します。
  11. 糞便カルプロテクチンレベルは、FMTが統計的に有意な変化を引き起こすかどうかを決定するために、FMT前のベースライン、FMTの1週間後および12週間後にレシピエントにおいて測定される。

研究の種類

介入

入学 (実際)

9

段階

  • 初期フェーズ 1

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

    • New York
      • Stony Brook、New York、アメリカ、11794
        • Stony Brook University Hospital

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

7年歳以上 (子、大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

受講資格のある性別

全て

説明

クローン病に対する最初の糞便微生物移植の包含基準:

7歳以上のすべての患者は、病歴、身体診察、臨床検査/放射線学的研究、および胃腸の組織学に基づいて、以下の基準の1つ以上を備えた、主な消化器専門医によってクローン病の診断が確立されています。

  1. -少なくとも1か月間ステロイド療法で治療されている
  2. -少なくとも1か月間免疫調節療法で治療されている
  3. 生物学的療法で少なくとも 1 か月間治療を受けている

すべての患者または 18 歳未満の患者の法的保護者は、同意を与える必要があります。 同意書は、過去の研究に基づいて糞便微生物叢移植が安全であるように見えますが、認識されていない感染性病原体または物質の伝染の理論的リスクが存在し、予期しない病気につながる可能性があることを概説します. 7歳以上18歳未満のすべての患者は同意する必要があります

除外基準:

  1. 7歳未満の患者
  2. -今後12週間以内に腹部手術が予定されています
  3. 過去 3 か月以内に大規模な腹部手術
  4. 妊娠(施術当日の尿検査で確認します)
  5. 貧血: ヘモグロビン < 6 g/dL,
  6. 好中球減少症:絶対好中球数<1500上記の基準の両方が、手順の1か月前にスクリーニングテストまたは血液検査レポートによってチェックされます
  7. 移植片対宿主病の既知の診断
  8. 腹腔内または肛門周囲の膿瘍の存在。
  9. 腸皮膚瘻の存在
  10. 重度の腸狭窄および/または腸閉塞の存在
  11. -過去2か月以内の治験薬の投与
  12. -提案された移植日から2週間以内のTNF-α拮抗薬の使用
  13. 過去4週間(28日)以内の菌血症
  14. -29を超える小児クローン病活動指数(PCDAI)値によって決定される重度のクローン病。
  15. 食物に対する重度の以前のアレルギー反応のある個人;
  16. 熱性疾患、非代償性肝硬変、過去 150 日以内の HIV/AIDS BMT、悪性腫瘍、またはその他の重度の免疫不全を含むが必ずしもこれらに限定されない併発疾患を有する個人。
  17. 内視鏡検査または鎮静処置の合併症のリスクが高い個人 (例: ASA 分類 IV 以上)。
  18. 以前のFMT

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

  • 主な目的:処理
  • 割り当て:なし
  • 介入モデル:単一グループの割り当て
  • マスキング:なし(オープンラベル)

武器と介入

参加者グループ / アーム
介入・治療
実験的:糞便微生物移植
糞便微生物移植は、研究に参加する資格のある患者に提供されます。
糞便微生物移植は、適格なクローン病患者に提供されます
他の名前:
  • FMT

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
CTCAE v4.0 によって評価された、治療に関連した有害事象のある参加者の数。
時間枠:5年
FMT後1年以内にグレード2を超える治療関連の有害事象が発生した参加者の数が報告されます。
5年

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物多様性に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠:6年間
糞便 DNA サンプルは、V3-V4 16S rRNA シーケンスを受けます。 操作上の分類単位 (OTU) は、同一の分類学的割り当てを持つ配列をクラスター化することによって生成されます。 アルファ多様性指数 (例: Chao1、Shannon complex H、Shannon Evenness H/Hmax) は、Explicet を使用して 1000 回の反復リサンプリングを通じて推測されて計算されます。 ベータ多様性 (Bray-Curtis 距離と Jaccard 距離) は、門の R ビーガン パッケージのアドニス関数を使用して、対となるドナーと比較して、受信者の Pre-FMT、FMT の 1 週間後、FMT の 12 週間後に計算されます。家族と属のレベル。 線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間でアルファ多様性 (ShannonH) とベータ多様性 (Bray-Curtis および Jaccard 距離) を比較します。 0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
6年間
FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便の微生物組成に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠:6年間
糞便 DNA サンプルは、V3-V4 16S rRNA シーケンスを受けます。 . 操作上の分類単位 (OTU) は、同一の分類学的割り当てを持つ配列をクラスター化することによって生成されます。 属レベルでの個々の OTU の線形混合モデル分析は、ドナーとレシピエントの FMT 前のサンプルで平均相対存在量が 0.001% 未満の OTU を除外した後、105 個の OTU で実施されます。サンプルのカウントはゼロでした。 FMTの前後の時点で各OTUの相対的存在量を比較するには[移植前のレシピエント、1週間。 FMT 後の受信者、3 か月。 ポスト FMT 受信者] および各疾患グループ、一般化線形混合モデル (GLMM) または一般化推定方程式 (GEE) は、負の二項分布に従うと仮定された結果として各 OTU の実際のカウントを取得することによって使用されます。 p 値は、ボンフェローニ補正またはベンジャミン-ホッホベルグ法 (FDR < 0.05) による多重比較用に調整されます。
6年間
FMT前、FMT後1週間、FMT後12週間のレシピエント便と比較して、健康なドナー便のショットガンDNAメタゲノムを使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠:6年間
糞便 DNA サンプルは、ショットガン DNA メタゲノミクス シーケンシングを受けます。 ヒト配列を除去した後、個々の細菌タンパク質/酵素および経路について、HUMANN2 ソフトウェアを使用してキロベース遺伝子長あたりの読み取り数 (RKP) を計算します。 . 線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で経路および個々のタンパク質に関連する RPK を比較します。 0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。個々の遺伝子および経路に関連する RPK の線形混合モデル分析は、FMT の前後の時点間で線形混合モデルを使用して分析されます [移植前のレシピエント、1 週間。 FMT 後の受信者、3 か月。 ポスト FMT 受信者] および各疾患グループ、一般化線形混合モデル (GLMM) または一般化推定方程式 (GEE) は、負の二項分布に従うと想定される結果として実際の RPK を取ることによって使用されました。
6年間
細菌のメタトランスクリプトーム配列決定を使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する
時間枠:6年間
糞便 RNA サンプルは、細菌のメタトランスクリプトーム RNA シーケンシングを受けます。 ヒト配列を除去した後、個々の細菌タンパク質/酵素および経路について、キロベース転写物あたりの読み取り数 (RKP) が計算されます。 線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で経路および個々のタンパク質に関連する RPK を比較します。 0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
6年間
標的メタボロミクスアッセイを使用して、微生物機能に対する糞便微生物移植の効果を測定する。
時間枠:6年間
糞便サンプルは、ガスクロマトグラフィー質量分析法を使用した短鎖脂肪酸 (マイクログラム/グラム便) および液体クロマトグラフィー質量分析法を使用した胆汁酸 (マイクログラム/グラム便) のターゲットメタボロミクス分析のために抽出されます。 線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間でそれぞれ短鎖脂肪酸および胆汁酸代謝物を比較します。 0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
6年間
FMT がレシピエントの糞便カルプロテクチン レベルに統計的に有意な変化を引き起こすかどうかを判断する
時間枠:6年間
糞便カルプロテクチン(マイクログラム/グラム便)レベルは、FMT前のベースライン、FMT後1週間、および12週間でレシピエントと同様に測定されます。 線形混合モデルを使用して、各時点 (FMT) と各疾患グループ (グループ) の間で糞便カルプロテクチン レベルを比較します。 0.05 未満の P 値は、統計的に有意であると見なされました。
6年間

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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捜査官

  • 主任研究者:Ellen Li, MD, PhD、Stony Brook University

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2017年6月16日

一次修了 (実際)

2022年2月15日

研究の完了 (実際)

2022年2月15日

試験登録日

最初に提出

2017年7月24日

QC基準を満たした最初の提出物

2017年8月28日

最初の投稿 (実際)

2017年8月30日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2022年2月21日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2022年2月18日

最終確認日

2022年2月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • 973349

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

IPD プランの説明

IPDを共有する予定はありません

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

はい

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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