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Transplantation microbienne fécale chez les patients atteints de la maladie de Crohn

18 février 2022 mis à jour par: Ellen Li, Stony Brook University
La transplantation de microbiote fécal sera proposée aux patients éligibles atteints de la maladie de Crohn en tant que nouveau traitement médicamenteux expérimental

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

L'hypothèse suivante sera testée dans cette étude :

  1. La transplantation de microbiote fécal est une procédure sûre et tolérable.
  2. La diversité, la composition et la fonction microbiennes fécales chez les receveurs de selles après la transplantation fécale se transformeront en une diversité, une composition et une fonctionnalité microbiennes similaires à celles trouvées dans les selles du donneur.

Objectifs principaux:

1. Déterminer l'innocuité et la tolérabilité à court terme de la greffe de microbiote fécal jusqu'à 12 semaines après la greffe chez les patients atteints de la maladie de Crohn.

Objectifs secondaires :

  1. Déterminer l'innocuité et la tolérabilité à long terme de la greffe de microbiote fécal (FMT) jusqu'à un an après la greffe chez les patients atteints de la maladie de Crohn.
  2. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT recueillies auprès de patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  3. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT de patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  4. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles de receveurs pré-FMT de patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn
  5. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs post-transplantation d'une semaine prélevés chez des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  6. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains et des selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs post-transplantation d'une semaine prélevés chez des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  7. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs post-transplantation d'une semaine prélevés chez des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  8. Comparer la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  9. Comparer la composition microbienne des selles de donneurs sains et des selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  10. Comparer la fonction microbienne dans les selles de donneurs sains et les selles de receveurs pré-FMT avec des échantillons de selles de receveurs 12 semaines après la greffe prélevés sur des patients (receveurs) atteints de la maladie de Crohn.
  11. Les niveaux de calprotectine dans les selles seront mesurés chez le receveur au départ avant la FMT, 1 semaine et 12 semaines après la FMT pour déterminer si la FMT provoque un changement statistiquement significatif.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

9

Phase

  • Première phase 1

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • États-Unis
    • New York
      • Stony Brook, New York, États-Unis, 11794
        • Stony Brook University Hospital

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

7 ans et plus (Enfant, Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

La description

Critères d'inclusion pour la greffe microbienne fécale initiale pour la maladie de Crohn :

Tous les patients âgés de ≥ 7 ans avec un diagnostic établi de maladie de Crohn établi par un gastro-entérologue principal sur la base des antécédents, de l'examen physique, des études de laboratoire/radiologiques et de l'histologie gastro-intestinale, avec un ou plusieurs des critères suivants :

  1. a été traité par corticothérapie pendant au moins un mois
  2. a été traité par thérapie immunomodulatrice pendant au moins un mois
  3. a été traité par thérapie biologique pendant au moins un mois

Tous les patients ou tuteurs légaux de patients de moins de 18 ans devront donner leur consentement. Le formulaire de consentement indiquera que bien que la transplantation de microbiote fécal semble sûre sur la base d'études antérieures, un risque théorique de transmission d'un agent ou d'une substance infectieux non reconnu existe et pourrait entraîner une maladie inattendue. Tous les patients âgés de ≥7 et <18 ans devront donner leur consentement

Critère d'exclusion:

  1. Patients de moins de 7 ans
  2. Chirurgie abdominale prévue dans les 12 prochaines semaines
  3. Chirurgie abdominale majeure au cours des 3 derniers mois
  4. Grossesse (cela sera vérifié par un test d'urine le jour de la procédure)
  5. Anémie : Hémoglobine < 6 g/dL,
  6. Neutropénie : Nombre absolu de neutrophiles < 1 500 Les deux critères ci-dessus seront vérifiés via un test de dépistage ou des rapports d'analyse de sang dans le mois précédant la procédure.
  7. Un diagnostic connu de maladie du greffon contre l'hôte
  8. Présence d'un abcès intra-abdominal ou périanal.
  9. Présence de fistule cutanée intestinale
  10. Présence d'un rétrécissement intestinal sévère et/ou d'une obstruction intestinale
  11. Administration de tout médicament expérimental au cours des 2 derniers mois
  12. Utilisation d'un antagoniste du TNF-α dans les 2 semaines suivant la date proposée de transplantation
  13. Bactériémie au cours des 4 dernières semaines (28 jours)
  14. Maladie de Crohn sévère, déterminée par une valeur de l'indice d'activité de la maladie de Crohn pédiatrique (PCDAI) supérieure à 29.
  15. Les personnes ayant une réaction allergique antérieure grave aux aliments ;
  16. Personnes atteintes d'une maladie intercurrente, y compris, mais sans s'y limiter : maladie fébrile, cirrhose du foie décompensée, VIH/SIDA BMT au cours des 150 derniers jours, tumeur maligne ou autre immunodéficience grave.
  17. Personnes à risque accru de complications de l'endoscopie ou de la sédation procédurale (par exemple, classification ASA IV et supérieure).
  18. FMT précédent

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Traitement
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: Transplantation microbienne fécale
La transplantation microbienne fécale sera proposée aux patients éligibles pour faire partie de l'étude.
Biologique: Transplantation microbienne fécale
La transplantation microbienne fécale via sera offerte aux patients éligibles de Crohn
Autres noms:
  • FMT

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Nombre de participants présentant des événements indésirables liés au traitement, évalués par CTCAE v4.0.
Délai: 5 années
Le nombre de participants présentant des événements indésirables liés au traitement de grade supérieur à 2 dans l'année suivant la FMT sera signalé.
5 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la diversité microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 6 ans
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage d'ARNr V3-V4 16S. Les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) seront produites en regroupant des séquences avec des affectations taxonomiques identiques. Indices de diversité alpha (par ex. Chao1, la complexité de Shannon H, la régularité de Shannon H/Hmax) seront calculées et déduites à travers 1000 rééchantillonnages répétés à l'aide d'Explicet. La diversité bêta (distances Bray-Curtis et Jaccard) sera calculée pour le receveur pré-FMT, 1 semaine post-FMT et 12 semaines post-FMT par rapport à leur donneur paré en utilisant la fonction adonis dans le paquet végétalien R au phyla, niveau de la famille et du genre. Un modèle linéaire mixte sera utilisé pour comparer la diversité alpha (ShannonH) et la diversité bêta (distance Bray-Curtis et Jaccard) entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
6 ans
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la composition microbienne dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 6 ans
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage d'ARNr V3-V4 16S. . Les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) seront produites en regroupant des séquences avec des affectations taxonomiques identiques. Des analyses de modèles mixtes linéaires sur des OTU individuelles au niveau du genre seront menées sur 105 OTU après avoir éliminé les OTU avec une abondance relative moyenne < 0,001 % dans les échantillons donneurs et receveurs pré-FMT, et après avoir rejeté les OTU où plus de 75 % des les échantillons avaient un comptage nul. Pour comparer l'abondance relative de chaque OTU entre les points de temps avant et après FMT [receveur pré-transplantation, 1-wk. receveur post-FMT, 3 mois. receveur post-FMT] et chaque groupe de maladies, un modèle mixte linéaire généralisé (GLMM) ou une équation d'estimation généralisée (GEE) sera utilisé en prenant le nombre réel de chaque OTU comme les résultats supposés suivre une distribution binomiale négative. Les p-values ​​seront ajustées pour les comparaisons multiples par la correction de Bonferroni ou par la méthode de Benjamin-Hochberg (FDR < 0,05).
6 ans
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide de l'ADN métagénomique de fusil de chasse dans les selles de donneurs sains par rapport aux selles des receveurs pré-FMT, 1 semaine après FMT et 12 semaines après FMT.
Délai: 6 ans
Les échantillons d'ADN fécal subiront un séquençage métagénomique de l'ADN shotgun. Après avoir retiré les séquences humaines, les lectures par longueur de gène kilobase (RKP) seront calculées à l'aide du logiciel HUMANN2 pour les protéines/enzymes et voies bactériennes individuelles. . Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les RPK associées aux voies et aux protéines individuelles entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs P inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives. Les analyses de modèles mixtes linéaires sur le RPK associé à des gènes et voies individuels seront analysées à l'aide de modèles mixtes linéaires entre les points de temps avant et après FMT [receveur pré-transplantation, 1 semaine. receveur post-FMT, 3 mois. receveur post-FMT] et chaque groupe de maladies, un modèle mixte linéaire généralisé (GLMM) ou une équation d'estimation généralisée (GEE) ont été utilisés en prenant le RPK réel comme les résultats qui seront supposés suivre une distribution binomiale négative.
6 ans
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide du séquençage métatranscriptomique bactérien
Délai: 6 ans
Des échantillons d'ARN fécaux subiront un séquençage d'ARN métatranscriptomique bactérien. Après avoir retiré les séquences humaines, le transcrit de lectures par kilobase (RKP) sera calculé pour les protéines/enzymes et voies bactériennes individuelles. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les RPK associées aux voies et aux protéines individuelles entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
6 ans
Mesurer l'effet de la transplantation microbienne fécale sur la fonction microbienne à l'aide d'essais métabolomiques ciblés.
Délai: 6 ans
Des échantillons fécaux subiront une extraction pour une analyse métabolomique ciblée des acides gras à chaîne courte (microgrammes/gramme de selles) par chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse, et des acides biliaires (microgramme/gramme de selles) par chromatographie liquide-spectrométrie de masse. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer respectivement les métabolites des acides gras à chaîne courte et des acides biliaires entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
6 ans
Déterminer si la FMT entraîne un changement statistiquement significatif des niveaux de calprotectine fécale du receveur
Délai: 6 ans
Les taux de calprotectine fécale (microgramme/gramme de selles) seront mesurés comme chez le receveur au départ avant la FMT, 1 semaine et 12 semaines après la FMT. Un modèle mixte linéaire sera utilisé pour comparer les niveaux de calprotectine fécale entre chaque point temporel (FMT) et chaque groupe de maladies (Groupe). Les valeurs de p inférieures à 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives.
6 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Stony Brook University

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Ellen Li, MD, PhD, Stony Brook University

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

16 juin 2017

Achèvement primaire (Réel)

15 février 2022

Achèvement de l'étude (Réel)

15 février 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

24 juillet 2017

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

28 août 2017

Première publication (Réel)

30 août 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

21 février 2022

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

18 février 2022

Dernière vérification

1 février 2022

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 973349

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Description du régime IPD

Pas de plans pour partager IPD

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Oui

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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