O Microbioma do Escarro, Urina e Fezes em Pessoas Saudáveis e Pacientes com Doença Pulmonar Obstrutiva Crônica (DPOC) (COPD)
Visão geral do estudo
Status
Status
Condições
Condições
Intervenção / Tratamento
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Tipo de estudo
Tipo de estudo
Inscrição (Antecipado)
Inscrição
Contactos e Locais
Locais de estudo
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Songpa
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Seoul, Songpa, Republica da Coréia, 05505
- Recrutamento
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
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Contato:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Número de telefone: +82-2-3010-3990
- E-mail: iseiwon@gmail.com
-
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Método de amostragem
População do estudo
grupo DPOC
- O mesmo que acima
fumantes saudáveis
- Participantes com histórico de tabagismo
- Participantes com resultados de espirometria normais
Descrição
Critério de inclusão:
- Pacientes com histórico de tabagismo de pelo menos 10 maços/ano
- Pacientes com limitação persistente do fluxo aéreo que não foi totalmente reversível (por exemplo, volume expiratório forçado pós-broncodilatador em 1 segundo/capacidade vital forçada (FEV1/FVC) <0,7)
Critério de exclusão:
- Pacientes com doenças coexistentes que possam interferir nos resultados do estudo (por exemplo, malignidade, insuficiência cardíaca congestiva, distúrbios cerebrovasculares, insuficiência renal crônica, diabetes com complicações graves ou hipertensão não controlada)
- Pacientes com doença respiratória diferente da doença pulmonar obstrutiva (por exemplo, ressecção pulmonar prévia, pulmão destruído por tuberculose e bronquiectasia)
- Pacientes com exacerbação recente (8 semanas antes da triagem) ou outra doença respiratória
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Outro
- Perspectivas de Tempo: Transversal
Número de grupos/coortes
Coortes e Intervenções
Grupo / CoorteGrupo / Coorte |
Intervenção / TratamentoIntervenção / Tratamento |
|---|---|
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Fumante Saudável
Fumante saudável com valor de espirometria normal
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As amostras são obtidas dos participantes.
Nenhuma outra intervenção é necessária.
As amostras obtidas serão posteriormente analisadas.
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DPOC
Doentes com história tabágica de pelo menos 10 maços/ano Doentes com limitação persistente do fluxo aéreo que não foi totalmente reversível (p.
volume expiratório forçado pós-broncodilatador em 1 segundo/capacidade vital forçada (VEF1/CVF) <0,7)
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As amostras são obtidas dos participantes.
Nenhuma outra intervenção é necessária.
As amostras obtidas serão posteriormente analisadas.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Diversidade alfa medida pela análise quantitativa da unidade taxonômica operacional (OTU)
Prazo: Em média 1 mês
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O DNA é extraído de cada amostra de cada paciente usando um kit de isolamento de DNA.
Os primers universais 16S são usados para amplificação dos genes do ácido ribonucléico ribossômico 16S (rRNA) com o sistema de reação em cadeia da polimerase (PCR).
Após a amplificação, o sequenciamento é realizado usando o banco de dados GREENGENES, após o qual uma análise metagenômica foi realizada pela corporação MD Healthcare usando o software MDx-Pro (Ver.1,
Seul, Coreia do Sul).
A atribuição taxonômica dessas sequências é realizada com um corte de unidade taxonômica operacional (OTU) de 3%.
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Em média 1 mês
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Composição do microbioma por análise metagenômica
Prazo: Em média 1 mês
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A composição do microbioma é apresentada como gráfico de barras.
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Em média 1 mês
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Medidas de resultados secundários
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Biodiversidade descrita pelo índice de diversidade de Shannon e pelo índice de Simpson
Prazo: Em média 1 mês
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O índice de Shannon e o índice de Simpson são calculados usando dados metagenômicos.
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Em média 1 mês
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Biodiversidade descrita pela Análise de Componentes Principais (PCA)
Prazo: Em média 1 mês
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O PCA é realizado para todas as leituras do gene 16S rRNA agrupadas em uma similaridade de 97%.
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Em média 1 mês
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Colaboradores e Investigadores
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Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Antecipado)
Início do estudo
Conclusão Primária (Antecipado)
Conclusão Primária
Conclusão do estudo (Antecipado)
Conclusão do estudo
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Primeira postagem
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última Atualização Postada
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Última verificação
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Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
Outros números de identificação do estudo
- 2018-0980 (Outro identificador: M D Anderson Cancer Center)
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