Mikrobiomet av sputum, urin og avføring hos friske personer og pasienter med kronisk obstruktiv lungesykdom (KOLS) (COPD)
Studieoversikt
Status
Status
Forhold
Forhold
Intervensjon / Behandling
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Studietype
Studietype
Registrering (Forventet)
Registrering
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Korea, Republikken, 05505
- Rekruttering
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Ta kontakt med:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Telefonnummer: +82-2-3010-3990
- E-post: iseiwon@gmail.com
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
KOLS gruppe
- Samme som ovenfor
Friske røykere
- Deltakere med røykehistorie
- Deltakere med normale spirometriresultater
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Pasienter med røykehistorie på minst 10 pakkeår
- Pasienter med vedvarende luftstrømsbegrensning som ikke var fullt reversibel (f. post-bronkodilatator tvungen ekspiratorisk volum på 1 sekund/tvungen vital kapasitet (FEV1/FVC) <0,7)
Ekskluderingskriterier:
- Pasienter med samtidige sykdommer som ville forstyrre studieresultatene (f.eks. malignitet, kongestiv hjertesvikt, cerebrovaskulære lidelser, kronisk nyresvikt, diabetes med alvorlige komplikasjoner eller ukontrollert hypertensjon)
- Pasienter med andre luftveissykdommer enn obstruktiv lungesykdom (f.eks. tidligere pulmonal reseksjon, tuberkuloseødelagt lunge og bronkiektasi)
- Pasienter med nylig (8 uker før screening) eksacerbasjon eller annen luftveissykdom
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Annen
- Tidsperspektiver: Tverrsnitt
Antall grupper / kohorter
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / KohortGruppe / Kohort |
Intervensjon / BehandlingIntervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Sunn røyker
Frisk røyker med normal spirometriverdi
|
Prøver innhentes fra deltakerne.
Ingen ytterligere inngrep er nødvendig.
Innhentede prøver vil bli videre analysert.
|
|
KOLS
Pasienter med røykehistorie på minst 10 pakkeår Pasienter med vedvarende luftstrømsbegrensning som ikke var fullt reversibel (f.
post-bronkodilatator tvungen ekspirasjonsvolum på 1 sekund/tvungen vital kapasitet (FEV1/FVC) <0,7)
|
Prøver innhentes fra deltakerne.
Ingen ytterligere inngrep er nødvendig.
Innhentede prøver vil bli videre analysert.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Alfa-diversitet målt ved kvantitativ analyse av operasjonell taksonomisk enhet (OTU).
Tidsramme: Gjennomsnittlig 1 måned
|
DNA ekstraheres fra hver prøve fra hver pasient ved å bruke et DNA-isolasjonssett.
16S universelle primere brukes til amplifisering av 16S ribosomale ribonukleinsyre (rRNA) gener med polymerasekjedereaksjon (PCR) system.
Etter amplisering utføres sekvensering ved å bruke GREENGENES-databasen, hvoretter en metagenomisk analyse ble utført av MD Healthcare-selskapet ved bruk av MDx-Pro-programvare (Ver.1,
Seoul, Sør-Korea).
Taksonomisk tilordning av disse sekvensene utføres med en operasjonell taksonomisk enhet (OTU) cutoff på 3%.
|
Gjennomsnittlig 1 måned
|
|
Mikrobiomsammensetning ved metagenomisk analyse
Tidsramme: Gjennomsnittlig 1 måned
|
Sammensetningen av mikrobiom presenteres som søylediagram.
|
Gjennomsnittlig 1 måned
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Biologisk mangfold beskrevet av Shannon-diversitetsindeksen og Simpson-indeksen
Tidsramme: Gjennomsnittlig 1 måned
|
Shannon-indeksen og Simpson-indeksen beregnes ved å bruke metagenomiske data.
|
Gjennomsnittlig 1 måned
|
|
Biologisk mangfold beskrevet av Principal Component Analysis (PCA)
Tidsramme: Gjennomsnittlig 1 måned
|
PCA utføres for alle 16S rRNA-genavlesninger samlet med 97 % likhet.
|
Gjennomsnittlig 1 måned
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Sponsor
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Forventet)
Studiestart
Primær fullføring (Forventet)
Primær fullføring
Studiet fullført (Forventet)
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- 2018-0980 (Annen identifikator: M D Anderson Cancer Center)
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .