美国空军通过外显子组测序实现个性化医疗 (MilSeq)
2024年9月6日 更新者：Robert C. Green, MD, MPH、Brigham and Women's Hospital
MilSeq 项目：通过美国空军的外显子组测序实现个性化医疗
MilSeq 项目是一项针对美国空军全外显子组测序 (WES) 的非随机、前瞻性试点研究。
本研究旨在探讨WES在军队卫生系统临床医疗中的应用。
研究概览
详细说明
这项工作的目的是调查：(a) 军事医疗保健提供者 (HCP) 在接受基因组教育引物之前和之后以及在披露全外显子组测序 (WES) 结果之后的基因组知识，以开始评估军队的基因组教育需求医护人员； (b) 现役飞行员对基因组测序 (GS) 的知识和看法； (c) 现役飞行员选择参与或不参与涉及 GS 的研究的原因； (d) WES 研究参与者，包括 HCP 和排序的现役飞行员（患者参与者）如何响应和使用 WES 结果； (e) 收集与军队中 WES 临床整合相关的医疗、行为和医疗保健利用结果； (f) WES 结果的返回和与电子病历 (EMR) 的整合如何影响或不影响对任务准备和任务分配的看法。 鉴于空军在这一领域缺乏先前的研究，而且感兴趣的主题数量众多，该研究的目的主要是探索性的，结果可能是假设生成。
MilSeq 项目将分两个连续阶段进行。 该研究的第一阶段将招募、同意并招募大约 75 名表面健康的现役飞行员，他们在军事初级保健、内科和/或家庭实践环境中接受医疗护理，以进行基线调查。 这项调查将用于探索现役军人对 GS 的看法和偏好，确定现役军人参与 WES 研究的动机和障碍，并评估参与 WES 研究的兴趣。
该研究的第二阶段将招募、同意并招募 75 名表面健康的现役军人，他们在军事初级保健、内科和/或家庭实践环境中接受医疗护理，他们在基线调查中表示有兴趣通过研究接受 WES . WES 将对每个登记的患者参与者进行。 结果将由 HCP 参与者披露，并永久集成到患者参与者的 EMR 中。 第二阶段还将招募 10-20 名军事初级保健、内科和/或家庭医疗 HCP，并同意他们参与该研究。 HCP 将接受基因组学教育入门，并将向空军参与者披露 WES 结果。
将基因组医学纳入军队有许多潜在的好处和挑战，其中一些与更广泛的平民社区相关，但一些是该人群所独有的。 其中一些挑战包括：(a) GS 如何影响或不影响对适合职责的看法； (b) 基因组歧视如何在军事环境中发生或不发生； (c) 如何最好地处理意外发现； (d) 如何将基因组结果实际整合到军事环境中。 在这项试点研究中，将探索这些潜在的机遇和挑战，这将为未来的研究奠定基础，并开始为有关现役军人临床护理的决策提供信息。
研究类型
介入性
注册 (实际的)
105
阶段
- 不适用
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
-
-
Massachusetts
-
Boston、Massachusetts、美国、02115
- Brigham and Women's Hospital
-
-
Texas
-
Houston、Texas、美国、77030
- Baylor College of Medicine
-
San Antonio、Texas、美国、78236
- Joint Base San Antonio Lackland Air Force Base - 59th Medical Wing
-
-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
18年 及以上 (成人、年长者)
接受健康志愿者
是的
描述
患者参与者纳入标准：
- 18岁或以上
- 一名现役空军飞行员
- 流利的英语
- 在圣安东尼奥联合基地 (JBSA) 拉克兰空军基地的 Wilford Hall 门诊外科中心的提供者看过或有资格看过
医疗保健提供者-参与者纳入标准
- 在 JBSA 拉克兰空军基地 Wilford Hall 门诊手术中心工作的现役或国防部文职初级保健、内科或家庭医疗保健提供者（医师、医师助理或执业护士）或住院医师
患者参与者排除标准：
- 不符合上述纳入标准者
- 基线调查中焦虑和痛苦量表得分与临床相关者
- 学员（基础军事训练或技术学校）
- 积极更改工作地点命令或部署命令并预计在 6 个月或更短时间内离开圣安东尼奥的飞行员
- 空军人员预计将在 6 个月或更短时间内退役
医疗保健提供者参与者排除标准：
- 不符合上述纳入标准的提供者
- 主动更改工作地点顺序或部署顺序并预计在 6 个月或更短时间内离开圣安东尼奥的供应商
- 提供者预计将在 6 个月或更短时间内从空军退役
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：卫生服务研究
- 分配：非随机化
- 介入模型：单组作业
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
|---|---|
|
实验性的：健康的现役飞行员队列
全外显子组测序 (WES) 将对 75 名表面健康的现役飞行员（患者参与者）进行，他们在军队初级保健、内科和/或家庭诊所接受医疗护理，他们在基线调查中表示有兴趣接受 WES 。
接受过简短基因组学培训的军事医疗保健提供者会将结果返回给患者参与者，并且 WES 报告将永久集成到他们的电子病历中。
|
在分子医学临床实验室改进修正案 (CLIA) 认证的实验室对 75 名登记人员进行了 125 倍覆盖率的全外显子组测序（即，至少 125 个测序读数覆盖感兴趣的外显子区域内的每个位置）
|
|
无干预：医疗保健提供者群体
在军事初级保健、内科和/或家庭诊所提供医疗服务并招募参与者的医疗保健提供者。
军事医疗保健提供者已经接受了简短的基因组学培训，并将结果返回给患者参与者
|
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
现役飞行员对军用基因组信息做出职业决策的看法
大体时间：基因组测序结果披露后的基线和 6 周（基线后约 43 周）
|
使用一种新的测量方法来评估对使用遗传信息进行军事职业任务分配决策的看法，评分为 1-5，分数越高表示态度越积极。
|
基因组测序结果披露后的基线和 6 周（基线后约 43 周）
|
|
基因组测序结果
大体时间：结果公开（测序完成后1个月内）
|
对全外显子组测序结果的分析确定了具有基因组发现的参与者数量，包括单基因疾病风险、携带者状态和风险等位基因存在。
|
结果公开（测序完成后1个月内）
|
|
现役飞行员报告了与研究结果相关的医疗保健利用情况
大体时间：披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
通过结合医疗记录审查和行为风险因素监测系统 (BRFSS) 的新颖和适应措施，评估了参与者的医疗保健利用率。
将调查自我报告数据与医疗记录审查中指示的服务和程序进行比较。
|
披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
|
军事医疗保健提供者的基因组素养
大体时间：基线（前和后）和随访（基线后约 53 周进行随访）
|
军事医疗保健提供者参与者的基因组素养采用改编自 ClinSeq 研究（Kaphingst K.A. 等人，2012）的 14 项测量方法进行测量，该测量在基线、教育课程之前（之前）和之后（之后）以及跟随时进行接近研究结束时。
项目被标记为正确 (1) 或错误 (0)，并在 0 到 14 的总量表范围内求和，分数越高表明基因组素养越高。
|
基线（前和后）和随访（基线后约 53 周进行随访）
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
现役飞行员对基因组测序的态度和感知效用
大体时间：基线和披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
适应性措施评估了参与者对遗传信息的态度、医生和军方对遗传信息使用的信任度。 （霍尔等人，2006 年）。 将分数相加，在 4-20 的范围内得分越高代表信任度越高。 基线和披露后 6 周的一项新调查项目要求参与者以 1-10 的等级对全基因组测序结果在管理健康方面的有用性进行评分。 |
基线和披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
|
现役飞行员的健康认知
大体时间：基线和披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
使用对健康状况的主观看法的有效衡量标准进行评估。
（Latham 2013，DeSalvo 2006）。
响应采用 1 - 5 分制，分数越高表示响应越积极。
|
基线和披露后 6 周（基线后约 43 周）
|
|
军事医疗保健提供者对基因组数据的信心
大体时间：基线（前和后）和随访（基线后约 53 周进行随访）
|
通过为 Multiplex 计划开发的量表进行评估，以衡量提供者基因组信心（Gray SW 等人，2014 年）。
分数按 5-20 分制计算，分数越高，表明对军事医疗保健提供者-参与者理解遗传信息的能力更有信心
|
基线（前和后）和随访（基线后约 53 周进行随访）
|
合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Gray SW, Hicks-Courant K, Cronin A, Rollins BJ, Weeks JC. Physicians' attitudes about multiplex tumor genomic testing. J Clin Oncol. 2014 May 1;32(13):1317-23. doi: 10.1200/JCO.2013.52.4298. Epub 2014 Mar 24.
- Collins FS, Green ED, Guttmacher AE, Guyer MS; US National Human Genome Research Institute. A vision for the future of genomics research. Nature. 2003 Apr 24;422(6934):835-47. doi: 10.1038/nature01626. Epub 2003 Apr 14. No abstract available.
- Vassy JL, Lautenbach DM, McLaughlin HM, Kong SW, Christensen KD, Krier J, Kohane IS, Feuerman LZ, Blumenthal-Barby J, Roberts JS, Lehmann LS, Ho CY, Ubel PA, MacRae CA, Seidman CE, Murray MF, McGuire AL, Rehm HL, Green RC; MedSeq Project. The MedSeq Project: a randomized trial of integrating whole genome sequencing into clinical medicine. Trials. 2014 Mar 20;15:85. doi: 10.1186/1745-6215-15-85.
- Vassy JL, McLaughlin HM, MacRae CA, Seidman CE, Lautenbach D, Krier JB, Lane WJ, Kohane IS, Murray MF, McGuire AL, Rehm HL, Green RC. A one-page summary report of genome sequencing for the healthy adult. Public Health Genomics. 2015;18(2):123-9. doi: 10.1159/000370102. Epub 2015 Jan 21. Erratum In: Public Health Genomics. 2015 Apr;18(3):191. McLaughlin, Heather L [corrected to McLaughlin, Heather M].
- Christensen KD, Vassy JL, Jamal L, Lehmann LS, Slashinski MJ, Perry DL, Robinson JO, Blumenthal-Barby J, Feuerman LZ, Murray MF, Green RC, McGuire AL; MedSeq Project Team. Are physicians prepared for whole genome sequencing? a qualitative analysis. Clin Genet. 2016 Feb;89(2):228-34. doi: 10.1111/cge.12626. Epub 2015 Jul 7.
- Vassy JL, Christensen KD, Slashinski MJ, Lautenbach DM, Raghavan S, Robinson JO, Blumenthal-Barby J, Feuerman LZ, Lehmann LS, Murray MF, Green RC, McGuire AL. 'Someday it will be the norm': physician perspectives on the utility of genome sequencing for patient care in the MedSeq Project. Per Med. 2015;12(1):23-32. doi: 10.2217/pme.14.68.
- Kaphingst KA, Facio FM, Cheng MR, Brooks S, Eidem H, Linn A, Biesecker BB, Biesecker LG. Effects of informed consent for individual genome sequencing on relevant knowledge. Clin Genet. 2012 Nov;82(5):408-15. doi: 10.1111/j.1399-0004.2012.01909.x. Epub 2012 Aug 7.
- Berg JS, Agrawal PB, Bailey DB Jr, Beggs AH, Brenner SE, Brower AM, Cakici JA, Ceyhan-Birsoy O, Chan K, Chen F, Currier RJ, Dukhovny D, Green RC, Harris-Wai J, Holm IA, Iglesias B, Joseph G, Kingsmore SF, Koenig BA, Kwok PY, Lantos J, Leeder SJ, Lewis MA, McGuire AL, Milko LV, Mooney SD, Parad RB, Pereira S, Petrikin J, Powell BC, Powell CM, Puck JM, Rehm HL, Risch N, Roche M, Shieh JT, Veeraraghavan N, Watson MS, Willig L, Yu TW, Urv T, Wise AL. Newborn Sequencing in Genomic Medicine and Public Health. Pediatrics. 2017 Feb;139(2):e20162252. doi: 10.1542/peds.2016-2252. Epub 2017 Jan 17.
- Bowling BV, Acra EE, Wang L, Myers MF, Dean GE, Markle GC, Moskalik CL, Huether CA. Development and evaluation of a genetics literacy assessment instrument for undergraduates. Genetics. 2008 Jan;178(1):15-22. doi: 10.1534/genetics.107.079533.
- Green RC, Lautenbach D, McGuire AL. GINA, genetic discrimination, and genomic medicine. N Engl J Med. 2015 Jan 29;372(5):397-9. doi: 10.1056/NEJMp1404776. No abstract available.
- McMorrow D. The $100 genome: implications for the DoD. Technical Report. McLean, Virginia: The MITRE Corporation; 2010.
- De Castro M, Biesecker LG, Turner C, Brenner R, Witkop C, Mehlman M, Bradburne C, Green RC. Genomic medicine in the military. NPJ Genom Med. 2016 Jan 13;1:15008. doi: 10.1038/npjgenmed.2015.8. eCollection 2016.
- Collins FS, Guttmacher AE. Genetics moves into the medical mainstream. JAMA. 2001 Nov 14;286(18):2322-4. doi: 10.1001/jama.286.18.2322. No abstract available.
- McCarthy JJ, McLeod HL, Ginsburg GS. Genomic medicine: a decade of successes, challenges, and opportunities. Sci Transl Med. 2013 Jun 12;5(189):189sr4. doi: 10.1126/scitranslmed.3005785.
- Green RC, Rehm HL, Kohane IS. Clinical genome sequencing. In: Ginsburg GS, Willard HF, eds. Genomic and Personalized Medicine. 2nd ed. San Diego: Academic Press; 2013:102-22.
- Johnston JJ, Lewis KL, Ng D, Singh LN, Wynter J, Brewer C, Brooks BP, Brownell I, Candotti F, Gonsalves SG, Hart SP, Kong HH, Rother KI, Sokolic R, Solomon BD, Zein WM, Cooper DN, Stenson PD, Mullikin JC, Biesecker LG. Individualized iterative phenotyping for genome-wide analysis of loss-of-function mutations. Am J Hum Genet. 2015 Jun 4;96(6):913-25. doi: 10.1016/j.ajhg.2015.04.013.
- Robinson JO, Carroll TM, Feuerman LZ, Perry DL, Hoffman-Andrews L, Walsh RC, Christensen KD, Green RC, McGuire AL; MedSeq Project Team. Participants and Study Decliners' Perspectives About the Risks of Participating in a Clinical Trial of Whole Genome Sequencing. J Empir Res Hum Res Ethics. 2016 Feb;11(1):21-30. doi: 10.1177/1556264615624078. Epub 2016 Feb 28.
- Krier J, McLaughlin HM, Lane WJ, et al. The return of pharmacogenomic variants in the MedSeq Project: reporting approach and physician response. Annual Meeting of the American Society of Human Genetics. Boston, MA2013
- Lane WJ, Westhoff CM, Uy JM, Aguad M, Smeland-Wagman R, Kaufman RM, Rehm HL, Green RC, Silberstein LE; MedSeq Project. Comprehensive red blood cell and platelet antigen prediction from whole genome sequencing: proof of principle. Transfusion. 2016 Mar;56(3):743-54. doi: 10.1111/trf.13416. Epub 2015 Dec 3.
- Giovanni MA, Krier J, Vassy JL, Lautenbach DM, Green RC, Murray MF. A brief curriculum for physician orientation to clinical whole genome sequencing. American Society of Human Genetics Annual Meeting. Boston, MA2013.
- Krier JB, Blout CB, D L, et al. Communication and management of genomic sequencing results by non-geneticist physicians. American Society of Human Genetics; 2015; Baltimore, MD.
- Green RC, Goddard KAB, Jarvik GP, Amendola LM, Appelbaum PS, Berg JS, Bernhardt BA, Biesecker LG, Biswas S, Blout CL, Bowling KM, Brothers KB, Burke W, Caga-Anan CF, Chinnaiyan AM, Chung WK, Clayton EW, Cooper GM, East K, Evans JP, Fullerton SM, Garraway LA, Garrett JR, Gray SW, Henderson GE, Hindorff LA, Holm IA, Lewis MH, Hutter CM, Janne PA, Joffe S, Kaufman D, Knoppers BM, Koenig BA, Krantz ID, Manolio TA, McCullough L, McEwen J, McGuire A, Muzny D, Myers RM, Nickerson DA, Ou J, Parsons DW, Petersen GM, Plon SE, Rehm HL, Roberts JS, Robinson D, Salama JS, Scollon S, Sharp RR, Shirts B, Spinner NB, Tabor HK, Tarczy-Hornoch P, Veenstra DL, Wagle N, Weck K, Wilfond BS, Wilhelmsen K, Wolf SM, Wynn J, Yu JH; CSER Consortium. Clinical Sequencing Exploratory Research Consortium: Accelerating Evidence-Based Practice of Genomic Medicine. Am J Hum Genet. 2016 Jun 2;98(6):1051-1066. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.04.011. Epub 2016 May 12. Erratum In: Am J Hum Genet. 2016 Jul 7;99(1):246. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.06.002.
- Selim AJ, Rogers W, Qian SX, Brazier J, Kazis LE. A preference-based measure of health: the VR-6D derived from the veterans RAND 12-Item Health Survey. Qual Life Res. 2011 Oct;20(8):1337-47. doi: 10.1007/s11136-011-9866-y. Epub 2011 Feb 19.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2017年8月23日
初级完成 (实际的)
2019年6月22日
研究完成 (实际的)
2020年1月11日
研究注册日期
首次提交
2017年8月31日
首先提交符合 QC 标准的
2017年9月6日
首次发布 (实际的)
2017年9月8日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2024年10月2日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2024年9月6日
最后验证
2024年9月1日
更多信息
此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索，没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求，请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改，我们的网站上也会自动更新.
全外显子组测序的临床试验
-
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli...尚未招聘乳腺癌 | 卵巢癌 | 林奇综合症 | 肠息肉病