Mikrobiomet av sputum, urin och avföring hos friska personer och patienter med kronisk obstruktiv lungsjukdom (KOL) (COPD)
Studieöversikt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Studietyp
Studietyp
Inskrivning (Förväntat)
Inskrivning
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Korea, Republiken av, 05505
- Rekrytering
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Kontakt:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Telefonnummer: +82-2-3010-3990
- E-post: iseiwon@gmail.com
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
KOL-grupp
- Samma som ovan
Friska rökare
- Deltagare med rökhistoria
- Deltagare med normala spirometriresultat
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Patienter med rökhistoria minst 10 pack-år
- Patienter med ihållande luftflödesbegränsning som inte var helt reversibel (t. post-bronkodilator forcerad utandningsvolym på 1 sekund/tvingad vitalkapacitet (FEV1/FVC) <0,7)
Exklusions kriterier:
- Patienter med samexisterande sjukdom som skulle störa studieresultaten (t.ex. malignitet, kronisk hjärtsvikt, cerebrovaskulära störningar, kronisk njursvikt, diabetes med svåra komplikationer eller okontrollerad hypertoni)
- Patienter med andra andningssjukdomar än obstruktiv lungsjukdom (t.ex. tidigare lungresektion, tuberkulosförstörd lunga och bronkiektasi)
- Patienter med nyligen (8 veckor före screening) exacerbation eller annan luftvägssjukdom
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Övrig
- Tidsperspektiv: Tvärsnitt
Antal grupper/kohorter
Kohorter och interventioner
Grupp / KohortGrupp / Kohort |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Frisk rökare
Frisk rökare med normalt spirometrivärde
|
Prover tas från deltagare.
Inget ytterligare ingripande krävs.
Erhållna prover kommer att analyseras ytterligare.
|
|
KOL
Patienter med rökanamnes på minst 10 pack-år Patienter med ihållande luftflödesbegränsning som inte var helt reversibel (t.
post-bronkdilaterande forcerad utandningsvolym på 1 sekund/forcerad vitalkapacitet (FEV1/FVC) <0,7)
|
Prover tas från deltagare.
Inget ytterligare ingripande krävs.
Erhållna prover kommer att analyseras ytterligare.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Alfadiversitet mätt med kvantitativ analys av operationell taxonomic unit (OTU).
Tidsram: I snitt 1 månad
|
DNA extraheras från varje prov från varje patient med hjälp av ett DNA-isoleringskit.
16S universella primers används för amplifiering av 16S ribosomala ribonukleinsyra (rRNA) gener med polymeraskedjereaktion (PCR) system.
Efter förstärkning utförs sekvensering med GREENGENES-databasen, varefter en metagenomisk analys utfördes av MD Healthcare Corporation med MDx-Pro-mjukvara (Ver.1,
Seoul, Sydkorea).
Taxonomisk tilldelning av dessa sekvenser utförs med en operationell taxonomisk enhet (OTU) cutoff på 3%.
|
I snitt 1 månad
|
|
Mikrobiomsammansättning genom metagenomisk analys
Tidsram: I snitt 1 månad
|
Sammansättningen av mikrobiom presenteras som stapeldiagram.
|
I snitt 1 månad
|
Sekundära resultatmått
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Biologisk mångfald beskrivs av Shannon diversity index och Simpson index
Tidsram: I snitt 1 månad
|
Shannon-indexet och Simpson-indexet beräknas med hjälp av metagenomiska data.
|
I snitt 1 månad
|
|
Biologisk mångfald beskrivs av Principal Component Analysis (PCA)
Tidsram: I snitt 1 månad
|
PCA utförs för alla 16S rRNA-genavläsningar klustrade med 97% likhet.
|
I snitt 1 månad
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Sponsor
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Förväntat)
Studiestart
Primärt slutförande (Förväntat)
Primärt slutförande
Avslutad studie (Förväntat)
Avslutad studie
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Första postat
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste uppdatering publicerad
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
Andra studie-ID-nummer
- 2018-0980 (Annan identifierare: M D Anderson Cancer Center)
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .