Микробиом мокроты, мочи и кала у здоровых людей и больных хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ) (COPD)
Обзор исследования
Статус
Статус
Условия
Условия
Вмешательство/лечение
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Тип исследования
Тип исследования
Регистрация (Ожидаемый)
Регистрация
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Корея, Республика, 05505
- Рекрутинг
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Контакт:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Номер телефона: +82-2-3010-3990
- Электронная почта: iseiwon@gmail.com
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Группа ХОБЛ
- То же, что и выше
Здоровые курильщики
- Участники с историей курения
- Участники с нормальными результатами спирометрии
Описание
Критерии включения:
- Пациенты с историей курения не менее 10 пачек в год
- Пациенты со стойким ограничением воздушного потока, которое не было полностью обратимым (например, постбронхолитический объем форсированного выдоха за 1 секунду/форсированная жизненная емкость легких (ОФВ1/ФЖЕЛ) <0,7)
Критерий исключения:
- Пациенты с сопутствующими заболеваниями, которые могут повлиять на результаты исследования (например, злокачественные новообразования, застойная сердечная недостаточность, цереброваскулярные нарушения, хроническая почечная недостаточность, диабет с тяжелыми осложнениями или неконтролируемая гипертензия)
- Пациенты с респираторным заболеванием, отличным от обструктивного заболевания легких (например, резекция легкого в анамнезе, пораженное туберкулезом легкое и бронхоэктазы)
- Пациенты с недавним (за 8 недель до скрининга) обострением или другим респираторным заболеванием
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Другой
- Временные перспективы: Поперечный разрез
Количество групп / когорт
Когорты и вмешательства
Группа / когортаГруппа / когорта |
Вмешательство/лечениеВмешательство/лечение |
|---|---|
|
Здоровый курильщик
Здоровый курильщик с нормальным значением спирометрии
|
Образцы получены от участников.
Дальнейшее вмешательство не требуется.
Полученные образцы будут дополнительно проанализированы.
|
|
ХОБЛ
Пациенты с курением в анамнезе не менее 10 пачек в год Пациенты со стойким необратимым ограничением скорости воздушного потока (например,
постбронхолитический объем форсированного выдоха за 1 секунду/форсированная жизненная емкость легких (ОФВ1/ФЖЕЛ) <0,7)
|
Образцы получены от участников.
Дальнейшее вмешательство не требуется.
Полученные образцы будут дополнительно проанализированы.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Альфа-разнообразие, измеренное с помощью количественного анализа операционных таксономических единиц (OTU)
Временное ограничение: В среднем 1 месяц
|
ДНК извлекается из каждого образца каждого пациента с помощью набора для выделения ДНК.
Универсальные праймеры 16S используются для амплификации генов 16S рибосомальной рибонуклеиновой кислоты (рРНК) с помощью системы полимеразной цепной реакции (ПЦР).
После амплификации проводят секвенирование с использованием базы данных GREENGENES, после чего проводят метагеномный анализ корпорацией MD Healthcare с использованием программного обеспечения MDx-Pro (Ver.1,
Сеул, Южная Корея).
Таксономическое отнесение этих последовательностей осуществляется с отсечкой операционной таксономической единицы (OTU) 3%.
|
В среднем 1 месяц
|
|
Состав микробиома по метагеномному анализу
Временное ограничение: В среднем 1 месяц
|
Состав микробиома представлен в виде гистограммы.
|
В среднем 1 месяц
|
Вторичные показатели результатов
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Биоразнообразие, описываемое индексом разнообразия Шеннона и индексом Симпсона.
Временное ограничение: В среднем 1 месяц
|
Индекс Шеннона и индекс Симпсона рассчитываются с использованием метагеномных данных.
|
В среднем 1 месяц
|
|
Биоразнообразие, описанное с помощью анализа основных компонентов (АПК)
Временное ограничение: В среднем 1 месяц
|
PCA выполняется для всех прочтений гена 16S рРНК, сгруппированных при сходстве 97%.
|
В среднем 1 месяц
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Спонсор
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Ожидаемый)
Начало исследования
Первичное завершение (Ожидаемый)
Первичное завершение
Завершение исследования (Ожидаемый)
Завершение исследования
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Первый опубликованный
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее опубликованное обновление
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
Другие идентификационные номера исследования
- 2018-0980 (Другой идентификатор: M D Anderson Cancer Center)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .