Mikrobiom sputa, moči a stolice u zdravých osob a pacientů s chronickou obstrukční plicní nemocí (CHOPN) (COPD)
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Korejská republika, 05505
- Nábor
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Kontakt:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Telefonní číslo: +82-2-3010-3990
- E-mail: iseiwon@gmail.com
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
skupina CHOPN
- Stejné jako výše
Zdraví kuřáci
- Účastníci s historií kouření
- Účastníci s normálními výsledky spirometrie
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti s kuřáckou anamnézou alespoň 10 balení za rok
- Pacienti s přetrvávajícím omezením průtoku vzduchu, které nebylo plně reverzibilní (např. po bronchodilatačním usilovném výdechovém objemu za 1 sekundu/usilovaná vitální kapacita (FEV1/FVC) <0,7)
Kritéria vyloučení:
- Pacienti se souběžným onemocněním, které by interferovalo s výsledky studie (např. malignita, městnavé srdeční selhání, cerebrovaskulární poruchy, chronické selhání ledvin, diabetes se závažnými komplikacemi nebo nekontrolovaná hypertenze)
- Pacienti s respiračním onemocněním jiným než obstrukční plicní onemocnění (např. předchozí plicní resekce, tuberkulózou zničené plíce a bronchiektázie)
- Pacienti s nedávnou (8 týdnů před screeningem) exacerbací nebo jiným respiračním onemocněním
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Jiný
- Časové perspektivy: Průřezový
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Zdravý kuřák
Zdravý kuřák s normální hodnotou spirometrie
|
Ukázky jsou získávány od účastníků.
Není nutný žádný další zásah.
Získané vzorky budou dále analyzovány.
|
|
COPD
Pacienti s kuřáckou anamnézou alespoň 10 balených roků Pacienti s přetrvávajícím omezením průtoku vzduchu, které nebylo plně reverzibilní (např.
po bronchodilatačním usilovném výdechovém objemu za 1 sekundu/usilovaná vitální kapacita (FEV1/FVC) <0,7)
|
Ukázky jsou získávány od účastníků.
Není nutný žádný další zásah.
Získané vzorky budou dále analyzovány.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Alfa diverzita měřená kvantitativní analýzou operační taxonomické jednotky (OTU).
Časové okno: V průměru 1 měsíc
|
DNA je extrahována z každého vzorku od každého pacienta pomocí DNA Isolation Kit.
Univerzální primery 16S se používají pro amplifikaci genů 16S ribozomální ribonukleové kyseliny (rRNA) systémem polymerázové řetězové reakce (PCR).
Po amplifikaci je provedeno sekvenování pomocí databáze GREENGENES, poté byla provedena metagenomická analýza korporací MD Healthcare pomocí softwaru MDx-Pro (Ver.1,
Soul, Jižní Korea).
Taxonomické přiřazení těchto sekvencí se provádí s limitem provozní taxonomické jednotky (OTU) 3 %.
|
V průměru 1 měsíc
|
|
Složení mikrobiomu metagenomickou analýzou
Časové okno: V průměru 1 měsíc
|
Složení mikrobiomu je prezentováno jako sloupcový graf.
|
V průměru 1 měsíc
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Biodiverzita popsaná Shannonovým indexem diverzity a Simpsonovým indexem
Časové okno: V průměru 1 měsíc
|
Shannonův index a Simpsonův index se vypočítávají pomocí metagenomických dat.
|
V průměru 1 měsíc
|
|
Biodiverzita popsaná analýzou hlavních komponent (PCA)
Časové okno: V průměru 1 měsíc
|
PCA se provádí pro všechna čtení genu 16S rRNA seskupená s 97% podobností.
|
V průměru 1 měsíc
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Očekávaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 2018-0980 (Jiný identifikátor: M D Anderson Cancer Center)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .