Das Mikrobiom von Sputum, Urin und Kot bei gesunden Personen und Patienten mit chronisch obstruktiver Lungenerkrankung (COPD). (COPD)
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Songpa
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Seoul, Songpa, Korea, Republik von, 05505
- Rekrutierung
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
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Kontakt:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Telefonnummer: +82-2-3010-3990
- E-Mail: iseiwon@gmail.com
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-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
COPD-Gruppe
- Das gleiche wie oben
Gesunde Raucher
- Teilnehmer mit Rauchergeschichte
- Teilnehmer mit normalen Spirometrieergebnissen
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten mit einer Rauchergeschichte von mindestens 10 Packungsjahren
- Patienten mit anhaltender Einschränkung des Luftstroms, die nicht vollständig reversibel war (z. Post-Bronchodilatator forciertes Exspirationsvolumen in 1 Sekunde/forcierte Vitalkapazität (FEV1/FVC) <0,7)
Ausschlusskriterien:
- Patienten mit gleichzeitig bestehender Erkrankung, die die Studienergebnisse beeinträchtigen würde (z. B. Malignität, dekompensierte Herzinsuffizienz, zerebrovaskuläre Erkrankungen, chronisches Nierenversagen, Diabetes mit schweren Komplikationen oder unkontrollierter Bluthochdruck)
- Patienten mit anderen Atemwegserkrankungen als obstruktiven Lungenerkrankungen (z. B. frühere Lungenresektion, durch Tuberkulose zerstörte Lunge und Bronchiektasen)
- Patienten mit kürzlich aufgetretener Exazerbation (8 Wochen vor dem Screening) oder einer anderen Atemwegserkrankung
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Sonstiges
- Zeitperspektiven: Querschnitt
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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Gesunder Raucher
Gesunder Raucher mit normalem Spirometriewert
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Proben werden von den Teilnehmern erhalten.
Es ist kein weiteres Eingreifen erforderlich.
Erhaltene Proben werden weiter analysiert.
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COPD
Patienten mit einer Raucheranamnese von mindestens 10 Packungsjahren Patienten mit anhaltender Einschränkung des Luftstroms, die nicht vollständig reversibel war (z.
Post-Bronchodilatator forciertes Exspirationsvolumen in 1 Sekunde/forcierte Vitalkapazität (FEV1/FVC) <0,7)
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Proben werden von den Teilnehmern erhalten.
Es ist kein weiteres Eingreifen erforderlich.
Erhaltene Proben werden weiter analysiert.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Alpha-Diversität gemessen durch quantitative Analyse der Operational Taxonomic Unit (OTU).
Zeitfenster: Durchschnittlich 1 Monat
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DNA wird aus jeder Probe von jedem Patienten unter Verwendung eines DNA-Isolierungskits extrahiert.
Die universellen 16S-Primer werden zur Amplifikation von 16S-Genen für ribosomale Ribonukleinsäure (rRNA) mit dem Polymerase-Kettenreaktionssystem (PCR) verwendet.
Nach der Amplifikation wird eine Sequenzierung unter Verwendung der GREENGENES-Datenbank durchgeführt, wonach eine metagenomische Analyse durch die MD Healthcare Corporation unter Verwendung der MDx-Pro-Software (Ver.1,
Seoul, Südkorea).
Die taxonomische Zuordnung dieser Sequenzen erfolgt mit einem Cutoff der operationellen taxonomischen Einheit (OTU) von 3 %.
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Durchschnittlich 1 Monat
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Zusammensetzung des Mikrobioms durch metagenomische Analyse
Zeitfenster: Durchschnittlich 1 Monat
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Die Zusammensetzung des Mikrobioms wird als Balkendiagramm dargestellt.
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Durchschnittlich 1 Monat
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Biodiversität beschrieben durch den Shannon Diversity Index und den Simpson Index
Zeitfenster: Durchschnittlich 1 Monat
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Der Shannon-Index und der Simpson-Index werden anhand metagenomischer Daten berechnet.
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Durchschnittlich 1 Monat
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Biodiversität beschrieben durch Hauptkomponentenanalyse (PCA)
Zeitfenster: Durchschnittlich 1 Monat
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PCA wird für alle 16S-rRNA-Gen-Reads durchgeführt, die bei einer Ähnlichkeit von 97 % gruppiert sind.
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Durchschnittlich 1 Monat
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Voraussichtlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
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- 2018-0980 (Andere Kennung: M D Anderson Cancer Center)
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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